KMT5A

KMT5A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1ZKK, 2BQZ, 3F9W, 3F9X, 3F9Y, 3F9Z, 4IJ8, 5HQ2
Ідентифікатори
Символи	KMT5A, PR-Set7, SET07, SET8, SETD8, lysine methyltransferase 5A, PR/SET07
Зовнішні ІД	OMIM: 607240 MGI: 1915206 HomoloGene: 41372 GeneCards: KMT5A
шифр КФ	2.1.1.354
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein-lysine N-methyltransferase activity; • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • p53 binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • transferase activity; • lysine N-methyltransferase activity; • histone-lysine N-methyltransferase activity; • histone methyltransferase activity (H4-K20 specific);
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • хромосома; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• Метилювання; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • peptidyl-lysine monomethylation; • клітинний цикл; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • поділ клітини; • transcription, DNA-templated; • regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; • histone lysine methylation; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • histone H4-K20 methylation; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	387893
	67956
	ENSG00000183955
	ENSMUSG00000049327
	Q9NQR1
	Q2YDW7
NM_020382; NM_001324504; NM_001324505; NM_001324506; NM_001367386;
	NM_001367388; NM_001367389
	NM_030241; NM_001310723; NM_001310725; NM_001310727
NP_001311433; NP_001311434; NP_001311435; NP_065115; NP_001354315;
	NP_001354317; NP_001354318
NP_001297652; NP_001297654; NP_001297656; NP_084517; NP_001392317;
	NP_001392319
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

KMT5A (англ. Lysine methyltransferase 5A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 393 амінокислот, а молекулярна маса — 42 890^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGEGGAAAAL	VAAAAAAAAA	AAAVVAGQRR	RRLGRRARCH	GPGRAAGGKM
SKPCAVEAAA	AAVAATAPGP	EMVERRGPGR	PRTDGENVFT	GQSKIYSYMS
PNKCSGMRFP	LQEENSVTHH	EVKCQGKPLA	GIYRKREEKR	NAGNAVRSAM
KSEEQKIKDA	RKGPLVPFPN	QKSEAAEPPK	TPPSSCDSTN	AAIAKQALKK
PIKGKQAPRK	KAQGKTQQNR	KLTDFYPVRR	SSRKSKAELQ	SEERKRIDEL
IESGKEEGMK	IDLIDGKGRG	VIATKQFSRG	DFVVEYHGDL	IEITDAKKRE
ALYAQDPSTG	CYMYYFQYLS	KTYCVDATRE	TNRLGRLINH	SKCGNCQTKL
HDIDGVPHLI	LIASRDIAAG	EELLYDYGDR	SKASIEAHPW	LKH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, регуляторів хроматину, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Julien E., Herr W. (2004). A switch in mitotic histone H4 lysine 20 methylation status is linked to M phase defects upon loss of HCF-1. Mol. Cell. 14: 713—725. PMID 15200950 DOI:10.1016/j.molcel.2004.06.008
Sims J.K., Houston S.I., Magazinnik T., Rice J.C. (2006). A trans-tail histone code defined by monomethylated H4 Lys-20 and H3 Lys-9 demarcates distinct regions of silent chromatin. J. Biol. Chem. 281: 12760—12766. PMID 16517599 DOI:10.1074/jbc.M513462200
Couture J.-F., Collazo E., Brunzelle J.S., Trievel R.C. (2005). Structural and functional analysis of SET8, a histone H4 'Lys-20' methyltransferase. Genes Dev. 19: 1455—1465. PMID 15933070 DOI:10.1101/gad.1318405

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29489 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9NQR1 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29489 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9NQR1 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]