LIN7B

LIN7B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DKR
Ідентифікатори
Символи	LIN7B, LIN-7B, MALS-2, MALS2, VELI2, lin-7 homolog B, crumbs cell polarity complex component
Зовнішні ІД	OMIM: 612331 MGI: 1330858 HomoloGene: 22648 GeneCards: LIN7B
Онтологія гена Молекулярна функція • PDZ domain binding • protein domain specific binding • L27 domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • postsynaptic membrane • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • мембрана • cell-cell junction • bicellular tight junction • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • basolateral plasma membrane • neuron projection • presynapse • синапс • MPP7-DLG1-LIN7 complex Біологічний процес • protein localization to basolateral plasma membrane • maintenance of epithelial cell apical/basal polarity • protein transport • GO:0010554 neurotransmitter secretion • екзоцитоз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64130	22342
Ensembl	ENSG00000104863	ENSMUSG00000003872
UniProt	Q9HAP6	O88951
RefSeq (мРНК)	NM_001308419 NM_022165	NM_011698
RefSeq (білок)	NP_001295348 NP_071448	NP_035828
Локус (UCSC)	Хр. 19: 49.11 – 49.12 Mb	Хр. 7: 45.02 – 45.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LIN7B (англ. Lin-7 homolog B, crumbs cell polarity complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 207 амінокислот, а молекулярна маса — 22 896.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAALVEPLGL		ERDVSRAVEL		LERLQRSGEL		PPQKLQALQR		VLQSRFCSAI
REVYEQLYDT		LDITGSAEIR		AHATAKATVA		AFTASEGHAH		PRVVELPKTD
EGLGFNIMGG		KEQNSPIYIS		RVIPGGVADR		HGGLKRGDQL		LSVNGVSVEG
EQHEKAVELL		KAAQGSVKLV		VRYTPRVLEE		MEARFEKMRS		ARRRQQHQSY
SSLESRG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, екзоцитоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах, синапсах, синаптосомах.

Література

• Olsen O., Liu H., Wade J.B., Merot J., Welling P.A. (2002). Basolateral membrane expression of the Kir 2.3 channel is coordinated by PDZ interaction with Lin-7/CASK complex. Am. J. Physiol. 282: C183—C195. PMID 11742811 DOI:10.1152/ajpcell.00249.2001
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hruska-Hageman A.M., Benson C.J., Leonard A.S., Price M.P., Welsh M.J. (2004). PSD-95 and Lin-7b interact with acid-sensing ion channel-3 and have opposite effects on H+- gated current. J. Biol. Chem. 279: 46962—46968. PMID 15317815 DOI:10.1074/jbc.M405874200
• Bohl J., Brimer N., Lyons C., Vande Pol S.B. (2007). The stardust family protein MPP7 forms a tripartite complex with LIN7 and DLG1 that regulates the stability and localization of DLG1 to cell junctions. J. Biol. Chem. 282: 9392—9400. PMID 17237226 DOI:10.1074/jbc.M610002200

Див. також

• Хромосома 19