LRRC7

LRRC7
Ідентифікатори
Символи	LRRC7, DENSIN, leucine rich repeat containing 7
Зовнішні ІД	OMIM: 614453 MGI: 2676665 HomoloGene: 10817 GeneCards: LRRC7
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння, Розщеплення піднебіння, артеріальна гіпертензія, розлад дефіциту уваги та гіперактивності
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ionotropic glutamate receptor binding;
Клітинна компонента	• міжклітинні контакти; • postsynaptic membrane; • синапс; • мембрана; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення; • extracellular region; • specific granule lumen; • цитоплазма; • клітинна мембрана; • neuron projection; • cell-cell junction; • ionotropic glutamate receptor complex; • basolateral plasma membrane; • axon initial segment; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• neutrophil degranulation; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • positive regulation of neuron projection development; • receptor clustering; • establishment or maintenance of epithelial cell apical/basal polarity; • receptor localization to synapse; • cell-cell adhesion; • neurotransmitter receptor transport, endosome to postsynaptic membrane; • neurotransmitter receptor transport postsynaptic membrane to endosome; • MAPK cascade; • regulation of NMDA receptor activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	57554
	242274
	ENSG00000033122
	ENSMUSG00000028176
	Q96NW7
	Q80TE7
NM_020794; NM_001330635; NM_001350216; NM_001366836; NM_001366837;
	NM_001366838; NM_001366839; NM_001366840; NM_001366841; NM_001366842; NM_001370785
	NM_001081358; NM_001291452; NM_001291453; NM_001370781; NM_001370782
NP_001317564; NP_001337145; NP_001353765; NP_001353766; NP_001353767;
	NP_001353768; NP_001353769; NP_001353770; NP_001353771; NP_001357714
	NP_001074827; NP_001278381; NP_001278382; NP_001357710; NP_001357711
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LRRC7 (англ. Leucine rich repeat containing 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 537 амінокислот, а молекулярна маса — 172 581^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTTKRKIIGR	LVPCRCFRGE	EEIISVLDYS	HCSLQQVPKE	VFNFERTLEE
LYLDANQIEE	LPKQLFNCQA	LRKLSIPDND	LSNLPTTIAS	LVNLKELDIS
KNGVQEFPEN	IKCCKCLTII	EASVNPISKL	PDGFTQLLNL	TQLYLNDAFL
EFLPANFGRL	VKLRILELRE	NHLKTLPKSM	HKLAQLERLD	LGNNEFGELP
EVLDQIQNLR	ELWMDNNALQ	VLPGSIGKLK	MLVYLDMSKN	RIETVDMDIS
GCEALEDLLL	SSNMLQQLPD	SIGLLKKLTT	LKVDDNQLTM	LPNTIGNLSL
LEEFDCSCNE	LESLPSTIGY	LHSLRTLAVD	ENFLPELPRE	IGSCKNVTVM
SLRSNKLEFL	PEEIGQMQKL	RVLNLSDNRL	KNLPFSFTKL	KELAALWLSD
NQSKALIPLQ	TEAHPETKQR	VLTNYMFPQQ	PRGDEDFQSD	SDSFNPTLWE
EQRQQRMTVA	FEFEDKKEDD	ENAGKVKDLS	CQAPWERGQR	GITLQPARLS
GDCCTPWARC	DQQIQDMPVP	QNDPQLAWGC	ISGLQQERSM	CTPLPVAAQS
TTLPSLSGRQ	VEINLKRYPT	PYPEDLKNMV	KSVQNLVGKP	SHGVRVENSN
PTANTEQTVK	EKYEHKWPVA	PKEITVEDSF	VHPANEMRIG	ELHPSLAETP
LYPPKLVLLG	KDKKESTDES	EVDKTHCLNN	SVSSGTYSDY	SPSQASSGSS
NTRVKVGSLQ	TTAKDAVHNS	LWGNRIAPSF	PQPLDSKPLL	SQREAVPPGN
IPQRPDRLPM	SDTFTDNWTD	GSHYDNTGFV	AEETTAENAN	SNPLLSSKSR
STSSHGRRPL	IRQDRIVGVP	LELEQSTHRH	TPETEVPPSN	PWQNWTRTPS
PFEDRTAFPS	KLETTPTTSP	LPERKEHIKE	STEIPSPFSP	GVPWEYHDSN
PNRSLSNVFS	QIHCRPESSK	GVISISKSTE	RLSPLMKDIK	SNKFKKSQSI
DEIDIGTYKV	YNIPLENYAS	GSDHLGSHER	PDKMLGPEHG	MSSMSRSQSV
PMLDDEMLTY	GSSKGPQQQK	ASMTKKVYQF	DQSFNPQGSV	EVKAEKRIPP
PFQHNPEYVQ	QASKNIAKDL	ISPRAYRGYP	PMEQMFSFSQ	PSVNEDAVVN
AQFASQGARA	GFLRRADSLV	SATEMAMFRR	VNEPHELPPT	DRYGRPPYRG
GLDRQSSVTV	TESQFLKRNG	RYEDEHPSYQ	EVKAQAGSFP	VKNLTQRRPL
SARSYSTESY	GASQTRPVSA	RPTMAALLEK	IPSDYNLGNY	GDKPSDNSDL
KTRPTPVKGE	ESCGKMPADW	RQQLLRHIEA	RRLDRNAAYK	HNTVNLGMLP
YGGISAMHAG	RSMTLNLQTK	SKFDHQELPL	QKTPSQQSNI	LDNGQEDVSP
SGQWNPYPLG	RRDVPPDTIT	KKAGSHIQTL	MGSQSLQHRS	REQQPYEGNI
NKVTIQQFQS	PLPIQIPSSQ	ATRGPQPGRC	LIQTKGQRSM	DGYPEQFCVR
IEKNPGLGFS	ISGGISGQGN	PFKPSDKGIF	VTRVQPDGPA	SNLLQPGDKI
LQANGHSFVH	MEHEKAVLLL	KSFQNTVDLV	IQRELTV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Izawa I., Nishizawa M., Ohtakara K., Inagaki M. (2002). Densin-180 interacts with delta-catenin/neural plakophilin-related armadillo repeat protein at synapses. J. Biol. Chem. 277: 5345—5350. PMID 11729199 doi:10.1074/jbc.M110052200
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 doi:10.1093/dnares/7.1.65

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з LRRC7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18531 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q96NW7 (англ.) . Архів оригіналу за 9 лютого 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з LRRC7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18531 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q96NW7 (англ.) . Архів оригіналу за 9 лютого 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]