IGSF9

IGSF9
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1V5J
Ідентифікатори
Символи	IGSF9, FP18798, IGSF9A, Nrt1, immunoglobulin superfamily member 9
Зовнішні ІД	OMIM: 609738 MGI: 2135283 HomoloGene: 10815 GeneCards: IGSF9
Онтологія гена Молекулярна функція • cell-cell adhesion mediator activity Клітинна компонента • міжклітинні контакти • integral component of membrane • аксон • синапс • клітинна мембрана • дендрит (нейробіологія) • inhibitory synapse • мембрана Біологічний процес • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • multicellular organism development • диференціація клітин • нейробіологія розвитку • GO:1904739 regulation of synapse organization • dendrite development • axon guidance • dendrite self-avoidance Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57549	93842
Ensembl	ENSG00000085552	ENSMUSG00000037995
UniProt	Q9P2J2	Q05BQ1
RefSeq (мРНК)	NM_001135050 NM_020789	NM_001145800 NM_033608
RefSeq (білок)	NP_001128522 NP_065840	NP_001139272 NP_291086
Локус (UCSC)	Хр. 1: 159.93 – 159.95 Mb	Хр. 1: 172.48 – 172.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IGSF9 (англ. Immunoglobulin superfamily member 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 179 амінокислот, а молекулярна маса — 126 580.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVWCLGLAVL		SLVISQGADG		RGKPEVVSVV		GRAGESVVLG		CDLLPPAGRP
PLHVIEWLRF		GFLLPIFIQF		GLYSPRIDPD		YVGRVRLQKG		ASLQIEGLRV
EDQGWYECRV		FFLDQHIPED		DFANGSWVHL		TVNSPPQFQE		TPPAVLEVQE
LEPVTLRCVA		RGSPLPHVTW		KLRGKDLGQG		QGQVQVQNGT		LRIRRVERGS
SGVYTCQASS		TEGSATHATQ		LLVLGPPVIV		VPPKNSTVNA		SQDVSLACHA
EAYPANLTYS		WFQDNINVFH		ISRLQPRVRI		LVDGSLRLLA		TQPDDAGCYT
CVPSNGLLHP		PSASAYLTVL		YPAQVTAMPP		ETPLPIGMPG		VIRCPVRANP
PLLFVSWTKD		GKALQLDKFP		GWSQGTEGSL		IIALGNEDAL		GEYSCTPYNS
LGTAGPSPVT		RVLLKAPPAF		IERPKEEYFQ		EVGRELLIPC		SAQGDPPPVV
SWTKVGRGLQ		GQAQVDSNSS		LILRPLTKEA		HGHWECSASN		AVARVATSTN
VYVLGTSPHV		VTNVSVVALP		KGANVSWEPG		FDGGYLQRFS		VWYTPLAKRP
DRMHHDWVSL		AVPVGAAHLL		VPGLQPHTQY		QFSVLAQNKL		GSGPFSEIVL
SAPEGLPTTP		AAPGLPPTEI		PPPLSPPRGL		VAVRTPRGVL		LHWDPPELVP
KRLDGYVLEG		RQGSQGWEVL		DPAVAGTETE		LLVPGLIKDV		LYEFRLVAFA
GSFVSDPSNT		ANVSTSGLEV		YPSRTQLPGL		LPQPVLAGVV		GGVCFLGVAV
LVSILAGCLL		NRRRAARRRR		KRLRQDPPLI		FSPTGKSAAP		SALGSGSPDS
VAKLKLQGSP		VPSLRQSLLW		GDPAGTPSPH		PDPPSSRGPL		PLEPICRGPD
GRFVMGPTVA		APQERSGREQ		AEPRTPAQRL		ARSFDCSSSS		PSGAPQPLCI
EDISPVAPPP		AAPPSPLPGP		GPLLQYLSLP		FFREMNVDGD		WPPLEEPSPA
APPDYMDTRR		CPTSSFLRSP		ETPPVSPRES		LPGAVVGAGA		TAEPPYTALA
DWTLRERLLP		GLLPAAPRGS		LTSQSSGRGS		ASFLRPPSTA		PSAGGSYLSP
APGDTSSWAS		GPERWPRREH		VVTVSKRRNT		SVDENYEWDS		EFPGDMELLE
TLHLGLASSR		LRPEAEPELG		VKTPEEGCLL		NTAHVTGPEA		RCAALREEFL
AFRRRRDATR		ARLPAYRQPV		PHPEQATLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1