NUFIP1

NUFIP1
Ідентифікатори
Символи	NUFIP1, NUFIP, bA540M5.1, FMR1 interacting protein 1, nuclear FMR1 interacting protein 1, Rsa1
Зовнішні ІД	OMIM: 604354 MGI: 1351474 HomoloGene: 8216 GeneCards: NUFIP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATPase binding • identical protein binding • protein-macromolecule adaptor activity • snoRNA binding • RNA binding • зв'язування з іоном металу • DNA binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • nuclear matrix • клітинне ядро • pre-snoRNP complex • perichromatin fibrils • ядерце • cytosolic ribosome • transcription elongation factor complex • fibrillar center • presynaptic active zone • GO:0009327 protein-containing complex • синапс Біологічний процес • box C/D snoRNP assembly • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • protein complex oligomerization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26747	27275
Ensembl	ENSG00000083635	ENSMUSG00000022009
UniProt	Q9UHK0	Q9QXX8
RefSeq (мРНК)	NM_012345	NM_013745
RefSeq (білок)	NP_036477	NP_038773
Локус (UCSC)	Хр. 13: 44.94 – 44.99 Mb	Хр. 14: 76.35 – 76.37 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NUFIP1 (англ. NUFIP1, FMR1 interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 495 амінокислот, а молекулярна маса — 56 300.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEPTSDFET		PIGWHASPEL		TPTLGPLSDT		APPRDSWMFW		AMLPPPPPPL
TSSLPAAGSK		PSSESQPPME		AQSLPGAPPP		FDAQILPGAQ		PPFDAQSPLD
SQPQPSGQPW		NFHASTSWYW		RQSSDRFPRH		QKSFNPAVKN		SYYPRKYDAK
FTDFSLPPSR		KQKKKKRKEP		VFHFFCDTCD		RGFKNQEKYD		KHMSEHTKCP
ELDCSFTAHE		KIVQFHWRNM		HAPGMKKIKL		DTPEEIARWR		EERRKNYPTL
ANIERKKKLK		LEKEKRGAVL		TTTQYGKMKG		MSRHSQMAKI		RSPGKNHKWK
NDNSRQRAVT		GSGSHLCDLK		LEGPPEANAD		PLGVLINSDS		ESDKEEKPQH
SVIPKEVTPA		LCSLMSSYGS		LSGSESEPEE		TPIKTEADVL		AENQVLDSSA
PKSPSQDVKA		TVRNFSEAKS		ENRKKSFEKT		NPKRKKDYHN		YQTLFEPRTH
HPYLLEMLLA		PDIRHERNVI		LQCVRYIIKK		DFFGLDTNSA		KSKDV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Bardoni B., Schenck A., Mandel J.-L. (1999). A novel RNA-binding nuclear protein that interacts with the fragile X mental retardation (FMR1) protein. Hum. Mol. Genet. 8: 2557—2566. PMID 10556305 DOI:10.1093/hmg/8.13.2557
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 13