MINDY2

MINDY2
Ідентифікатори
Символи	MINDY2, FAM63B, MINDY lysine 48 deubiquitinase 2
Зовнішні ІД	OMIM: 618408 MGI: 2443086 HomoloGene: 101023 GeneCards: MINDY2
Онтологія гена Молекулярна функція • thiol-dependent deubiquitinase • cysteine-type carboxypeptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • Lys48-specific deubiquitinase activity • K48-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • K11-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • K6-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • protein K48-linked deubiquitination • протеоліз • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54629	235461
Ensembl	ENSG00000128923	ENSMUSG00000042444
UniProt	Q8NBR6	Q6PDI6
RefSeq (мРНК)	NM_001040450 NM_001040453 NM_019092	NM_172772 NM_001374686
RefSeq (білок)	NP_001035540 NP_001035543	NP_766360 NP_001361615
Локус (UCSC)	Хр. 15: 58.77 – 58.86 Mb	Хр. 9: 70.51 – 70.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MINDY2 (англ. MINDY lysine 48 deubiquitinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 621 амінокислот, а молекулярна маса — 67 106.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESSPESLQP		LEHGVAAGPA		SGTGSSQEGL		QETRLAAGDG		PGVWAAETSG
GNGLGAAAAR		RSLPDSASPA		GSPEVPGPCS		SSAGLDLKDS		GLESPAAAEA
PLRGQYKVTA		SPETAVAGVG		HELGTAGDAG		ARPDLAGTCQ		AELTAAGSEE
PSSAGGLSSS		CSDPSPPGES		PSLDSLESFS		NLHSFPSSCE		FNSEEGAENR
VPEEEEGAAV		LPGAVPLCKE		EEGEETAQVL		AASKERFPGQ		SVYHIKWIQW
KEENTPIITQ		NENGPCPLLA		ILNVLLLAWK		VKLPPMMEII		TAEQLMEYLG
DYMLDAKPKE		ISEIQRLNYE		QNMSDAMAIL		HKLQTGLDVN		VRFTGVRVFE
YTPECIVFDL		LDIPLYHGWL		VDPQIDDIVK		AVGNCSYNQL		VEKIISCKQS
DNSELVSEGF		VAEQFLNNTA		TQLTYHGLCE		LTSTVQEGEL		CVFFRNNHFS
TMTKYKGQLY		LLVTDQGFLT		EEKVVWESLH		NVDGDGNFCD		SEFHLRPPSD
PETVYKGQQD		QIDQDYLMAL		SLQQEQQSQE		INWEQIPEGI		SDLELAKKLQ
EEEDRRASQY		YQEQEQAAAA		AAAASTQAQQ		GQPAQASPSS		GRQSGNSERK
RKEPREKDKE		KEKEKNSCVI		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Kristariyanto Y.A., Abdul Rehman S.A., Weidlich S., Knebel A., Kulathu Y. (2017). A single MIU motif of MINDY-1 recognizes K48-linked polyubiquitin chains. EMBO Rep. 18: 392—402. PMID 28082312 doi:10.15252/embr.201643205

Див. також

• Хромосома 15