HFM1

HFM1
Ідентифікатори
Символи	HFM1, MER3, POF9, SEC63D1, Si-11, Si-11-6, helicase, ATP-dependent DNA helicase homolog, ATP dependent DNA helicase homolog, helicase for meiosis 1
Зовнішні ІД	OMIM: 615684 MGI: 3036246 HomoloGene: 87103 GeneCards: HFM1
Онтологія гена Молекулярна функція • ATP binding • hydrolase activity • nucleotide binding • nucleic acid binding • GO:0008026 helicase activity Клітинна компонента • ядерце • цитоплазма Біологічний процес • resolution of meiotic recombination intermediates • GO:0007126 мейоз • RNA secondary structure unwinding Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	164045	330149
Ensembl	ENSG00000162669	ENSMUSG00000043410
UniProt	A2PYH4 C9JQ07	D3Z4R1
RefSeq (мРНК)	NM_001017975	NM_001252516 NM_177873
RefSeq (білок)	NP_001017975	NP_001239445 NP_808541
Локус (UCSC)	Хр. 1: 91.26 – 91.4 Mb	Хр. 5: 106.84 – 106.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HFM1 (англ. HFM1, ATP dependent DNA helicase homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 435 амінокислот, а молекулярна маса — 162 610.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLKSNDCLFS		LENLFFEKPD		EVENHPDNEK		SLDWFLPPAP		LISEIPDTQE
LEEELESHKL		LGQEKRPKML		TSNLKITNED		TNYISLTQKF		QFAFPSDKYE
QDDLNLEGVG		NNDLSHIAGK		LTYASQKYKN		HIGTEIAPEK		SVPDDTKLVN
FAEDKGESTS		VFRKRLFKIS		DNIHGSAYSN		DNELDSHIGS		VKIVQTEMNK
GKSRNYSNSK		QKFQYSANVF		TANNAFSASE		IGEGMFKAPS		FSVAFQPHDI
QEVTENGLGS		LKAVTEIPAK		FRSIFKEFPY		FNYIQSKAFD		DLLYTDRNFV
ICAPTGSGKT		VVFELAITRL		LMEVPLPWLN		IKIVYMAPIK		ALCSQRFDDW
KEKFGPIGLN		CKELTGDTVM		DDLFEIQHAH		IIMTTPEKWD		SMTRKWRDNS
LVQLVRLFLI		DEVHIVKDEN		RGPTLEVVVS		RMKTVQSVSQ		TLKNTSTAIP
MRFVAVSATI		PNAEDIAEWL		SDGERPAVCL		KMDESHRPVK		LQKVVLGFPC
SSNQTEFKFD		LTLNYKIASV		IQMYSDQKPT		LVFCATRKGV		QQAASVLVKD
AKFIMTVEQK		QRLQKYAYSV		RDSKLRDILK		DGAAYHHAGM		ELSDRKVVEG
AFTVGDLPVL		FTTSTLAMGV		NLPAHLVVIK		STMHYAGGLF		EEYSETDILQ
MIGRAGRPQF		DTTATAVIMT		RLSTRDKYIQ		MLACRDTVES		SLHRHLIEHL
NAEIVLHTIT		DVNIAVEWIR		STLLYIRALK		NPSHYGFASG		LNKDGIEAKL
QELCLKNLND		LSSLDLIKMD		EGVNFKPTEA		GRLMAWYYIT		FETVKKFYTI
SGKETLSDLV		TLIAGCKEFL		DIQLRINEKK		TLNTLNKDPN		RITIRFPMEG
RIKTREMKVN		CLIQAQLGCI		PIQDFALTQD		TAKIFRHGSR		ITRWLSDFVA
AQEKKFAVLL		NSLILAKCFR		CKLWENSLHV		SKQLEKIGIT		LSNAIVNAGL
TSFKKIEETD		ARELELILNR		HPPFGTQIKE		TVMYLPKYEL		KVEQITRYSD
TTAEILVTVI		LRNFEQLQTK		RTASDSHYVT		LIIGDADNQV		VYLHKITDSV
LLKAGSWAKK		IAVKRALKSE		DLSINLISSE		FVGLDIQQKL		TVFYLEPKRF
GNQITMQRKS		ETQISHSKHS		DISTIAGPNK		GTTASKKPGN		RECNHLCKSK
HTCGHDCCKI		GVAQKSEIKE		STISSYLSDL		RNRNAVSSVP		PVKRLKIQMN
KSQSVDLKEF		GFTPKPSLPS		ISRSEYLNIS		ELPIMEQWDQ		PEIYGKVRQE
PSEYQDKEVL		NVNFELGNEV		WDDFDDENLE		VTSFSTDTEK		TKISGFGNTL
SSSTRGSKLP		LQESKSKFQR		EMSNSFVSSH		EMSDISLSNS		AMPKFSASSM
TKLPQQAGNA		VIVHFQERKP		QNLSPEIEKQ		CFTFSEKNPN		SSNYKKVDFF
IRNSECKKEV		DFSMYHPDDE		ADEMKSLLGI		FDGIF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як мейоз, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

• Tanaka K., Miyamoto N., Shouguchi-Miyata J., Ikeda J.E. (2006). HFM1, the human homologue of yeast Mer3, encodes a putative DNA helicase expressed specifically in germ-line cells. DNA Seq. 17: 242—246. PMID 17286053 DOI:10.1080/10425170600805433

Див. також

• Хромосома 1