PDE6D

PDE6D
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1KSG, 1KSH, 1KSJ, 3T5G, 3T5I, 4JHP, 4JV6, 4JV8, 4JVB, 4JVF, 5E8F, 5E80, 5F2U
Ідентифікатори
Символи	PDE6D, JBTS22, PDED, phosphodiesterase 6D
Зовнішні ІД	OMIM: 602676 MGI: 1270843 HomoloGene: 1954 GeneCards: PDE6D
шифр КФ	3.1.4.35
Пов'язані генетичні захворювання
Joubert syndrome 22
Онтологія гена Молекулярна функція • GTPase inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • cell projection • цитоскелет • cytoplasmic vesicle membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • війка Біологічний процес • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • відповідь на стимул • зір • sensory perception of light stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5147	18582
Ensembl	ENSG00000156973	ENSMUSG00000026239
UniProt	O43924 Q6IB24	O55057
RefSeq (мРНК)	NM_001291018 NM_002601	NM_008801 NM_001360816 NM_001360817
RefSeq (білок)	NP_001277947 NP_002592 NP_002592.1	NP_032827 NP_001347745 NP_001347746
Локус (UCSC)	Хр. 2: 231.73 – 231.79 Mb	Хр. 1: 86.47 – 86.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDE6D (англ. Phosphodiesterase 6D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 150 амінокислот, а молекулярна маса — 17 420.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSAKDERARE		ILRGFKLNWM		NLRDAETGKI		LWQGTEDLSV		PGVEHEARVP
KKILKCKAVS		RELNFSSTEQ		MEKFRLEQKV		YFKGQCLEEW		FFEFGFVIPN
STNTWQSLIE		AAPESQMMPA		SVLTGNVIIE		TKFFDDDLLV		STSRVRLFYV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах.

Література

• Marzesco A.M., Galli T., Louvard D., Zahraoui A. (1998). The rod cGMP phosphodiesterase delta subunit dissociates the small GTPase Rab13 from membranes. J. Biol. Chem. 273: 22340—22345. PMID 9712853 doi:10.1074/jbc.273.35.22340
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Linari M., Hanzal-Bayer M., Becker J. (1999). The delta subunit of rod specific cyclic GMP phosphodiesterase, PDE delta, interacts with the Arf-like protein Arl3 in a GTP specific manner. FEBS Lett. 458: 55—59. PMID 10518933 doi:10.1016/S0014-5793(99)01117-5
• Hanzal-Bayer M., Renault L., Roversi P., Wittinghofer A., Hillig R.C. (2002). The complex of Arl2-GTP and PDE delta: from structure to function. EMBO J. 21: 2095—2106. PMID 11980706 doi:10.1093/emboj/21.9.2095

Див. також

• Хромосома 2