MINDY1

MINDY1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5JKN, 5JQS
Ідентифікатори
Символи	MINDY1, FAM63A, MINDY lysine 48 deubiquitinase 1, MINDY-1
Зовнішні ІД	OMIM: 618407 MGI: 1922257 HomoloGene: 32409 GeneCards: MINDY1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cysteine-type carboxypeptidase activity • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • Lys48-specific deubiquitinase activity • K48-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця • гіалоплазма Біологічний процес • protein K48-linked deubiquitination • протеоліз • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55793	75007
Ensembl	ENSG00000143409	ENSMUSG00000038712
UniProt	Q8N5J2	Q76LS9
RefSeq (мРНК)	NM_001040217 NM_001163258 NM_001163259 NM_001163260 NM_018379 NM_001319998 NM_001376664 NM_001376665 NM_001376666 NM_001376667 NM_001376668 NM_001376669 NM_001376670 NM_001376671 NM_001376672 NM_001376673 NM_001376674	NM_133858 NM_199475
RefSeq (білок)	NP_001035307 NP_001156730 NP_001156731 NP_001156732 NP_001306927 NP_060849 NP_001363593 NP_001363594 NP_001363595 NP_001363596 NP_001363597 NP_001363598 NP_001363599 NP_001363600 NP_001363601 NP_001363602 NP_001363603	NP_598619 NP_955769
Локус (UCSC)	Хр. 1: 151 – 151.01 Mb	Хр. 3: 95.19 – 95.2 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MINDY1 (англ. MINDY lysine 48 deubiquitinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 469 амінокислот, а молекулярна маса — 51 778.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEYHQPEDPA		PGKAGTAEAV		IPENHEVLAG		PDEHPQDTDA		RDADGEARER
EPADQALLPS		QCGDNLESPL		PEASSAPPGP		TLGTLPEVET		IRACSMPQEL
PQSPRTRQPE		PDFYCVKWIP		WKGEQTPIIT		QSTNGPCPLL		AIMNILFLQW
KVKLPPQKEV		ITSDELMAHL		GNCLLSIKPQ		EKSEGLQLNF		QQNVDDAMTV
LPKLATGLDV		NVRFTGVSDF		EYTPECSVFD		LLGIPLYHGW		LVDPQSPEAV
RAVGKLSYNQ		LVERIITCKH		SSDTNLVTEG		LIAEQFLETT		AAQLTYHGLC
ELTAAAKEGE		LSVFFRNNHF		STMTKHKSHL		YLLVTDQGFL		QEEQVVWESL
HNVDGDSCFC		DSDFHLSHSL		GKGPGAEGGS		GSPETQLQVD		QDYLIALSLQ
QQQPRGPLGL		TDLELAQQLQ		QEEYQQQQAA		QPVRMRTRVL		SLQGRGATSG
RPAGERRQRP		KHESDCILL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 doi:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Kristariyanto Y.A., Abdul Rehman S.A., Weidlich S., Knebel A., Kulathu Y. (2017). A single MIU motif of MINDY-1 recognizes K48-linked polyubiquitin chains. EMBO Rep. 18: 392—402. PMID 28082312 doi:10.15252/embr.201643205

Див. також

• Хромосома 1