NCF1

NCF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1GD5, 1K4U, 1KQ6, 1NG2, 1O7K, 1OV3, 1UEC, 1W70, 1WLP
Ідентифікатори
Символи	NCF1, NCF1A, NOXO2, SH3PXD1A, p47phox, Neutrophil cytosolic factor 1, CGD1
Зовнішні ІД	OMIM: 608512 MGI: 97283 HomoloGene: 30964 GeneCards: NCF1
Онтологія гена Молекулярна функція • superoxide-generating NAD(P)H oxidase activity • SH3 domain binding • phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • electron transfer activity • lipid binding • superoxide-generating NADPH oxidase activator activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • Фаголізосома • extrinsic component of membrane • дендрит (нейробіологія) • НАДФН-оксидаза • комплекс Ґольджі • rough endoplasmic reticulum • neuronal cell body • podosome • клітинна мембрана Біологічний процес • protein targeting to membrane • superoxide anion generation • cellular defense response • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • вроджений імунітет • superoxide metabolic process • GO:0097285 апоптоз • respiratory burst • podosome assembly • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species • positive regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of JNK cascade • cellular response to cadmium ion • positive regulation of p38MAPK cascade • Електронтранспортний ланцюг • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • cellular response to oxidative stress • cell redox homeostasis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	653361	17969
Ensembl	ENSG00000158517	ENSMUSG00000015950
UniProt	P14598	Q09014
RefSeq (мРНК)	NM_000265	NM_001286037 NM_010876
RefSeq (білок)	NP_000256	NP_001272966 NP_035006
Локус (UCSC)	Хр. 7: 74.77 – 74.79 Mb	Хр. 5: 134.25 – 134.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NCF1 (англ. Neutrophil cytosolic factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390 амінокислот, а молекулярна маса — 44 652.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGDTFIRHIA		LLGFEKRFVP		SQHYVYMFLV		KWQDLSEKVV		YRRFTEIYEF
HKTLKEMFPI		EAGAINPENR		IIPHLPAPKW		FDGQRAAENR		QGTLTEYCGT
LMSLPTKISR		CPHLLDFFKV		RPDDLKLPTD		NQTKKPETYL		MPKDGKSTAT
DITGPIILQT		YRAIANYEKT		SGSEMALSTG		DVVEVVEKSE		SGWWFCQMKA
KRGWIPASFL		EPLDSPDETE		DPEPNYAGEP		YVAIKAYTAV		EGDEVSLLEG
EAVEVIHKLL		DGWWVIRKDD		VTGYFPSMYL		QKSGQDVSQA		QRQIKRGAPP
RRSSIRNAHS		IHQRSRKRLS		QDAYRRNSVR		FLQQRRRQAR		PGPQSPGSPL
EEERQTQRSK		PQPAVPPRPS		ADLILNRCSE		STKRKLASAV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

• Volpp B.D., Nauseef W.M., Clark R.A. (1989). Cloning of the cDNA and functional expression of the 47-kilodalton cytosolic component of human neutrophil respiratory burst oxidase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 7195—7199. PMID 2550933 DOI:10.1073/pnas.86.18.7195
• Lomax K.J., Leto T.L., Nunoi H., Gallin J.I., Malech H.L. (1989). Recombinant 47-kilodalton cytosol factor restores NADPH oxidase in chronic granulomatous disease. Science. 245: 409—412. PMID 2547247 DOI:10.1126/science.2547247
• Rodaway A.R.F., Teahan C.G., Casimir C.M., Segal A.W., Bentley D.L. (1990). Characterization of the 47-kilodalton autosomal chronic granulomatous disease protein: tissue-specific expression and transcriptional control by retinoic acid. Mol. Cell. Biol. 10: 5388—5396. PMID 2398896 DOI:10.1128/MCB.10.10.5388
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening. BMC Immunol. 10: 53—53. PMID 19807924 DOI:10.1186/1471-2172-10-53
• Kleino I., Ortiz R.M., Yritys M., Huovila A.P., Saksela K. (2009). Alternative splicing of ADAM15 regulates its interactions with cellular SH3 proteins. J. Cell. Biochem. 108: 877—885. PMID 19718658 DOI:10.1002/jcb.22317

Див. також

• Хромосома 7