HNRNPL

HNRNPL
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3R27, 3TO8
Ідентифікатори
Символи	HNRNPL, HNRPL, hnRNP-L, P/OKcl.14, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L
Зовнішні ІД	OMIM: 603083 MGI: 104816 HomoloGene: 1174 GeneCards: HNRNPL
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • pre-mRNA intronic binding • nucleic acid binding • RNA binding • mRNA 3'-UTR binding • mRNA CDS binding Клітинна компонента • цитоплазма • ribonucleoprotein granule • екзосома • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • Пронуклеус • гіалоплазма • perinuclear region of cytoplasm • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • RNA metabolic process • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • циркадний ритм • cellular response to amino acid starvation • positive regulation of translation • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome • response to peptide • positive regulation of mRNA binding Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3191	15388
Ensembl	ENSG00000104824 ENSG00000282947	ENSMUSG00000015165
UniProt	P14866	Q8R081
RefSeq (мРНК)	NM_001005335 NM_001533	NM_177301
RefSeq (білок)	NP_001005335 NP_001524	NP_796275 NP_001389864 NP_001389865 NP_001389866 NP_001389867 NP_001389868
Локус (UCSC)	Хр. 19: 38.84 – 38.85 Mb	Хр. 7: 28.51 – 28.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HNRNPL (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 589 амінокислот, а молекулярна маса — 64 133.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRRLLPRAE		KRRRRLEQRQ		QPDEQRRRSG		AMVKMAAAGG		GGGGGRYYGG
GSEGGRAPKR		LKTDNAGDQH		GGGGGGGGGA		GAAGGGGGGE		NYDDPHKTPA
SPVVHIRGLI		DGVVEADLVE		ALQEFGPISY		VVVMPKKRQA		LVEFEDVLGA
CNAVNYAADN		QIYIAGHPAF		VNYSTSQKIS		RPGDSDDSRS		VNSVLLFTIL
NPIYSITTDV		LYTICNPCGP		VQRIVIFRKN		GVQAMVEFDS		VQSAQRAKAS
LNGADIYSGC		CTLKIEYAKP		TRLNVFKNDQ		DTWDYTNPNL		SGQGDPGSNP
NKRQRQPPLL		GDHPAEYGGP		HGGYHSHYHD		EGYGPPPPHY		EGRRMGPPVG
GHRRGPSRYG		PQYGHPPPPP		PPPEYGPHAD		SPVLMVYGLD		QSKMNCDRVF
NVFCLYGNVE		KVKFMKSKPG		AAMVEMADGY		AVDRAITHLN		NNFMFGQKLN
VCVSKQPAIM		PGQSYGLEDG		SCSYKDFSES		RNNRFSTPEQ		AAKNRIQHPS
NVLHFFNAPL		EVTEENFFEI		CDELGVKRPS		SVKVFSGKSE		RSSSGLLEWE
SKSDALETLG		FLNHYQMKNP		NGPYPYTLKL		CFSTAQHAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Pinol-Roma S., Swanson M.S., Gall J.G., Dreyfuss G. (1989). A novel heterogeneous nuclear RNP protein with a unique distribution on nascent transcripts. J. Cell Biol. 109: 2575—2587. PMID 2687284 DOI:10.1083/jcb.109.6.2575
• Kuninger D.T., Izumi T., Papaconstantinou J., Mitra S. (2002). Human AP-endonuclease 1 and hnRNP-L interact with a nCaRE-like repressor element in the AP-endonuclease 1 promoter. Nucleic Acids Res. 30: 823—829. PMID 11809897 DOI:10.1093/nar/30.3.823
• Shankarling G., Cole B.S., Mallory M.J., Lynch K.W. (2014). Transcriptome-wide RNA interaction profiling reveals physical and functional targets of hnRNP L in human T cells. Mol. Cell. Biol. 34: 71—83. PMID 24164894 DOI:10.1128/MCB.00740-13
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 19