HERC2

HERC2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KEO, 3KCI, 4L1M
Ідентифікатори
Символи	HERC2, p528, D15F37S1, MRT38, SHEP1, jdf2, HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, LOC107987422
Зовнішні ІД	OMIM: 605837 MGI: 103234 HomoloGene: 3430 GeneCards: HERC2
Онтологія гена Молекулярна функція • guanyl-nucleotide exchange factor activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • SUMO binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • нуклеоплазма • мітохондріальна внутрішня мембрана • Центріоль • цитоскелет • клітинне ядро Біологічний процес • cellular response to DNA damage stimulus • Убіквітин-залежний протеоліз • Сперматогенез • intracellular protein transport • double-strand break repair via nonhomologous end joining • GO:0100026 Репарація ДНК • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of molecular function Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8924	15204
Ensembl	ENSG00000128731 ENSG00000276802 ENSG00000277278	ENSMUSG00000030451
UniProt	O95714	Q4U2R1
RefSeq (мРНК)	NM_004667	NM_010418 NM_001360080
RefSeq (білок)	NP_004658	NP_034548 NP_001347009
Локус (UCSC)	Хр. 15: 28.11 – 28.32 Mb	Хр. 7: 55.7 – 55.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HERC2 (англ. HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 834 амінокислот, а молекулярна маса — 527 228.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPSESFCLAA		QARLDSKWLK		TDIQLAFTRD		GLCGLWNEMV		KDGEIVYTGT
ESTQNGELPP		RKDDSVEPSG		TKKEDLNDKE		KKDEEETPAP		IYRAKSILDS
WVWGKQPDVN		ELKECLSVLV		KEQQALAVQS		ATTTLSALRL		KQRLVILERY
FIALNRTVFQ		ENVKVKWKSS		GISLPPVDKK		SSRPAGKGVE		GLARVGSRAA
LSFAFAFLRR		AWRSGEDADL		CSELLQESLD		ALRALPEASL		FDESTVSSVW
LEVVERATRF		LRSVVTGDVH		GTPATKGPGS		IPLQDQHLAL		AILLELAVQR
GTLSQMLSAI		LLLLQLWDSG		AQETDNERSA		QGTSAPLLPL		LQRFQSIICR
KDAPHSEGDM		HLLSGPLSPN		ESFLRYLTLP		QDNELAIDLR		QTAVVVMAHL
DRLATPCMPP		LCSSPTSHKG		SLQEVIGWGL		IGWKYYANVI		GPIQCEGLAN
LGVTQIACAE		KRFLILSRNG		RVYTQAYNSD		TLAPQLVQGL		ASRNIVKIAA
HSDGHHYLAL		AATGEVYSWG		CGDGGRLGHG		DTVPLEEPKV		ISAFSGKQAG
KHVVHIACGS		TYSAAITAEG		ELYTWGRGNY		GRLGHGSSED		EAIPMLVAGL
KGLKVIDVAC		GSGDAQTLAV		TENGQVWSWG		DGDYGKLGRG		GSDGCKTPKL
IEKLQDLDVV		KVRCGSQFSI		ALTKDGQVYS		WGKGDNQRLG		HGTEEHVRYP
KLLEGLQGKK		VIDVAAGSTH		CLALTEDSEV		HSWGSNDQCQ		HFDTLRVTKP
EPAALPGLDT		KHIVGIACGP		AQSFAWSSCS		EWSIGLRVPF		VVDICSMTFE
QLDLLLRQVS		EGMDGSADWP		PPQEKECVAV		ATLNLLRLQL		HAAISHQVDP
EFLGLGLGSI		LLNSLKQTVV		TLASSAGVLS		TVQSAAQAVL		QSGWSVLLPT
AEERARALSA		LLPCAVSGNE		VNISPGRRFM		IDLLVGSLMA		DGGLESALHA
AITAEIQDIE		AKKEAQKEKE		IDEQEANAST		FHRSRTPLDK		DLINTGICES
SGKQCLPLVQ		LIQQLLRNIA		SQTVARLKDV		ARRISSCLDF		EQHSRERSAS
LDLLLRFQRL		LISKLYPGES		IGQTSDISSP		ELMGVGSLLK		KYTALLCTHI
GDILPVAASI		ASTSWRHFAE		VAYIVEGDFT		GVLLPELVVS		IVLLLSKNAG
LMQEAGAVPL		LGGLLEHLDR		FNHLAPGKER		DDHEELAWPG		IMESFFTGQN
CRNNEEVTLI		RKADLENHNK		DGGFWTVIDG		KVYDIKDFQT		QSLTGNSILA
QFAGEDPVVA		LEAALQFEDT		RESMHAFCVG		QYLEPDQEIV		TIPDLGSLSS
PLIDTERNLG		LLLGLHASYL		AMSTPLSPVE		IECAKWLQSS		IFSGGLQTSQ
IHYSYNEEKD		EDHCSSPGGT		PASKSRLCSH		RRALGDHSQA		FLQAIADNNI
QDHNVKDFLC		QIERYCRQCH		LTTPIMFPPE		HPVEEVGRLL		LCCLLKHEDL
GHVALSLVHA		GALGIEQVKH		RTLPKSVVDV		CRVVYQAKCS		LIKTHQEQGR
SYKEVCAPVI		ERLRFLFNEL		RPAVCNDLSI		MSKFKLLSSL		PRWRRIAQKI
IRERRKKRVP		KKPESTDDEE		KIGNEESDLE		EACILPHSPI		NVDKRPIAIK
SPKDKWQPLL		STVTGVHKYK		WLKQNVQGLY		PQSPLLSTIA		EFALKEEPVD
VEKMRKCLLK		QLERAEVRLE		GIDTILKLAS		KNFLLPSVQY		AMFCGWQRLI
PEGIDIGEPL		TDCLKDVDLI		PPFNRMLLEV		TFGKLYAWAV		QNIRNVLMDA
SAKFKELGIQ		PVPLQTITNE		NPSGPSLGTI		PQARFLLVML		SMLTLQHGAN
NLDLLLNSGM		LALTQTALRL		IGPSCDNVEE		DMNASAQGAS		ATVLEETRKE
TAPVQLPVSG		PELAAMMKIG		TRVMRGVDWK		WGDQDGPPPG		LGRVIGELGE
DGWIRVQWDT		GSTNSYRMGK		EGKYDLKLAE		LPAAAQPSAE		DSDTEDDSEA
EQTERNIHPT		AMMFTSTINL		LQTLCLSAGV		HAEIMQSEAT		KTLCGLLRML
VESGTTDKTS		SPNRLVYREQ		HRSWCTLGFV		RSIALTPQVC		GALSSPQWIT
LLMKVVEGHA		PFTATSLQRQ		ILAVHLLQAV		LPSWDKTERA		RDMKCLVEKL
FDFLGSLLTT		CSSDVPLLRE		STLRRRRVRP		QASLTATHSS		TLAEEVVALL
RTLHSLTQWN		GLINKYINSQ		LRSITHSFVG		RPSEGAQLED		YFPDSENPEV
GGLMAVLAVI		GGIDGRLRLG		GQVMHDEFGE		GTVTRITPKG		KITVQFSDMR
TCRVCPLNQL		KPLPAVAFNV		NNLPFTEPML		SVWAQLVNLA		GSKLEKHKIK
KSTKQAFAGQ		VDLDLLRCQQ		LKLYILKAGR		ALLSHQDKLR		QILSQPAVQE
TGTVHTDDGA		VVSPDLGDMS		PEGPQPPMIL		LQQLLASATQ		PSPVKAIFDK
QELEAAALAV		CQCLAVESTH		PSSPGFEDCS		SSEATTPVAV		QHIRPARVKR
RKQSPVPALP		IVVQLMEMGF		SRRNIEFALK		SLTGASGNAS		SLPGVEALVG
WLLDHSDIQV		TELSDADTVS		DEYSDEEVVE		DVDDAAYSMS		TGAVVTESQT
YKKRADFLSN		DDYAVYVREN		IQVGMMVRCC		RAYEEVCEGD		VGKVIKLDRD
GLHDLNVQCD		WQQKGGTYWV		RYIHVELIGY		PPPSSSSHIK		IGDKVRVKAS
VTTPKYKWGS		VTHQSVGVVK		AFSANGKDII		VDFPQQSHWT		GLLSEMELVP
SIHPGVTCDG		CQMFPINGSR		FKCRNCDDFD		FCETCFKTKK		HNTRHTFGRI
NEPGQSAVFC		GRSGKQLKRC		HSSQPGMLLD		SWSRMVKSLN		VSSSVNQASR
LIDGSEPCWQ		SSGSQGKHWI		RLEIFPDVLV		HRLKMIVDPA		DSSYMPSLVV
VSGGNSLNNL		IELKTININP		SDTTVPLLND		CTEYHRYIEI		AIKQCRSSGI
DCKIHGLILL		GRIRAEEEDL		AAVPFLASDN		EEEEDEKGNS		GSLIRKKAAG
LESAATIRTK		VFVWGLNDKD		QLGGLKGSKI		KVPSFSETLS		ALNVVQVAGG
SKSLFAVTVE		GKVYACGEAT		NGRLGLGISS		GTVPIPRQIT		ALSSYVVKKV
AVHSGGRHAT		ALTVDGKVFS		WGEGDDGKLG		HFSRMNCDKP		RLIEALKTKR
IRDIACGSSH		SAALTSSGEL		YTWGLGEYGR		LGHGDNTTQL		KPKMVKVLLG
HRVIQVACGS		RDAQTLALTD		EGLVFSWGDG		DFGKLGRGGS		EGCNIPQNIE
RLNGQGVCQI		ECGAQFSLAL		TKSGVVWTWG		KGDYFRLGHG		SDVHVRKPQV
VEGLRGKKIV		HVAVGALHCL		AVTDSGQVYA		WGDNDHGQQG		NGTTTVNRKP
TLVQGLEGQK		ITRVACGSSH		SVAWTTVDVA		TPSVHEPVLF		QTARDPLGAS
YLGVPSDADS		SAASNKISGA		SNSKPNRPSL		AKILLSLDGN		LAKQQALSHI
LTALQIMYAR		DAVVGALMPA		AMIAPVECPS		FSSAAPSDAS		AMASPMNGEE
CMLAVDIEDR		LSPNPWQEKR		EIVSSEDAVT		PSAVTPSAPS		ASARPFIPVT
DDLGAASIIA		ETMTKTKEDV		ESQNKAAGPE		PQALDEFTSL		LIADDTRVVV
DLLKLSVCSR		AGDRGRDVLS		AVLSGMGTAY		PQVADMLLEL		CVTELEDVAT
DSQSGRLSSQ		PVVVESSHPY		TDDTSTSGTV		KIPGAEGLRV		EFDRQCSTER
RHDPLTVMDG		VNRIVSVRSG		REWSDWSSEL		RIPGDELKWK		FISDGSVNGW
GWRFTVYPIM		PAAGPKELLS		DRCVLSCPSM		DLVTCLLDFR		LNLASNRSIV
PRLAASLAAC		AQLSALAASH		RMWALQRLRK		LLTTEFGQSI		NINRLLGEND
GETRALSFTG		SALAALVKGL		PEALQRQFEY		EDPIVRGGKQ		LLHSPFFKVL
VALACDLELD		TLPCCAETHK		WAWFRRYCMA		SRVAVALDKR		TPLPRLFLDE
VAKKIRELMA		DSENMDVLHE		SHDIFKREQD		EQLVQWMNRR		PDDWTLSAGG
SGTIYGWGHN		HRGQLGGIEG		AKVKVPTPCE		ALATLRPVQL		IGGEQTLFAV
TADGKLYATG		YGAGGRLGIG		GTESVSTPTL		LESIQHVFIK		KVAVNSGGKH
CLALSSEGEV		YSWGEAEDGK		LGHGNRSPCD		RPRVIESLRG		IEVVDVAAGG
AHSACVTAAG		DLYTWGKGRY		GRLGHSDSED		QLKPKLVEAL		QGHRVVDIAC
GSGDAQTLCL		TDDDTVWSWG		DGDYGKLGRG		GSDGCKVPMK		IDSLTGLGVV
KVECGSQFSV		ALTKSGAVYT		WGKGDYHRLG		HGSDDHVRRP		RQVQGLQGKK
VIAIATGSLH		CVCCTEDGEV		YTWGDNDEGQ		LGDGTTNAIQ		RPRLVAALQG
KKVNRVACGS		AHTLAWSTSK		PASAGKLPAQ		VPMEYNHLQE		IPIIALRNRL
LLLHHLSELF		CPCIPMFDLE		GSLDETGLGP		SVGFDTLRGI		LISQGKEAAF
RKVVQATMVR		DRQHGPVVEL		NRIQVKRSRS		KGGLAGPDGT		KSVFGQMCAK
MSSFGPDSLL		LPHRVWKVKF		VGESVDDCGG		GYSESIAEIC		EELQNGLTPL
LIVTPNGRDE		SGANRDCYLL		SPAARAPVHS		SMFRFLGVLL		GIAIRTGSPL
SLNLAEPVWK		QLAGMSLTIA		DLSEVDKDFI		PGLMYIRDNE		ATSEEFEAMS
LPFTVPSASG		QDIQLSSKHT		HITLDNRAEY		VRLAINYRLH		EFDEQVAAVR
EGMARVVPVP		LLSLFTGYEL		ETMVCGSPDI		PLHLLKSVAT		YKGIEPSASL
IQWFWEVMES		FSNTERSLFL		RFVWGRTRLP		RTIADFRGRD		FVIQVLDKYN
PPDHFLPESY		TCFFLLKLPR		YSCKQVLEEK		LKYAIHFCKS		IDTDDYARIA
LTGEPAADDS		SDDSDNEDVD		SFASDSTQDY		LTGH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

• Mengel-From J., Borsting C., Sanchez J.J., Eiberg H., Morling N. (2010). Human eye colour and HERC2, OCA2 and MATP. Forensic Sci. Int. Genet. 4: 323—328. PMID 20457063 DOI:10.1016/j.fsigen.2009.12.004
• Kang T.H., Lindsey-Boltz L.A., Reardon J.T., Sancar A. (2010). Circadian control of XPA and excision repair of cisplatin-DNA damage by cryptochrome and HERC2 ubiquitin ligase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 4890—4895. PMID 20304803 DOI:10.1073/pnas.0915085107
• Al-Hakim A.K., Bashkurov M., Gingras A.C., Durocher D., Pelletier L. (2012). Interaction proteomics identify NEURL4 and the HECT E3 ligase HERC2 as novel modulators of centrosome architecture. Mol. Cell. Proteomics. 11: M111.014233.01 — M111.014233.14. PMID 22261722 DOI:10.1074/mcp.M111.014233

Див. також

• Хромосома 15