H2AFY

H2AFY
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1U35, 1ZR3, 1ZR5, 2F8N, 2FXK, 3HQH, 3HSV, 3IID, 3IIF, 3IVB, 5IIT
Ідентифікатори
Символи	MACROH2A1, H2A.y, H2A/y, H2AF12M, H2AFJ, MACROH2A1.1, mH2A1, macroH2A1.2, H2A histone family member Y, H2AFY, macroH2A.1 histone
Зовнішні ІД	OMIM: 610054 MGI: 1349392 HomoloGene: 3598 GeneCards: MACROH2A1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein kinase binding; • rDNA binding; • protein serine/threonine kinase inhibitor activity; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • chromatin binding; • double-stranded methylated DNA binding; • protein heterodimerization activity; • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; • core promoter sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • chromatin DNA binding; • enzyme binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleosomal DNA binding; • promoter-specific chromatin binding;
Клітинна компонента	• екзосома; • ESC/E(Z) complex; • ядерце; • condensed chromosome; • хромосома; • pericentric heterochromatin; • Нуклеосома; • клітинне ядро; • nuclear chromosome; • sex chromatin; • Тільце Барра; • Хроматин;
Біологічний процес	• negative regulation of histone H3-K4 methylation; • regulation of ribosomal DNA heterochromatin assembly; • Дозова компенсація; • negative regulation of cell cycle G2/M phase transition; • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation; • regulation of cell growth; • positive regulation of keratinocyte differentiation; • negative regulation of protein serine/threonine kinase activity; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • nucleosome assembly; • negative regulation of protein localization to chromosome, telomeric region; • negative regulation of gene expression, epigenetic; • negative regulation of histone H3-K27 methylation; • Епігенетичне успадкування; • positive regulation of maintenance of mitotic sister chromatid cohesion; • establishment of protein localization to chromatin; • negative regulation of transcription of nucleolar large rRNA by RNA polymerase I; • regulation of lipid metabolic process; • regulation of response to oxidative stress; • negative regulation of response to oxidative stress; • positive regulation of response to oxidative stress; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	9555
	26914
	ENSG00000113648
	ENSMUSG00000015937
	O75367
	Q9QZQ8
	NM_001040158; NM_004893; NM_138609; NM_138610
	NM_001159513; NM_001159514; NM_001159515; NM_012015
	NP_001035248; NP_004884; NP_613075; NP_613258
	NP_001152985; NP_001152986; NP_001152987; NP_036145
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

H2AFY (англ. H2A histone family member Y) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 39 617^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSRGGKKKS	TKTSRSAKAG	VIFPVGRMLR	YIKKGHPKYR	IGVGAPVYMA
AVLEYLTAEI	LELAGNAARD	NKKGRVTPRH	ILLAVANDEE	LNQLLKGVTI
ASGGVLPNIH	PELLAKKRGS	KGKLEAIITP	PPAKKAKSPS	QKKPVSKKAG
GKKGARKSKK	KQGEVSKAAS	ADSTTEGTPA	DGFTVLSTKS	LFLGQKLNLI
HSEISNLAGF	EVEAIINPTN	ADIDLKDDLG	NTLEKKGGKE	FVEAVLELRK
KNGPLEVAGA	AVSAGHGLPA	KFVIHCNSPV	WGADKCEELL	EKTVKNCLAL
ADDKKLKSIA	FPSIGSGRNG	FPKQTAAQLI	LKAISSYFVS	TMSSSIKTVY
FVLFDSESIG	IYVQEMAKLD	AN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Costanzi C., Pehrson J.R. (1998). Histone macroH2A1 is concentrated in the inactive X chromosome of female mammals. Nature. 393: 599—601. PMID 9634239 DOI:10.1038/31275
Kustatscher G., Hothorn M., Pugieux C., Scheffzek K., Ladurner A.G. (2005). Splicing regulates NAD metabolite binding to histone macroH2A. Nat. Struct. Mol. Biol. 12: 624—625. PMID 15965484 DOI:10.1038/nsmb956

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4740 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 5 вересня 2017. [Архівовано 2015-10-17 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, O75367 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4740 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 5 вересня 2017. [Архівовано 2015-10-17 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, O75367 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]