HIST1H1A

HIST1H1A
Ідентифікатори
Символи	H1-1, H1.1, H1A, H1F1, HIST1, histone cluster 1, H1a, histone cluster 1 H1 family member a, H1.1 linker histone, cluster member, HIST1H1A
Зовнішні ІД	OMIM: 142709 MGI: 1931523 HomoloGene: 134658 GeneCards: H1-1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • chromatin DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • heparin binding • double-stranded DNA binding • nucleosomal DNA binding Клітинна компонента • Нуклеосома • клітинне ядро • хромосома • cell surface • везикула Біологічний процес • nucleosome assembly • Сперматогенез • positive regulation of receptor-mediated endocytosis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chromosome condensation • negative regulation of DNA recombination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3024	80838
Ensembl	ENSG00000124610	ENSMUSG00000049539
UniProt	Q02539	P43275
RefSeq (мРНК)	NM_005325	NM_030609
RefSeq (білок)	NP_005316	NP_085112
Локус (UCSC)	Хр. 6: 26.02 – 26.02 Mb	Хр. 13: 23.95 – 23.95 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HIST1H1A (англ. Histone cluster 1 H1 family member a) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 215 амінокислот, а молекулярна маса — 21 842.

Представник родини білків гістонів H1.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSETVPPAPA		ASAAPEKPLA		GKKAKKPAKA		AAASKKKPAG		PSVSELIVQA
ASSSKERGGV		SLAALKKALA		AAGYDVEKNN		SRIKLGIKSL		VSKGTLVQTK
GTGASGSFKL		NKKASSVETK		PGASKVATKT		KATGASKKLK		KATGASKKSV
KTPKKAKKPA		ATRKSSKNPK		KPKTVKPKKV		AKSPAKAKAV		KPKAAKARVT
KPKTAKPKKA		APKKK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 DOI:10.1006/geno.2002.6850
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Parseghian M.H., Henschen A.H., Krieglstein K.G., Hamkalo B.A. (1994). A proposal for a coherent mammalian histone H1 nomenclature correlated with amino acid sequences. Protein Sci. 3: 575—587. PMID 8003976 DOI:10.1002/pro.5560030406
• Hendzel M.J., Lever M.A., Crawford E., Th'ng J.P. (2004). The C-terminal domain is the primary determinant of histone H1 binding to chromatin in vivo. J. Biol. Chem. 279: 20028—20034. PMID 14985337 DOI:10.1074/jbc.M400070200
• Th'ng J.P., Sung R., Ye M., Hendzel M.J. (2005). H1 family histones in the nucleus. Control of binding and localization by the C-terminal domain. J. Biol. Chem. 280: 27809—27814. PMID 15911621 DOI:10.1074/jbc.M501627200
• Ninios Y.P., Sekeri-Pataryas K.E., Sourlingas T.G. (2010). Histone H1 subtype preferences of DFF40 and possible nuclear localization of DFF40/45 in normal and trichostatin A-treated NB4 leukemic cells. Apoptosis. 15: 128—138. PMID 19882353 DOI:10.1007/s10495-009-0418-7

Див. також

• Хромосома 6