OTUD5

OTUD5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3PFY, 3TMO, 3TMP
Ідентифікатори
Символи	OTUD5, DUBA, OTU deubiquitinase 5, MCAND
Зовнішні ІД	OMIM: 300713 MGI: 1859615 HomoloGene: 136483 GeneCards: OTUD5
Онтологія гена Молекулярна функція • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • Lys63-specific deubiquitinase activity • GO:1904265 deubiquitinase activity • Lys48-specific deubiquitinase activity Клітинна компонента • гіалоплазма Біологічний процес • negative regulation of type I interferon production • response to lipopolysaccharide • protein K63-linked deubiquitination • protein K48-linked deubiquitination • протеоліз • protein deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55593	54644
Ensembl	ENSG00000068308	ENSMUSG00000031154
UniProt	Q96G74	Q3U2S4
RefSeq (мРНК)	NM_001136157 NM_001136158 NM_001136159 NM_017602	NM_001290536 NM_001290537 NM_138604
RefSeq (білок)	NP_001129629 NP_001129630 NP_001129631 NP_060072	NP_001277465 NP_001277466 NP_613070
Локус (UCSC)	Хр. X: 48.92 – 48.96 Mb	Хр. X: 7.71 – 7.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

OTUD5 (англ. OTU deubiquitinase 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 571 амінокислот, а молекулярна маса — 60 626.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTILPKKKPP		PPDADPANEP		PPPGPMPPAP		RRGGGVGVGG		GGTGVGGGDR
DRDSGVVGAR		PRASPPPQGP		LPGPPGALHR		WALAVPPGAV		AGPRPQQASP
PPCGGPGGPG		GGPGDALGAA		AAGVGAAGVV		VGVGGAVGVG		GCCSGPGHSK
RRRQAPGVGA		VGGGSPEREE		VGAGYNSEDE		YEAAAARIEA		MDPATVEQQE
HWFEKALRDK		KGFIIKQMKE		DGACLFRAVA		DQVYGDQDMH		EVVRKHCMDY
LMKNADYFSN		YVTEDFTTYI		NRKRKNNCHG		NHIEMQAMAE		MYNRPVEVYQ
YSTGTSAVEP		INTFHGIHQN		EDEPIRVSYH		RNIHYNSVVN		PNKATIGVGL
GLPSFKPGFA		EQSLMKNAIK		TSEESWIEQQ		MLEDKKRATD		WEATNEAIEE
QVARESYLQW		LRDQEKQARQ		VRGPSQPRKA		SATCSSATAA		ASSGLEEWTS
RSPRQRSSAS		SPEHPELHAE		LGMKPPSPGT		VLALAKPPSP		CAPGTSSQFS
AGADRATSPL		VSLYPALECR		ALIQQMSPSA		FGLNDWDDDE		ILASVLAVSQ
QEYLDSMKKN		KVHRDPPPDK		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома X