NUP107

NUP107
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3CQC, 3CQG, 3I4R, 5A9Q
Ідентифікатори
Символи	NUP107, NUP84, NPHS11, nucleoporin 107kDa, nucleoporin 107, ODG6, ODG6; GAMOS7
Зовнішні ІД	OMIM: 607617 MGI: 2143854 HomoloGene: 5555 GeneCards: NUP107
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • гіалоплазма • центросома • ядерна мембрана • nuclear periphery • мембрана • nuclear envelope • ядерна пора • нуклеоплазма • хромосома • nuclear pore outer ring • центромера • клітинне ядро • кінетохор • host cell Біологічний процес • mRNA transport • nuclear pore complex assembly • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • protein import into nucleus • viral transcription • protein sumoylation • mitotic nuclear membrane disassembly • regulation of cellular response to heat • protein transport • posttranscriptional tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery • GO:0022415 viral process • tRNA export from nucleus • sister chromatid cohesion • GO:0046795 intracellular transport of virus • mRNA export from nucleus • female gonad development • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт • nephron development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57122	103468
Ensembl	ENSG00000111581	ENSMUSG00000052798
UniProt	P57740	Q8BH74
RefSeq (мРНК)	NM_020401 NM_001330192	NM_134010
RefSeq (білок)	NP_001317121 NP_065134	NP_598771
Локус (UCSC)	Хр. 12: 68.69 – 68.75 Mb	Хр. 10: 117.59 – 117.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NUP107 (англ. Nucleoporin 107) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 925 амінокислот, а молекулярна маса — 106 374.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDRSGFGEIS		SPVIREAEVT		RTARKQSAQK		RVLLQASQDE		NFGNTTPRNQ
VIPRTPSSFR		QPFTPTSRSL		LRQPDISCIL		GTGGKSPRLT		QSSGFFGNLS
MVTNLDDSNW		AAAFSSQRSG		LFTNTEPHSI		TEDVTISAVM		LREDDPGEAA
SMSMFSDFLQ		SFLKHSSSTV		FDLVEEYENI		CGSQVNILSK		IVSRATPGLQ
KFSKTASMLW		LLQQEMVTWR		LLASLYRDRI		QSALEEESVF		AVTAVNASEK
TVVEALFQRD		SLVRQSQLVV		DWLESIAKDE		IGEFSDNIEF		YAKSVYWENT
LHTLKQRQLT		SYVGSVRPLV		TELDPDAPIR		QKMPLDDLDR		EDEVRLLKYL
FTLIRAGMTE		EAQRLCKRCG		QAWRAATLEG		WKLYHDPNVN		GGTELEPVEG
NPYRRIWKIS		CWRMAEDELF		NRYERAIYAA		LSGNLKQLLP		VCDTWEDTVW
AYFRVMVDSL		VEQEIQTSVA		TLDETEELPR		EYLGANWTLE		KVFEELQATD
KKRVLEENQE		HYHIVQKFLI		LGDIDGLMDE		FSKWLSKSRN		NLPGHLLRFM
THLILFFRTL		GLQTKEEVSI		EVLKTYIQLL		IREKHTNLIA		FYTCHLPQDL
AVAQYALFLE		SVTEFEQRHH		CLELAKEADL		DVATITKTVV		ENIRKKDNGE
FSHHDLAPAL		DTGTTEEDRL		KIDVIDWLVF		DPAQRAEALK		QGNAIMRKFL
ASKKHEAAKE		VFVKIPQDSI		AEIYNQCEEQ		GMESPLPAED		DNAIREHLCI
RAYLEAHETF		NEWFKHMNSV		PQKPALIPQP		TFTEKVAHEH		KEKKYEMDFG
IWKGHLDALT		ADVKEKMYNV		LLFVDGGWMV		DVREDAKEDH		ERTHQMVLLR
KLCLPMLCFL		LHTILHSTGQ		YQECLQLADM		VSSERHKLYL		VFSKEELRKL
LQKLRESSLM		LLDQGLDPLG		YEIQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, хромосомах, комплексі ядерної пори, центромерах, кінетохорі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hase M.E., Cordes V.C. (2003). Direct interaction with nup153 mediates binding of Tpr to the periphery of the nuclear pore complex. Mol. Biol. Cell. 14: 1923—1940. PMID 12802065 DOI:10.1091/mbc.E02-09-0620
• Boehmer T., Enninga J., Dales S., Blobel G., Zhong H. (2003). Depletion of a single nucleoporin, Nup107, prevents the assembly of a subset of nucleoporins into the nuclear pore complex. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 981—985. PMID 12552102 DOI:10.1073/pnas.252749899
• Krull S., Thyberg J., Bjorkroth B., Rackwitz H.R., Cordes V.C. (2004). Nucleoporins as components of the nuclear pore complex core structure and Tpr as the architectural element of the nuclear basket. Mol. Biol. Cell. 15: 4261—4277. PMID 15229283 DOI:10.1091/mbc.E04-03-0165
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 12