ITSN1

ITSN1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1KI1, 2KGR, 2KHN, 3QBV, 4IIM
Ідентифікатори
Символи	ITSN1, ITSN, SH3D1A, SH3P17, intersectin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602442 MGI: 1338069 HomoloGene: 2277 GeneCards: ITSN1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • kinase activator activity; • GO:0032947 molecular adaptor activity; • proline-rich region binding; • guanyl-nucleotide exchange factor activity;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • cell projection; • мембрана; • клітинна мембрана; • endocytic vesicle; • синапс; • міжклітинні контакти; • neuron projection; • clathrin-coated pit; • система ендомембран; • lamellipodium; • calyx of Held; • presynaptic endocytic zone; • клітинне ядро; • nuclear envelope; • цитоплазма; • ендосома; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • recycling endosome; • soma; • dendritic spine; • apical dendrite; • intracellular vesicle; • postsynaptic actin cytoskeleton; • glutamatergic synapse;
Біологічний процес	• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process; • positive regulation of protein kinase B signaling; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • ендоцитоз; • ephrin receptor signaling pathway; • synaptic vesicle endocytosis; • positive regulation of apoptotic process; • positive regulation of phosphorylation; • regulation of Rho protein signal transduction; • regulation of small GTPase mediated signal transduction; • small GTPase mediated signal transduction; • membrane organization; • GO:0022415 viral process; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • positive regulation of kinase activity; • екзоцитоз; • protein transport; • brain development; • positive regulation of growth hormone secretion; • positive regulation of dendritic spine development; • regulation of modification of postsynaptic actin cytoskeleton; • positive regulation of caveolin-mediated endocytosis; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	6453
	16443
	ENSG00000205726
	ENSMUSG00000022957
	Q15811; Q6J334
	Q9Z0R4
NM_001001132; NM_003024; NM_001331008; NM_001331009; NM_001331010;
	NM_001331011; NM_001331012
	NM_001110275; NM_001110276; NM_010587
NP_001001132; NP_001317937; NP_001317938; NP_001317939; NP_001317940;
	NP_001317941; NP_003015
	NP_001103745; NP_001103746; NP_034717
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ITSN1 (англ. Intersectin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 21-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 721 амінокислот, а молекулярна маса — 195 422^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQFPTPFGG	SLDIWAITVE	ERAKHDQQFH	SLKPISGFIT	GDQARNFFFQ
SGLPQPVLAQ	IWALADMNND	GRMDQVEFSI	AMKLIKLKLQ	GYQLPSALPP
VMKQQPVAIS	SAPAFGMGGI	ASMPPLTAVA	PVPMGSIPVV	GMSPTLVSSV
PTAAVPPLAN	GAPPVIQPLP	AFAHPAATLP	KSSSFSRSGP	GSQLNTKLQK
AQSFDVASVP	PVAEWAVPQS	SRLKYRQLFN	SHDKTMSGHL	TGPQARTILM
QSSLPQAQLA	SIWNLSDIDQ	DGKLTAEEFI	LAMHLIDVAM	SGQPLPPVLP
PEYIPPSFRR	VRSGSGISVI	SSTSVDQRLP	EEPVLEDEQQ	QLEKKLPVTF
EDKKRENFER	GNLELEKRRQ	ALLEQQRKEQ	ERLAQLERAE	QERKERERQE
QERKRQLELE	KQLEKQRELE	RQREEERRKE	IERREAAKRE	LERQRQLEWE
RNRRQELLNQ	RNKEQEDIVV	LKAKKKTLEF	ELEALNDKKH	QLEGKLQDIR
CRLTTQRQEI	ESTNKSRELR	IAEITHLQQQ	LQESQQMLGR	LIPEKQILND
QLKQVQQNSL	HRDSLVTLKR	ALEAKELARQ	HLRDQLDEVE	KETRSKLQEI
DIFNNQLKEL	REIHNKQQLQ	KQKSMEAERL	KQKEQERKII	ELEKQKEEAQ
RRAQERDKQW	LEHVQQEDEH	QRPRKLHEEE	KLKREESVKK	KDGEEKGKQE
AQDKLGRLFH	QHQEPAKPAV	QAPWSTAEKG	PLTISAQENV	KVVYYRALYP
FESRSHDEIT	IQPGDIVMVK	GEWVDESQTG	EPGWLGGELK	GKTGWFPANY
AEKIPENEVP	APVKPVTDST	SAPAPKLALR	ETPAPLAVTS	SEPSTTPNNW
ADFSSTWPTS	TNEKPETDNW	DAWAAQPSLT	VPSAGQLRQR	SAFTPATATG
SSPSPVLGQG	EKVEGLQAQA	LYPWRAKKDN	HLNFNKNDVI	TVLEQQDMWW
FGEVQGQKGW	FPKSYVKLIS	GPIRKSTSMD	SGSSESPASL	KRVASPAAKP
VVSGEEFIAM	YTYESSEQGD	LTFQQGDVIL	VTKKDGDWWT	GTVGDKAGVF
PSNYVRLKDS	EGSGTAGKTG	SLGKKPEIAQ	VIASYTATGP	EQLTLAPGQL
ILIRKKNPGG	WWEGELQARG	KKRQIGWFPA	NYVKLLSPGT	SKITPTEPPK
STALAAVCQV	IGMYDYTAQN	DDELAFNKGQ	IINVLNKEDP	DWWKGEVNGQ
VGLFPSNYVK	LTTDMDPSQQ	WCSDLHLLDM	LTPTERKRQG	YIHELIVTEE
NYVNDLQLVT	EIFQKPLMES	ELLTEKEVAM	IFVNWKELIM	CNIKLLKALR
VRKKMSGEKM	PVKMIGDILS	AQLPHMQPYI	RFCSRQLNGA	ALIQQKTDEA
PDFKEFVKRL	AMDPRCKGMP	LSSFILKPMQ	RVTRYPLIIK	NILENTPENH
PDHSHLKHAL	EKAEELCSQV	NEGVREKENS	DRLEWIQAHV	QCEGLSEQLV
FNSVTNCLGP	RKFLHSGKLY	KAKSNKELYG	FLFNDFLLLT	QITKPLGSSG
TDKVFSPKSN	LQYKMYKTPI	FLNEVLVKLP	TDPSGDEPIF	HISHIDRVYT
LRAESINERT	AWVQKIKAAS	ELYIETEKKK	REKAYLVRSQ	RATGIGRLMV
NVVEGIELKP	CRSHGKSNPY	CEVTMGSQCH	ITKTIQDTLN	PKWNSNCQFF
IRDLEQEVLC	ITVFERDQFS	PDDFLGRTEI	RVADIKKDQG	SKGPVTKCLL
LHEVPTGEIV	VRLDLQLFDE	P

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах, синаптосомах^[en].

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Sparks A.B., Hoffman N.G., McConnell S.J., Fowlkes D.M., Kay B.K. (1996). Cloning of ligand targets: systematic isolation of SH3 domain-containing proteins. Nat. Biotechnol. 14: 741—744. PMID 9630982 doi:10.1038/nbt0696-741
Pucharcos C., Casas C., Nadal M., Estivill X., de la Luna S. (2001). The human intersectin genes and their spliced variants are differentially expressed. Biochim. Biophys. Acta. 1521: 1—11. PMID 11690630 doi:10.1016/S0167-4781(01)00276-7
Kleino I., Ortiz R.M., Yritys M., Huovila A.P., Saksela K. (2009). Alternative splicing of ADAM15 regulates its interactions with cellular SH3 proteins. J. Cell. Biochem. 108: 877—885. PMID 19718658 doi:10.1002/jcb.22317
Teckchandani A., Mulkearns E.E., Randolph T.W., Toida N., Cooper J.A. (2012). The clathrin adaptor Dab2 recruits EH domain scaffold proteins to regulate integrin beta1 endocytosis. Mol. Biol. Cell. 23: 2905—2916. PMID 22648170 doi:10.1091/mbc.E11-12-1007
Snetkov X., Weisswange I., Pfanzelter J., Humphries A.C., Way M. (2016). NPF motifs in the vaccinia virus protein A36 recruit intersectin-1 to promote Cdc42:N-WASP-mediated viral release from infected cells. Nat. Microbiol. 1: 16141—16141. PMID 27670116 doi:10.1038/nmicrobiol.2016.141

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6183 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q15811 (англ.) . Архів оригіналу за 22 жовтня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.