L1TD1

L1TD1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2LR6, 3SOO
Ідентифікатори
Символи	L1TD1, ECAT11, LINE-1 type transposase domain containing 1, LINE1 type transposase domain containing 1
Зовнішні ІД	MGI: 3578435 HomoloGene: 136289 GeneCards: L1TD1
Онтологія гена Молекулярна функція • single-stranded RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • transposition, RNA-mediated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54596	381591
Ensembl	ENSG00000240563	ENSMUSG00000087166
UniProt	Q5T7N2	Q587J6
RefSeq (мРНК)	NM_019079 NM_001164835	NM_001081202
RefSeq (білок)	NP_001158307 NP_061952	NP_001074671
Локус (UCSC)	Хр. 1: 62.19 – 62.21 Mb	Хр. 4: 98.61 – 98.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

L1TD1 (англ. LINE1 type transposase domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 865 амінокислот, а молекулярна маса — 98 850.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDVSTSVQS		KFARLAKKKE		NITYMKREQL		TETDKDIAPV		LDLKCKDVSA
IMNKFKVLME		IQDLMFEEMR		ETLKNDLKAV		LGGKATIPEV		KNSENSSSRT
EFQQIINLAL		QKTGMVGKIE		GENSKIGDDN		ENLTFKLEVN		ELSGKLDNTN
EYNSNDGKKL		PQGESRSYEV		MGSMEETLCN		IDDRDGNRNV		HLEFTERESR
KDGEDEFVKE		MREERKFQKL		KNKEEVLKAS		REEKVLMDEG		AVLTLVADLS
SATLDISKQW		SNVFNILREN		DFEPKFLCEV		KLAFKCDGEI		KTFSDLQSLR
KFASQKSSVK		ELLKDVLPQK		EEINQGGRKY		GIQEKRDKTL		IDSKHRAGEI
TSDGLSFLFL		KEVKVAKPEE		MKNLETQEEE		FSELEELDEE		ASGMEDDEDT
SGLEEEEEEP		SGLEEEEEEE		ASGLEEDEAS		GLEEEEEQTS		EQDSTFQGHT
LVDAKHEVEI		TSDGMETTFI		DSVEDSESEE		EEEGKSSETG		KVKTTSLTEK
KASRRQKEIP		FSYLVGDSGK		KKLVKHQVVH		KTQEEEETAV		PTSQGTGTPC
LTLCLASPSK		SLEMSHDEHK		KHSHTNLSIS		TGVTKLKKTE		EKKHRTLHTE
ELTSKEADLT		EETEENLRSS		VINSIREIKE		EIGNLKSSHS		GVLEIENSVD
DLSSRMDILE		ERIDSLEDQI		EEFSKDTMQM		TKQIISKERQ		RDIEERSRSC
NIRLIGIPEK		ESYENRAEDI		IKEIIDENFA		ELKKGSSLEI		VSACRVPSKI
DEKRLTPRHI		LVKFWNSSDK		EKIIRASRER		REITYQGTRI		RLTADLSLDT
LDARSKWSNV		FKVLLEKGFN		PRILYPAKMA		FDFRGKTKVF		LSIEEFRDYV
LHMPTLRELL		GNNIP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1