LDB3

LDB3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4YDP
Ідентифікатори
Символи	LDB3, CMD1C, CMPD3, CYPHER, LDB3Z1, LDB3Z4, LVNC3, MFM4, ORACLE, PDLIM6, ZASP, CMH24, LIM domain binding 3
Зовнішні ІД	OMIM: 605906 MGI: 1344412 HomoloGene: 134626 GeneCards: LDB3
Пов'язані генетичні захворювання
dilated cardiomyopathy 1C, myofibrillar myopathy 4, гіпертрофічна кардіоміопатія
Онтологія гена Молекулярна функція • cytoskeletal protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • muscle alpha-actinin binding • protein kinase C binding • actin binding Клітинна компонента • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • cell projection • Псевдоподія • Z disc • цитоскелет • stress fiber • filamentous actin Біологічний процес • sarcomere organization • heart development • actin cytoskeleton organization • muscle structure development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11155	24131
Ensembl	ENSG00000122367	ENSMUSG00000021798
UniProt	O75112	Q9JKS4
RefSeq (мРНК)	NM_001080114 NM_001080115 NM_001080116 NM_001171610 NM_001171611 NM_007078 NM_001368063 NM_001368064 NM_001368065 NM_001368066 NM_001368067 NM_001368068	NM_001039071 NM_001039072 NM_001039073 NM_001039074 NM_001039075 NM_001039076 NM_011918
RefSeq (білок)	NP_001073583 NP_001073584 NP_001073585 NP_001165081 NP_001165082 NP_009009 NP_001354992 NP_001354993 NP_001354994 NP_001354995 NP_001354996 NP_001354997	NP_001034160 NP_001034161 NP_001034162 NP_001034163 NP_001034164 NP_001034165 NP_036048
Локус (UCSC)	Хр. 10: 86.67 – 86.74 Mb	Хр. 14: 34.25 – 34.31 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LDB3 (англ. LIM domain binding 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 727 амінокислот, а молекулярна маса — 77 135.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSYSVTLTGP		GPWGFRLQGG		KDFNMPLTIS		RITPGSKAAQ		SQLSQGDLVV
AIDGVNTDTM		THLEAQNKIK		SASYNLSLTL		QKSKRPIPIS		TTAPPVQTPL
PVIPHQKDPA		LDTNGSLVAP		SPSPEARASP		GTPGTPELRP		TFSPAFSRPS
AFSSLAEASD		PGPPRASLRA		KTSPEGARDL		LGPKALPGSS		QPRQYNNPIG
LYSAETLREM		AQMYQMSLRG		KASGVGLPGG		SLPIKDLAVD		SASPVYQAVI
KSQNKPEDEA		DEWARRSSNL		QSRSFRILAQ		MTGTEFMQDP		DEEALRRSST
PIEHAPVCTS		QATTPLLPAS		AQPPAAASPS		AASPPLATAA		AHTAIASAST
TAPASSPADS		PRPQASSYSP		AVAASSAPAT		HTSYSEGPAA		PAPKPRVVTT
ASIRPSVYQP		VPASTYSPSP		GANYSPTPYT		PSPAPAYTPS		PAPAYTPSPV
PTYTPSPAPA		YTPSPAPNYN		PAPSVAYSGG		PAEPASRPPW		VTDDSFSQKF
APGKSTTSIS		KQTLPRGGPA		YTPAGPQVPP		LARGTVQRAE		RFPASSRTPL
CGHCNNVIRG		PFLVAMGRSW		HPEEFTCAYC		KTSLADVCFV		EEQNNVYCER
CYEQFFAPLC		AKCNTKIMGE		VMHALRQTWH		TTCFVCAACK		KPFGNSLFHM
EDGEPYCEKD		YINLFSTKCH		GCDFPVEAGD		KFIEALGHTW		HDTCFICAVC
HVNLEGQPFY		SKKDRPLCKK		HAHTINL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Frey N., Olson E.N. (2002). Calsarcin-3, a novel skeletal muscle-specific member of the calsarcin family, interacts with multiple Z-disc proteins. J. Biol. Chem. 277: 13998—14004. PMID 11842093 DOI:10.1074/jbc.M200712200
• Selcen D., Engel A.G. (2005). Mutations in ZASP define a novel form of muscular dystrophy in humans. Ann. Neurol. 57: 269—276. PMID 15668942 DOI:10.1002/ana.20376

Див. також

• Хромосома 10