HTRA2

HTRA2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1LCY, 2PZD
Ідентифікатори
Символи	HTRA2, Htra2, AI481710, Omi, Prss25, mnd2, PARK13, HtrA serine peptidase 2, MGCA8
Зовнішні ІД	OMIM: 606441 MGI: 1928676 HomoloGene: 113300 GeneCards: HTRA2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• розгорнуте білкове зв’язування; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • serine-type peptidase activity; • serine-type endopeptidase activity; • hydrolase activity; • GO:0070122 peptidase activity; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • гіалоплазма; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • мітохондріальна мембрана; • мітохондріальний міжмембранний простір; • ендоплазматичний ретикулум; • мітохондрія; • CD40 receptor complex; • cytoplasmic side of plasma membrane; • Хроматин; • цитоскелет; • клітинне ядро; • serine-type endopeptidase complex;
Біологічний процес	• cellular response to retinoic acid; • cellular response to heat; • positive regulation of cell death; • ceramide metabolic process; • cellular response to interferon-beta; • regulation of multicellular organism growth; • positive regulation of protein targeting to mitochondrion; • execution phase of apoptosis; • adult locomotory behavior; • cellular response to growth factor stimulus; • pentacyclic triterpenoid metabolic process; • mitochondrion organization; • negative regulation of cell cycle; • neuron development; • protein autoprocessing; • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway; • negative regulation of cell death; • intrinsic apoptotic signaling pathway; • positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; • regulation of autophagy of mitochondrion; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; • positive regulation of apoptotic process; • forebrain development; • negative regulation of oxidative stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway; • response to herbicide; • adult walking behavior; • negative regulation of neuron death; • GO:0097285 апоптоз; • GO:0010260 старіння людини; • протеоліз; • positive regulation of mitochondrion organization; • cellular response to oxidative stress; • negative regulation of mitophagy in response to mitochondrial depolarization; • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • protein homotrimerization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	27429
	64704
	ENSG00000115317
	ENSMUSG00000068329
	O43464
	Q9JIY5
	NM_013247; NM_145074; NM_001321727; NM_001321728
	NM_019752
	NP_001308656; NP_001308657; NP_037379; NP_659540
	NP_062726
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HTRA2 (англ. HtrA serine peptidase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 458 амінокислот, а молекулярна маса — 48 841^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAPRAGRGA	GWSLRAWRAL	GGIRWGRRPR	LTPDLRALLT	SGTSDPRARV
TYGTPSLWAR	LSVGVTEPRA	CLTSGTPGPR	AQLTAVTPDT	RTREASENSG
TRSRAWLAVA	LGAGGAVLLL	LWGGGRGPPA	VLAAVPSPPP	ASPRSQYNFI
ADVVEKTAPA	VVYIEILDRH	PFLGREVPIS	NGSGFVVAAD	GLIVTNAHVV
ADRRRVRVRL	LSGDTYEAVV	TAVDPVADIA	TLRIQTKEPL	PTLPLGRSAD
VRQGEFVVAM	GSPFALQNTI	TSGIVSSAQR	PARDLGLPQT	NVEYIQTDAA
IDFGNSGGPL	VNLDGEVIGV	NTMKVTAGIS	FAIPSDRLRE	FLHRGEKKNS
SSGISGSQRR	YIGVMMLTLS	PSILAELQLR	EPSFPDVQHG	VLIHKVILGS
PAHRAGLRPG	DVILAIGEQM	VQNAEDVYEA	VRTQSQLAVQ	IRRGRETLTL
YVTPEVTE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, мітохондрії.

Література

Faccio L., Fusco C., Viel A., Zervos A.S. (2000). Tissue-specific splicing of Omi stress-regulated endoprotease leads to an inactive protease with a modified PDZ motif. Genomics. 68: 343—347. PMID 10995577 doi:10.1006/geno.2000.6263
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Bartke T., Pohl C., Pyrowolakis G., Jentsch S. (2004). Dual role of BRUCE as an antiapoptotic IAP and a chimeric E2/E3 ubiquitin ligase. Mol. Cell. 14: 801—811. PMID 15200957 doi:10.1016/j.molcel.2004.05.018
Simon-Sanchez J., Singleton A.B. (2008). Sequencing analysis of OMI/HTRA2 shows previously reported pathogenic mutations in neurologically normal controls. Hum. Mol. Genet. 17: 1988—1993. PMID 18364387 doi:10.1093/hmg/ddn096

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14348 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2017-08-19 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, O43464 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14348 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2017-08-19 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, O43464 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]