NWD1

NWD1
Ідентифікатори
Символи	NWD1, NACHT and WD repeat domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 616250 MGI: 2442268 HomoloGene: 72261 GeneCards: NWD1
Онтологія гена Молекулярна функція • ATP binding • nucleotide binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • U5 snRNP • precatalytic spliceosome • catalytic step 2 spliceosome Біологічний процес • Сплайсинг РНК • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	284434	319555
Ensembl	ENSG00000188039	ENSMUSG00000048148
UniProt	Q149M9	A6H603
RefSeq (мРНК)	NM_001007525 NM_001290355 NM_001347994	NM_001159403 NM_176940
RefSeq (білок)	NP_001007526 NP_001277284 NP_001334923	NP_795914
Локус (UCSC)	Хр. 19: 16.72 – 16.82 Mb	Хр. 8: 72.65 – 72.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NWD1 (англ. NACHT and WD repeat domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 564 амінокислот, а молекулярна маса — 174 552.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQRGKPCRAL		PTLKCQTFCQ		RHGLMFEVVD		LRWGIRNIEA		TDHLTTELCL
EEVDRCWKTS		IGPAFVALIG		DQYGPCLIPS		RIDEKEWEVL		RDHLTARPSD
LELVARYFQR		DENAFPPTYV		LQAPGTGEAC		EPEEATLTSV		LRSGAQEARR
LGLITQEQWQ		HYHRSVIEWE		IERSLLSSED		REQGATVFLR		EIQDLHKHIL
EDCALRMVDR		LADGCLDADA		QNLLSSLKSH		ITDMHPGVLK		THRLPWSRDL
VNPKNKTHAC		YLKELGEQFV		VRANHQVLTR		LRELDTAGQE		LAWLYQEIRH
HLWQSSEVIQ		TFCGRQELLA		RLGQQLRHDD		SKQHTPLVLF		GPPGIGKTAL
MCKLAEQMPR		LLGHKTVTVL		RLLGTSQMSS		DARGLLKSIC		FQVCLAYGLP
LPPAQVLDAH		TRVVQFFHTL		LHTVSCRNFE		SLVLLLDAMD		DLDSVRHARR
VPWLPLNCPP		RVHLILSACS		GALGVLDTLQ		RVLLDPEAYW		EVKPLSGNQG
QQMIQLLLAA		ARRTLSPVHT		DLLWASLPEC		GNPGRLRLAF		EEARKWASFT
VPVPLATTAE		EATHQLCTRL		EQTHGQLLVA		HVLGYIVSSR		HGLSEAELKD
VLSLDDEVLQ		DVYRDWTPPS		KELLRFPPLL		WVRLRRDLGY		YLARRPVDGF
TLLAIAHRQL		VEVVRERYLS		GSERAKRHGV		LADFFSGTWS		QGTKKLITLP
LVGKPLNLDR		KVAPQPLWFS		HTVANLRKLK		ELPYHLLHSG		RLEELKQEVL
GSMSWISCRG		ISGGIEDLLD		DFDLCAPHLD		SPEVGLVREA		LQLCRPAVEL
RGMERSLLYT		ELLARLHFFA		TSHPALVGQL		CQQAQSWFQL		CAHPVLVPLG
GFLQPPGGPL		RATLSGCHKG		ITAMAWGVEE		KLLVIGTQDG		IMAVWDMEEQ
HVIHMLTGHT		GEVRCVKIFA		KGTLANSASK		DYTLHLWNLL		SGQEKFTIWD
GGSKNPAEPQ		IWNLHVDEAH		KVVYSASGSK		INAWNLETAE		PVFHILGDAS
DPWMCMAVLA		SQATLLTVSR		DGVVSLWSSA		TGKLQGKQHM		SSIKEETPTC
AVSVQKQGKL		VTGFSNGSIS		LVSSKGDRLL		EKLPDAVRFL		VVSEDESLLA
AGFGRSVRIF		LADSRGFRRF		MAMDLEHEDM		VETAVFGTEN		NLIITGSLDA
LIQVWSLSEQ		GTLLDILEGV		GAPVSLLARG		GALVASASPQ		SSSFKVWDLS
DAHRSRVPAP		FLDRTGLTAV		SHNGSYVYFP		KIGDKNKVTI		WDLAEGEEQD
SLDTSSEIRC		LEVAEQRKLL		FTGLVSGVVL		VFPLNSRQDV		ICIPPPEARK
AINCMSLSKC		EDRLAIAYDN		IVLVLDITSG		DPCPVIDGPR		YTFYTQLPET
LSSVAILTDY		RVVYSMTNGD		LFLYECATSK		AFPLETHRSR		VACVEVSHKE
QLVVSGSEDA		LLCLWDLQAR		KWKFEMSYTS		SYCRGVQCAC		FSKDDKYVYV
GLKDRSILVW		SVLDGTLLTV		QFVHAVVNRI		IPTTSGFIAP		TRHGYLIREN
FQCLSAKASP		QDPLKNFKKA		MWMVKSRQRE		ELVAAAGAPQ		DLESESAQGN
ETKSNKCSQV		CLIV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Correa R.G., Krajewska M., Ware C.F., Gerlic M., Reed J.C. (2014). The NLR-related protein NWD1 is associated with prostate cancer and modulates androgen receptor signaling. Oncotarget. 5: 1666—1682. PMID 24681825

Див. також

• Хромосома 19