HIST2H3D

HIST2H3D
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2IIJ, 2X4W, 2X4X, 2X4Y, 3AV1, 3DB3, 3MO8, 3R93, 4MZF, 4MZG, 4MZH, 4OUC, 5BO0, 2HIO, 5B0Z, 2ARO, 1EQZ, 1HQ3, 4KGC, 1TZY, 4UUZ, 2F8N, 5B0Y, 4LD9, 5B40, 5CIU
Ідентифікатори
Символи	H3C13, histone cluster 2 H3 family member d, H3 clustered histone 13, HIST2H3D, H3C15, H3C14
Зовнішні ІД	MGI: 2448320 HomoloGene: 134489 GeneCards: H3C13
Онтологія гена Молекулярна функція • protein heterodimerization activity • DNA binding • GO:0031493 histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromatin binding • nucleosomal DNA binding Клітинна компонента • екзосома • extracellular region • нуклеоплазма • хромосома • Нуклеосома • клітинне ядро • Хроматин Біологічний процес • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • зсідання крові • rDNA heterochromatin assembly • nucleosome assembly • negative regulation of gene expression, epigenetic • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • interleukin-7-mediated signaling pathway • regulation of megakaryocyte differentiation • regulation of hematopoietic stem cell differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	653604	319148
Ensembl	ENSG00000183598	ENSMUSG00000069310
UniProt	Q71DI3	P84228
RefSeq (мРНК)	NM_001123375	NM_175653
RefSeq (білок)	NP_066403 NP_001116847	NP_473386 NP_835734 NP_783584 NP_835510 NP_835587 NP_038576 NP_835511 NP_835512
Локус (UCSC)	Хр. 1: 149.81 – 149.81 Mb	Хр. 13: 23.93 – 23.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HIST2H3D (англ. Histone cluster 2 H3 family member c) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 136 амінокислот, а молекулярна маса — 15 388.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MARTKQTARK		STGGKAPRKQ		LATKAARKSA		PATGGVKKPH		RYRPGTVALR
EIRRYQKSTE		LLIRKLPFQR		LVREIAQDFK		TDLRFQSSAV		MALQEASEAY
LVGLFEDTNL		CAIHAKRVTI		MPKDIQLARR		IRGERA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 doi:10.1006/geno.2002.6850
• Braastad C.D., Hovhannisyan H., van Wijnen A.J., Stein J.L., Stein G.S. (2004). Functional characterization of a human histone gene cluster duplication. Gene. 342: 35—40. PMID 15527963 doi:10.1016/j.gene.2004.07.036
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Lachner M., O'Carroll D., Rea S., Mechtler K., Jenuwein T. (2001). Methylation of histone H3 lysine 9 creates a binding site for HP1 proteins. Nature. 410: 116—120. PMID 11242053 doi:10.1038/35065132
• Goto H., Yasui Y., Nigg E.A., Inagaki M. (2002). Aurora-B phosphorylates Histone H3 at serine28 with regard to the mitotic chromosome condensation. Genes Cells. 7: 11—17. PMID 11856369 doi:10.1046/j.1356-9597.2001.00498.x
• Preuss U., Landsberg G., Scheidtmann K.H. (2003). Novel mitosis-specific phosphorylation of histone H3 at Thr11 mediated by Dlk/ZIP kinase. Nucleic Acids Res. 31: 878—885. PMID 12560483 doi:10.1093/nar/gkg176

Див. також

• Хромосома 1