KDM4B

KDM4B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4LXL, 4UC4
Ідентифікатори
Символи	KDM4B, JMJD2B, TDRD14B, lysine demethylase 4B, MRD65
Зовнішні ІД	OMIM: 609765 MGI: 2442355 HomoloGene: 27773 GeneCards: KDM4B
Пов'язані генетичні захворювання
періодонтит
Онтологія гена Молекулярна функція • oxidoreductase activity • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • histone demethylase activity • histone H3-methyl-lysine-36 demethylase activity • histone H3-methyl-lysine-9 demethylase activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • methylated histone binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро • histone methyltransferase complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • histone H3-K36 demethylation • histone H3-K9 demethylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • ремоделювання хроматину Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23030	193796
Ensembl	ENSG00000127663	ENSMUSG00000024201
UniProt	O94953	Q91VY5
RefSeq (мРНК)	NM_015015 NM_001370093 NM_001370094	NM_172132 NM_001357909
RefSeq (білок)	NP_055830 NP_001357022 NP_001357023	NP_742144 NP_001344838
Локус (UCSC)	Хр. 19: 4.97 – 5.15 Mb	Хр. 17: 56.63 – 56.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KDM4B (англ. Lysine demethylase 4B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 096 амінокислот, а молекулярна маса — 121 897.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGSEDHGAQN		PSCKIMTFRP		TMEEFKDFNK		YVAYIESQGA		HRAGLAKIIP
PKEWKPRQTY		DDIDDVVIPA		PIQQVVTGQS		GLFTQYNIQK		KAMTVGEYRR
LANSEKYCTP		RHQDFDDLER		KYWKNLTFVS		PIYGADISGS		LYDDDVAQWN
IGSLRTILDM		VERECGTIIE		GVNTPYLYFG		MWKTTFAWHT		EDMDLYSINY
LHFGEPKSWY		AIPPEHGKRL		ERLAIGFFPG		SSQGCDAFLR		HKMTLISPII
LKKYGIPFSR		ITQEAGEFMI		TFPYGYHAGF		NHGFNCAEST		NFATLRWIDY
GKVATQCTCR		KDMVKISMDV		FVRILQPERY		ELWKQGKDLT		VLDHTRPTAL
TSPELSSWSA		SRASLKAKLL		RRSHRKRSQP		KKPKPEDPKF		PGEGTAGAAL
LEEAGGSVKE		EAGPEVDPEE		EEEEPQPLPH		GREAEGAEED		GRGKLRPTKA
KSERKKKSFG		LLPPQLPPPP		AHFPSEEALW		LPSPLEPPVL		GPGPAAMEES
PLPAPLNVVP		PEVPSEELEA		KPRPIIPMLY		VVPRPGKAAF		NQEHVSCQQA
FEHFAQKGPT		WKEPVSPMEL		TGPEDGAASS		GAGRMETKAR		AGEGQAPSTF
SKLKMEIKKS		RRHPLGRPPT		RSPLSVVKQE		ASSDEEASPF		SGEEDVSDPD
ALRPLLSLQW		KNRAASFQAE		RKFNAAAART		EPYCAICTLF		YPYCQALQTE
KEAPIASLGK		GCPATLPSKS		RQKTRPLIPE		MCFTSGGENT		EPLPANSYIG
DDGTSPLIAC		GKCCLQVHAS		CYGIRPELVN		EGWTCSRCAA		HAWTAECCLC
NLRGGALQMT		TDRRWIHVIC		AIAVPEARFL		NVIERHPVDI		SAIPEQRWKL
KCVYCRKRMK		KVSGACIQCS		YEHCSTSFHV		TCAHAAGVLM		EPDDWPYVVS
ITCLKHKSGG		HAVQLLRAVS		LGQVVITKNR		NGLYYRCRVI		GAASQTCYEV
NFDDGSYSDN		LYPESITSRD		CVQLGPPSEG		ELVELRWTDG		NLYKAKFISS
VTSHIYQVEF		EDGSQLTVKR		GDIFTLEEEL		PKRVRSRLSL		STGAPQEPAF
SGEEAKAAKR		PRVGTPLATE		DSGRSQDYVA		FVESLLQVQG		RPGAPF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19