PDE1A

PDE1A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1LXQ
Ідентифікатори
Символи	PDE1A, CAM-PDE-1A, HCAM-1, HCAM1, HSphosphodiesterase 1A, CAM-PDE 1A
Зовнішні ІД	OMIM: 171890 MGI: 1201792 HomoloGene: 21043 GeneCards: PDE1A
Реагує на сполуку
	SCH-51866
Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphoric diester hydrolase activity; • calmodulin-dependent cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity; • hydrolase activity; • 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity; • зв'язування з іоном металу; • calmodulin binding; • calcium- and calmodulin-regulated 3',5'-cyclic-GMP phosphodiesterase activity; • cGMP binding; • 3',5'-cyclic-AMP phosphodiesterase activity; • 3',5'-cyclic-GMP phosphodiesterase activity;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • цитоплазма; • клітинне ядро; • neuronal cell body;
Біологічний процес	• cGMP catabolic process; • cAMP catabolic process; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • regulation of smooth muscle cell apoptotic process; • regulation of smooth muscle cell proliferation; • G protein-coupled receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5136
	18573
	ENSG00000115252
	ENSMUSG00000059173
	P54750; Q9Y633
	Q61481
NM_001003683; NM_001258312; NM_001258313; NM_001258314; NM_005019;
	NM_001363871; NM_001395258; NM_001395259; NM_001395260; NM_001395261; NM_001395262; NM_001395263; NM_001395264; NM_001395265; NM_001395266; NM_001395267; NM_001395268; NM_001395269
NM_001009978; NM_001009979; NM_001159582; NM_016744; NM_001355140;
	NM_001355141; NM_001355142; NM_001355143; NM_001355144
NP_001003683; NP_001245241; NP_001245242; NP_001245243; NP_005010;
	NP_001350800; NP_001245241.1
NP_001009978; NP_001009979; NP_001153054; NP_058024; NP_001342069;
	NP_001342070; NP_001342071; NP_001342073
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PDE1A (англ. Phosphodiesterase 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 535 амінокислот, а молекулярна маса — 61 252^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGSSATEIEE	LENTTFKYLT	GEQTEKMWQR	LKGILRCLVK	QLERGDVNVV
DLKKNIEYAA	SVLEAVYIDE	TRRLLDTEDE	LSDIQTDSVP	SEVRDWLAST
FTRKMGMTKK	KPEEKPKFRS	IVHAVQAGIF	VERMYRKTYH	MVGLAYPAAV
IVTLKDVDKW	SFDVFALNEA	SGEHSLKFMI	YELFTRYDLI	NRFKIPVSCL
ITFAEALEVG	YSKYKNPYHN	LIHAADVTQT	VHYIMLHTGI	MHWLTELEIL
AMVFAAAIHD	YEHTGTTNNF	HIQTRSDVAI	LYNDRSVLEN	HHVSAAYRLM
QEEEMNILIN	LSKDDWRDLR	NLVIEMVLST	DMSGHFQQIK	NIRNSLQQPE
GIDRAKTMSL	ILHAADISHP	AKSWKLHYRW	TMALMEEFFL	QGDKEAELGL
PFSPLCDRKS	TMVAQSQIGF	IDFIVEPTFS	LLTDSTEKIV	IPLIEEASKA
ETSSYVASSS	TTIVGLHIAD	ALRRSNTKGS	MSDGSYSPDY	SLAAVDLKSF
KNNLVDIIQQ	NKERWKELAA	QEARTSSQKC	EFIHQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну, іонами металів.

Література

Michibata H., Yanaka N., Kanoh Y., Okumura K., Omori K. (2001). Human Ca2+/calmodulin-dependent phosphodiesterase PDE1A: novel splice variants, their specific expression, genomic organization, and chromosomal localization. Biochim. Biophys. Acta. 1517: 278—287. PMID 11342109 DOI:10.1016/S0167-4781(00)00293-1
Fidock M.D., Miller M., Lanfear J. (2002). Isolation and differential tissue distribution of two human cDNAs encoding PDE1 splice variants. Cell. Signal. 14: 53—60. PMID 11747989 DOI:10.1016/S0898-6568(01)00207-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504