NOD2

NOD2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5IRL, 5IRM, 5IRN
Ідентифікатори
Символи	NOD2, ACUG, BLAU, CARD15, CD, CLR16.3, IBD1, NLRC2, NOD2B, PSORAS1, nucleotide binding oligomerization domain containing 2, BLAUS, YAOS
Зовнішні ІД	OMIM: 605956 MGI: 2429397 HomoloGene: 11156 GeneCards: NOD2
Пов'язані генетичні захворювання
Хвороба Крона, запальні захворювання кишківника, Blau syndrome, ентерит, неспецифічний виразковий коліт
Онтологія гена Молекулярна функція • Hsp90 protein binding • nucleotide binding • Hsp70 protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • peptidoglycan binding • enzyme binding • actin binding • CARD domain binding • ATP binding • protein kinase binding • muramyl dipeptide binding • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • везикула • мембрана • клітинна мембрана • cell surface • basolateral plasma membrane • COP9 signalosome • цитоскелет • комплекс Ґольджі • мітохондрія • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • positive regulation of prostaglandin-endoperoxide synthase activity • regulation of apoptotic process • defense response • detection of biotic stimulus • cytokine production involved in immune response • positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response • GO:0007243 intracellular signal transduction • detection of muramyl dipeptide • positive regulation of interleukin-10 production • positive regulation of epithelial cell proliferation • процес імунної системи • GO:1900490 positive regulation of oxidoreductase activity • response to muramyl dipeptide • positive regulation of prostaglandin-E synthase activity • positive regulation of JNK cascade • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity • positive regulation of gamma-delta T cell activation • cellular response to muramyl dipeptide • JNK cascade • negative regulation of macrophage apoptotic process • positive regulation of dendritic cell antigen processing and presentation • nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 signaling pathway • maintenance of gastrointestinal epithelium • defense response to bacterium • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of interleukin-8 production • detection of bacterium • positive regulation of interleukin-1 beta production • regulation of inflammatory response • positive regulation of interleukin-6 production • protein complex oligomerization • positive regulation of tumor necrosis factor production • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of B cell activation • positive regulation of interleukin-17 production • positive regulation of type 2 immune response • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway • positive regulation of stress-activated MAPK cascade • positive regulation of Notch signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • positive regulation of cell population proliferation • вроджений імунітет • response to nutrient • positive regulation of dendritic cell cytokine production • positive regulation of protein K63-linked ubiquitination • cellular response to peptidoglycan • positive regulation of MAP kinase activity • interleukin-1-mediated signaling pathway • cellular response to lipopolysaccharide Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64127	257632
Ensembl	ENSG00000167207	ENSMUSG00000055994
UniProt	Q9HC29	Q80SY9
RefSeq (мРНК)	NM_001293557 NM_022162 NM_001370466	NM_145857
RefSeq (білок)	NP_001280486 NP_071445 NP_001357395	NP_665856
Локус (UCSC)	Хр. 16: 50.69 – 50.73 Mb	Хр. 8: 89.37 – 89.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NOD2 (англ. Nucleotide binding oligomerization domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 040 амінокислот, а молекулярна маса — 115 283.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGEEGGSASH		DEEERASVLL		GHSPGCEMCS		QEAFQAQRSQ		LVELLVSGSL
EGFESVLDWL		LSWEVLSWED		YEGFHLLGQP		LSHLARRLLD		TVWNKGTWAC
QKLIAAAQEA		QADSQSPKLH		GCWDPHSLHP		ARDLQSHRPA		IVRRLHSHVE
NMLDLAWERG		FVSQYECDEI		RLPIFTPSQR		ARRLLDLATV		KANGLAAFLL
QHVQELPVPL		ALPLEAATCK		KYMAKLRTTV		SAQSRFLSTY		DGAETLCLED
IYTENVLEVW		ADVGMAGPPQ		KSPATLGLEE		LFSTPGHLND		DADTVLVVGE
AGSGKSTLLQ		RLHLLWAAGQ		DFQEFLFVFP		FSCRQLQCMA		KPLSVRTLLF
EHCCWPDVGQ		EDIFQLLLDH		PDRVLLTFDG		FDEFKFRFTD		RERHCSPTDP
TSVQTLLFNL		LQGNLLKNAR		KVVTSRPAAV		SAFLRKYIRT		EFNLKGFSEQ
GIELYLRKRH		HEPGVADRLI		RLLQETSALH		GLCHLPVFSW		MVSKCHQELL
LQEGGSPKTT		TDMYLLILQH		FLLHATPPDS		ASQGLGPSLL		RGRLPTLLHL
GRLALWGLGM		CCYVFSAQQL		QAAQVSPDDI		SLGFLVRAKG		VVPGSTAPLE
FLHITFQCFF		AAFYLALSAD		VPPALLRHLF		NCGRPGNSPM		ARLLPTMCIQ
ASEGKDSSVA		ALLQKAEPHN		LQITAAFLAG		LLSREHWGLL		AECQTSEKAL
LRRQACARWC		LARSLRKHFH		SIPPAAPGEA		KSVHAMPGFI		WLIRSLYEMQ
EERLARKAAR		GLNVGHLKLT		FCSVGPTECA		ALAFVLQHLR		RPVALQLDYN
SVGDIGVEQL		LPCLGVCKAL		YLRDNNISDR		GICKLIECAL		HCEQLQKLAL
FNNKLTDGCA		HSMAKLLACR		QNFLALRLGN		NYITAAGAQV		LAEGLRGNTS
LQFLGFWGNR		VGDEGAQALA		EALGDHQSLR		WLSLVGNNIG		SVGAQALALM
LAKNVMLEEL		CLEENHLQDE		GVCSLAEGLK		KNSSLKILKL		SNNCITYLGA
EALLQALERN		DTILEVWLRG		NTFSLEEVDK		LGCRDTRLLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

• Lee K.H., Biswas A., Liu Y.J., Kobayashi K.S. (2012). Proteasomal degradation of Nod2 protein mediates tolerance to bacterial cell wall components. J. Biol. Chem. 287: 39800—39811. PMID 23019338 DOI:10.1074/jbc.M112.410027
• Menning M., Kufer T.A. (2013). A role for the Ankyrin repeat containing protein Ankrd17 in Nod1- and Nod2-mediated inflammatory responses. FEBS Lett. 587: 2137—2142. PMID 23711367 DOI:10.1016/j.febslet.2013.05.037
• Parkhouse R., Boyle J.P., Monie T.P. (2014). Blau syndrome polymorphisms in NOD2 identify nucleotide hydrolysis and helical domain 1 as signalling regulators. FEBS Lett. 588: 3382—3389. PMID 25093298 DOI:10.1016/j.febslet.2014.07.029
• Mohanan V., Grimes C.L. (2014). The molecular chaperone HSP70 binds to and stabilizes NOD2, an important protein involved in Crohn disease. J. Biol. Chem. 289: 18987—18998. PMID 24790089 DOI:10.1074/jbc.M114.557686
• Milman N., Ursin K., Rodevand E., Nielsen F.C., Hansen T.V. (2009). A novel mutation in the NOD2 gene associated with Blau syndrome: a Norwegian family with four affected members. Scand. J. Rheumatol. 38: 190—197. PMID 19169908 DOI:10.1080/03009740802464194
• Zeybek C., Basbozkurt G., Gul D., Demirkaya E., Gok F. (2015). A new mutation in blau syndrome. Case Rep. Rheumatol. 2015: 463959—463959. PMID 25692065 DOI:10.1155/2015/463959

Див. також

• Хромосома 16