MYSM1

MYSM1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CU7, 2DCE
Ідентифікатори
Символи	MYSM1, 2A-DUB, 2ADUB, Myb like, SWIRM and MPN domains 1, BMFS4
Зовнішні ІД	OMIM: 612176 MGI: 2444584 HomoloGene: 66204 GeneCards: MYSM1
Пов'язані генетичні захворювання
діабетична ретинопатія
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0031493 histone binding • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • зв'язування з іоном металу • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • клітинна мембрана • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • regulation of hair follicle development • ремоделювання хроматину • regulation of cell migration • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • протеоліз • monoubiquitinated histone H2A deubiquitination • pigmentation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • regulation of hemopoiesis • protein deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	114803	320713
Ensembl	ENSG00000162601	ENSMUSG00000062627
UniProt	Q5VVJ2	Q69Z66
RefSeq (мРНК)	NM_001085487	NM_177239
RefSeq (білок)	NP_001078956	NP_796213
Локус (UCSC)	Хр. 1: 58.64 – 58.7 Mb	Хр. 4: 94.83 – 94.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MYSM1 (англ. Myb like, SWIRM and MPN domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 828 амінокислот, а молекулярна маса — 95 032.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAEEADVDI		EGDVVAAAGA		QPGSGENTAS		VLQKDHYLDS		SWRTENGLIP
WTLDNTISEE		NRAVIEKMLL		EEEYYLSKKS		QPEKVWLDQK		EDDKKYMKSL
QKTAKIMVHS		PTKPASYSVK		WTIEEKELFE		QGLAKFGRRW		TKISKLIGSR
TVLQVKSYAR		QYFKNKVKCG		LDKETPNQKT		GHNLQVKNED		KGTKAWTPSC
LRGRADPNLN		AVKIEKLSDD		EEVDITDEVD		ELSSQTPQKN		SSSDLLLDFP
NSKMHETNQG		EFITSDSQEA		LFSKSSRGCL		QNEKQDETLS		SSEITLWTEK
QSNGDKKSIE		LNDQKFNELI		KNCNKHDGRG		IIVDARQLPS		PEPCEIQKNL
NDNEMLFHSC		QMVEESHEEE		ELKPPEQEIE		IDRNIIQEEE		KQAIPEFFEG
RQAKTPERYL		KIRNYILDQW		EICKPKYLNK		TSVRPGLKNC		GDVNCIGRIH
TYLELIGAIN		FGCEQAVYNR		PQTVDKVRIR		DRKDAVEAYQ		LAQRLQSMRT
RRRRVRDPWG		NWCDAKDLEG		QTFEHLSAEE		LAKRREEEKG		RPVKSLKVPR
PTKSSFDPFQ		LIPCNFFSEE		KQEPFQVKVA		SEALLIMDLH		AHVSMAEVIG
LLGGRYSEVD		KVVEVCAAEP		CNSLSTGLQC		EMDPVSQTQA		SETLAVRGFS
VIGWYHSHPA		FDPNPSLRDI		DTQAKYQSYF		SRGGAKFIGM		IVSPYNRNNP
LPYSQITCLV		ISEEISPDGS		YRLPYKFEVQ		QMLEEPQWGL		VFEKTRWIIE
KYRLSHSSVP		MDKIFRRDSD		LTCLQKLLEC		MRKTLSKVTN		CFMAEEFLTE
IENLFLSNYK		SNQENGVTEE		NCTKELLM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, активаторів, регуляторів хроматину, металопротеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179

Див. також

• Хромосома 1