OGDH

OGDH
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3ERY
Ідентифікатори
Символи	OGDH, AKGDH, E1k, OGDC, oxoglutarate dehydrogenase, KGD1, OGDH2, OGDHD
Зовнішні ІД	OMIM: 613022 MGI: 1098267 HomoloGene: 55662 GeneCards: OGDH
Онтологія гена Молекулярна функція • oxoglutarate dehydrogenase (NAD+) activity • зв'язування з іоном металу • oxidoreductase activity • oxidoreductase activity, acting on the aldehyde or oxo group of donors, disulfide as acceptor • oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring) activity • thiamine pyrophosphate binding • heat shock protein binding • chaperone binding Клітинна компонента • гіалоплазма • мітохондріальна мембрана • мітохондріальний матрикс • мітохондрія • oxoglutarate dehydrogenase complex • клітинне ядро Біологічний процес • гліколіз • olfactory bulb mitral cell layer development • thalamus development • generation of precursor metabolites and energy • tangential migration from the subventricular zone to the olfactory bulb • NADH metabolic process • cerebellar cortex development • pyramidal neuron development • обмін речовин • hippocampus development • striatum development • 2-oxoglutarate metabolic process • succinyl-CoA metabolic process • histone succinylation • цикл трикарбонових кислот • lysine catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4967	18293
Ensembl	ENSG00000105953	ENSMUSG00000020456
UniProt	Q02218	Q60597
RefSeq (мРНК)	NM_001003941 NM_001165036 NM_002541 NM_001363523	NM_001252282 NM_001252283 NM_001252287 NM_001252288 NM_010956 NM_001361902 NM_001361903 NM_001361904 NM_001361905
RefSeq (білок)	NP_001003941 NP_001158508 NP_002532 NP_001350452	NP_001239211 NP_001239212 NP_001239216 NP_001239217 NP_035086 NP_001348831 NP_001348832 NP_001348833 NP_001348834
Локус (UCSC)	Хр. 7: 44.61 – 44.71 Mb	Хр. 11: 6.24 – 6.31 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

OGDH (англ. Oxoglutarate dehydrogenase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 023 амінокислот, а молекулярна маса — 115 935.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFHLRTCAAK		LRPLTASQTV		KTFSQNRPAA		ARTFQQIRCY		SAPVAAEPFL
SGTSSNYVEE		MYCAWLENPK		SVHKSWDIFF		RNTNAGAPPG		TAYQSPLPLS
RGSLAAVAHA		QSLVEAQPNV		DKLVEDHLAV		QSLIRAYQIR		GHHVAQLDPL
GILDADLDSS		VPADIISSTD		KLGFYGLDES		DLDKVFHLPT		TTFIGGQESA
LPLREIIRRL		EMAYCQHIGV		EFMFINDLEQ		CQWIRQKFET		PGIMQFTNEE
KRTLLARLVR		STRFEEFLQR		KWSSEKRFGL		EGCEVLIPAL		KTIIDKSSEN
GVDYVIMGMP		HRGRLNVLAN		VIRKELEQIF		CQFDSKLEAA		DEGSGDVKYH
LGMYHRRINR		VTDRNITLSL		VANPSHLEAA		DPVVMGKTKA		EQFYCGDTEG
KKVMSILLHG		DAAFAGQGIV		YETFHLSDLP		SYTTHGTVHV		VVNNQIGFTT
DPRMARSSPY		PTDVARVVNA		PIFHVNSDDP		EAVMYVCKVA		AEWRSTFHKD
VVVDLVCYRR		NGHNEMDEPM		FTQPLMYKQI		RKQKPVLQKY		AELLVSQGVV
NQPEYEEEIS		KYDKICEEAF		ARSKDEKILH		IKHWLDSPWP		GFFTLDGQPR
SMSCPSTGLT		EDILTHIGNV		ASSVPVENFT		IHGGLSRILK		TRGEMVKNRT
VDWALAEYMA		FGSLLKEGIH		IRLSGQDVER		GTFSHRHHVL		HDQNVDKRTC
IPMNHLWPNQ		APYTVCNSSL		SEYGVLGFEL		GFAMASPNAL		VLWEAQFGDF
HNTAQCIIDQ		FICPGQAKWV		RQNGIVLLLP		HGMEGMGPEH		SSARPERFLQ
MCNDDPDVLP		DLKEANFDIN		QLYDCNWVVV		NCSTPGNFFH		VLRRQILLPF
RKPLIIFTPK		SLLRHPEARS		SFDEMLPGTH		FQRVIPEDGP		AAQNPENVKR
LLFCTGKVYY		DLTRERKARD		MVGQVAITRI		EQLSPFPFDL		LLKEVQKYPN
AELAWCQEEH		KNQGYYDYVK		PRLRTTISRA		KPVWYAGRDP		AAAPATGNKK
THLTELQRLL		DTAFDLDVFK		NFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у такому біологічному процесі як гліколіз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, тіамін-пірофосфатом. Локалізований у мітохондрії.

Література

• Koike K., Urata Y., Goto S. (1992). Cloning and nucleotide sequence of the cDNA encoding human 2-oxoglutarate dehydrogenase (lipoamide). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 1963—1967. PMID 1542694 DOI:10.1073/pnas.89.5.1963
• Koike K. (1995). The gene encoding human 2-oxoglutarate dehydrogenase: structural organization and mapping to chromosome 7p13-p14. Gene. 159: 261—266. PMID 7622061 DOI:10.1016/0378-1119(95)00086-L
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Denis N.J., Vasilescu J., Lambert J.-P., Smith J.C., Figeys D. (2007). Tryptic digestion of ubiquitin standards reveals an improved strategy for identifying ubiquitinated proteins by mass spectrometry. Proteomics. 7: 868—874. PMID 17370265 DOI:10.1002/pmic.200600410
• Armstrong C.T., Anderson J.L., Denton R.M. (2014). Studies on the regulation of the human E1 subunit of the 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, including the identification of a novel calcium-binding site. Biochem. J. 459: 369—381. PMID 24495017 DOI:10.1042/BJ20131664

Див. також

• Хромосома 7