LDB2

LDB2
Ідентифікатори
Символи	LDB2, CLIM1, LDB1, LDB-2, LIM domain binding 2
Зовнішні ІД	OMIM: 603450 MGI: 894670 HomoloGene: 989 GeneCards: LDB2
Онтологія гена Молекулярна функція • enzyme binding • LIM domain binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • transcription regulator complex • cell leading edge • ядерце • клітинна мембрана Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • hair follicle development • positive regulation of cellular component biogenesis • epithelial structure maintenance • somatic stem cell population maintenance • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of kinase activity • regulation of cell migration • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • multicellular organism development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9079	16826
Ensembl	ENSG00000169744	ENSMUSG00000039706
UniProt	O43679	O55203
RefSeq (мРНК)	NM_001130834 NM_001290 NM_001304434 NM_001304435	NM_001077398 NM_001286348 NM_010698 NM_001347349 NM_001359070 NM_001359071
RefSeq (білок)	NP_001124306 NP_001281 NP_001291363 NP_001291364	NP_001070866 NP_001273277 NP_001334278 NP_034828 NP_001345999 NP_001346000
Локус (UCSC)	Хр. 4: 16.5 – 16.9 Mb	Хр. 5: 44.63 – 44.96 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LDB2 (англ. LIM domain binding 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 373 амінокислот, а молекулярна маса — 42 793.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSTPHDPFY		SSPFGPFYRR		HTPYMVQPEY		RIYEMNKRLQ		SRTEDSDNLW
WDAFATEFFE		DDATLTLSFC		LEDGPKRYTI		GRTLIPRYFS		TVFEGGVTDL
YYILKHSKES		YHNSSITVDC		DQCTMVTQHG		KPMFTKVCTE		GRLILEFTFD
DLMRIKTWHF		TIRQYRELVP		RSILAMHAQD		PQVLDQLSKN		ITRMGLTNFT
LNYLRLCVIL		EPMQELMSRH		KTYNLSPRDC		LKTCLFQKWQ		RMVAPPAEPT
RQPTTKRRKR		KNSTSSTSNS		SAGNNANSTG		SKKKTTAANL		SLSSQVPDVM
VVGEPTLMGG		EFGDEDERLI		TRLENTQYDA		ANGMDDEEDF		NNSPALGNNS
PWNSKPPATQ		ETKSENPPPQ		ASQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Semina E.V., Altherr M.R., Murray J.C. (1998). Cloning and chromosomal localization of two novel human genes encoding LIM-domain binding factors CLIM1 and CLIM2/LDB1/NLI. Mamm. Genome. 9: 921—924. PMID 9799849 DOI:10.1007/s003359900899
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4