H2AFY

H2AFY
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1U35, 1ZR3, 1ZR5, 2F8N, 2FXK, 3HQH, 3HSV, 3IID, 3IIF, 3IVB, 5IIT
Ідентифікатори
Символи	MACROH2A1, H2A.y, H2A/y, H2AF12M, H2AFJ, MACROH2A1.1, mH2A1, macroH2A1.2, H2A histone family member Y, H2AFY, macroH2A.1 histone
Зовнішні ІД	OMIM: 610054 MGI: 1349392 HomoloGene: 3598 GeneCards: MACROH2A1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein kinase binding • rDNA binding • protein serine/threonine kinase inhibitor activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin binding • double-stranded methylated DNA binding • protein heterodimerization activity • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • core promoter sequence-specific DNA binding • DNA binding • chromatin DNA binding • enzyme binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleosomal DNA binding • promoter-specific chromatin binding Клітинна компонента • екзосома • ESC/E(Z) complex • ядерце • condensed chromosome • хромосома • pericentric heterochromatin • Нуклеосома • клітинне ядро • nuclear chromosome • sex chromatin • Тільце Барра • Хроматин Біологічний процес • negative regulation of histone H3-K4 methylation • regulation of ribosomal DNA heterochromatin assembly • Дозова компенсація • negative regulation of cell cycle G2/M phase transition • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • regulation of cell growth • positive regulation of keratinocyte differentiation • negative regulation of protein serine/threonine kinase activity • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • nucleosome assembly • negative regulation of protein localization to chromosome, telomeric region • negative regulation of gene expression, epigenetic • negative regulation of histone H3-K27 methylation • Епігенетичне успадкування • positive regulation of maintenance of mitotic sister chromatid cohesion • establishment of protein localization to chromatin • negative regulation of transcription of nucleolar large rRNA by RNA polymerase I • regulation of lipid metabolic process • regulation of response to oxidative stress • negative regulation of response to oxidative stress • positive regulation of response to oxidative stress • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9555	26914
Ensembl	ENSG00000113648	ENSMUSG00000015937
UniProt	O75367	Q9QZQ8
RefSeq (мРНК)	NM_001040158 NM_004893 NM_138609 NM_138610	NM_001159513 NM_001159514 NM_001159515 NM_012015
RefSeq (білок)	NP_001035248 NP_004884 NP_613075 NP_613258	NP_001152985 NP_001152986 NP_001152987 NP_036145
Локус (UCSC)	Хр. 5: 135.33 – 135.4 Mb	Хр. 13: 56.22 – 56.28 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

H2AFY (англ. H2A histone family member Y) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 39 617.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSRGGKKKS		TKTSRSAKAG		VIFPVGRMLR		YIKKGHPKYR		IGVGAPVYMA
AVLEYLTAEI		LELAGNAARD		NKKGRVTPRH		ILLAVANDEE		LNQLLKGVTI
ASGGVLPNIH		PELLAKKRGS		KGKLEAIITP		PPAKKAKSPS		QKKPVSKKAG
GKKGARKSKK		KQGEVSKAAS		ADSTTEGTPA		DGFTVLSTKS		LFLGQKLNLI
HSEISNLAGF		EVEAIINPTN		ADIDLKDDLG		NTLEKKGGKE		FVEAVLELRK
KNGPLEVAGA		AVSAGHGLPA		KFVIHCNSPV		WGADKCEELL		EKTVKNCLAL
ADDKKLKSIA		FPSIGSGRNG		FPKQTAAQLI		LKAISSYFVS		TMSSSIKTVY
FVLFDSESIG		IYVQEMAKLD		AN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Costanzi C., Pehrson J.R. (1998). Histone macroH2A1 is concentrated in the inactive X chromosome of female mammals. Nature. 393: 599—601. PMID 9634239 DOI:10.1038/31275
• Kustatscher G., Hothorn M., Pugieux C., Scheffzek K., Ladurner A.G. (2005). Splicing regulates NAD metabolite binding to histone macroH2A. Nat. Struct. Mol. Biol. 12: 624—625. PMID 15965484 DOI:10.1038/nsmb956

Див. також

• Хромосома 5