NSUN4

NSUN4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4FP9, 4FZV
Ідентифікатори
Символи	NSUN4, SHTAP, NOP2/Sun RNA methyltransferase family member 4, NOP2/Sun RNA methyltransferase 4
Зовнішні ІД	OMIM: 615394 MGI: 1919431 HomoloGene: 12455 GeneCards: NSUN4
Онтологія гена Молекулярна функція • rRNA binding • small ribosomal subunit rRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transferase activity • RNA binding • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • rRNA (cytosine-C5-)-methyltransferase activity Клітинна компонента • велика субодиниця мітохондріальної рибосоми • мітохондрія • мітохондріальний матрикс Біологічний процес • mature ribosome assembly • Метилювання • ribosome biogenesis • rRNA processing • positive regulation of mitochondrial translation • rRNA methylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	387338	72181
Ensembl	ENSG00000117481	ENSMUSG00000028706
UniProt	Q96CB9	Q9CZ57
RefSeq (мРНК)	NM_001256127 NM_001256128 NM_199044	NM_028142 NM_001369075 NM_001369076
RefSeq (білок)	NP_001243056 NP_001243057 NP_950245	NP_082418 NP_001356004 NP_001356005 NP_082418.1
Локус (UCSC)	Хр. 1: 46.34 – 46.37 Mb	Хр. 4: 115.89 – 115.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NSUN4 (англ. NOP2/Sun RNA methyltransferase family member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 384 амінокислот, а молекулярна маса — 43 089.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAALTLRGVR		ELLKRVDLAT		VPRRHRYKKK		WAATEPKFPA		VRLALQNFDM
TYSVQFGDLW		PSIRVSLLSE		QKYGALVNNF		AAWDHVSAKL		EQLSAKDFVN
EAISHWELQS		EGGQSAAPSP		ASWACSPNLR		CFTFDRGDIS		RFPPARPGSL
GVMEYYLMDA		ASLLPVLALG		LQPGDIVLDL		CAAPGGKTLA		LLQTGCCRNL
AANDLSPSRI		ARLQKILHSY		VPEEIRDGNQ		VRVTSWDGRK		WGELEGDTYD
RVLVDVPCTT		DRHSLHEEEN		NIFKRSRKKE		RQILPVLQVQ		LLAAGLLATK
PGGHVVYSTC		SLSHLQNEYV		VQGAIELLAN		QYSIQVQVED		LTHFRRVFMD
TFCFFSSCQV		GELVIPNLMA		NFGPMYFCKM		RRLT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг рРНК, біогенез рибосом, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК, рРНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Spahr H., Habermann B., Gustafsson C.M., Larsson N.G., Hallberg B.M. (2012). Structure of the human MTERF4-NSUN4 protein complex that regulates mitochondrial ribosome biogenesis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 109: 15253—15258. PMID 22949673 doi:10.1073/pnas.1210688109

Див. також

• Хромосома 1