OLR1

OLR1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1YPO, 1YPQ, 1YPU, 1YXJ, 1YXK, 3VLG
Ідентифікатори
Символи	OLR1, CLEC8A, LOX1, LOXIN, SCARE1, SLOX1, oxidized low density lipoprotein receptor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602601 MGI: 1261434 HomoloGene: 1910 GeneCards: OLR1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • carbohydrate binding • identical protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • receptor complex • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • нуклеоплазма • extracellular region • membrane raft • specific granule membrane • tertiary granule membrane Біологічний процес • процес імунної системи • кровообіг • протеоліз • адгезія клітин • inflammatory response • leukocyte migration • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4973	108078
Ensembl	ENSG00000173391	ENSMUSG00000030162
UniProt	P78380	Q9EQ09
RefSeq (мРНК)	NM_001172632 NM_001172633 NM_002543	NM_001301094 NM_001301096 NM_138648
RefSeq (білок)	NP_001166103 NP_001166104 NP_002534	NP_001288023 NP_001288025 NP_619589
Локус (UCSC)	Хр. 12: 10.16 – 10.17 Mb	Хр. 6: 129.46 – 129.48 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

OLR1 (англ. Oxidized low density lipoprotein receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 273 амінокислот, а молекулярна маса — 30 959.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTFDDLKIQT		VKDQPDEKSN		GKKAKGLQFL		YSPWWCLAAA		TLGVLCLGLV
VTIMVLGMQL		SQVSDLLTQE		QANLTHQKKK		LEGQISARQQ		AEEASQESEN
ELKEMIETLA		RKLNEKSKEQ		MELHHQNLNL		QETLKRVANC		SAPCPQDWIW
HGENCYLFSS		GSFNWEKSQE		KCLSLDAKLL		KINSTADLDF		IQQAISYSSF
PFWMGLSRRN		PSYPWLWEDG		SPLMPHLFRV		RGAVSQTYPS		GTCAYIQRGA
VYAENCILAA		FSICQKKANL		RAQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Yamanaka S., Zhang X.-Y., Miura K., Kim S., Iwao H. (1998). The human gene encoding the lectin-type oxidized LDL receptor (OLR1) is a novel member of the natural killer gene complex with a unique expression profile. Genomics. 54: 191—199. PMID 9828121 doi:10.1006/geno.1998.5561
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Hayashida K., Kume N., Minami M., Kita T. (2002). Lectin-like oxidized LDL receptor-1 (LOX-1) supports adhesion of mononuclear leukocytes and a monocyte-like cell line THP-1 cells under static and flow conditions. FEBS Lett. 511: 133—138. PMID 11821063 doi:10.1016/S0014-5793(01)03297-5
• Luedecking-Zimmer E., DeKosky S.T., Chen Q., Barmada M.M., Kamboh M.I. (2002). Investigation of oxidized LDL-receptor 1 (OLR1) as the candidate gene for Alzheimer's disease on chromosome 12. Hum. Genet. 111: 443—451. PMID 12384789 doi:10.1007/s00439-002-0802-7
• Hu B., Li D., Sawamura T., Mehta J.L. (2003). Oxidized LDL through LOX-1 modulates LDL-receptor expression in human coronary artery endothelial cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 307: 1008—1012. PMID 12878212 doi:10.1016/S0006-291X(03)01295-6
• Pritchard A., St Clair D., Lemmon H., Mann D.M.A., Lendon C. (2004). No association between polymorphisms in the lectin-like oxidised low density lipoprotein receptor (ORL1) gene on chromosome 12 and Alzheimer's disease in a UK cohort. Neurosci. Lett. 366: 126—129. PMID 15276231 doi:10.1016/j.neulet.2004.05.023

Див. також

• Хромосома 12