PDP1

PDP1
Ідентифікатори
Символи	PDP1, PDH, PDP, PDPC, PPM2C, PPM2A, pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1, pyruvate dehydrogenase phosphatase catalytic subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605993 MGI: 2685870 HomoloGene: 31928 GeneCards: PDP1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein serine/threonine phosphatase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • phosphoprotein phosphatase activity • hydrolase activity • cation binding • зв'язування з іоном металу • [pyruvate dehydrogenase (lipoamide) phosphatase activity] Клітинна компонента • мітохондріальний матрикс • мітохондрія Біологічний процес • GO:0016576 protein dephosphorylation • regulation of acetyl-CoA biosynthetic process from pyruvate • peptidyl-threonine dephosphorylation • positive regulation of pyruvate dehydrogenase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54704	381511
Ensembl	ENSG00000164951	ENSMUSG00000049225
UniProt	Q9P0J1	Q3UV70
RefSeq (мРНК)	NM_001161778 NM_001161779 NM_001161780 NM_001161781 NM_018444	NM_001033453 NM_001098230 NM_001098231 NM_001290387 NM_001290391
RefSeq (білок)	NP_001155251 NP_001155252 NP_001155253 NP_060914	NP_001028625 NP_001091700 NP_001091701 NP_001277316 NP_001277320
Локус (UCSC)	Хр. 8: 93.86 – 93.93 Mb	Хр. 4: 11.96 – 11.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDP1 (англ. Pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 537 амінокислот, а молекулярна маса — 61 054.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPAPTQLFFP		LIRNCELSRI		YGTACYCHHK		HLCCSSSYIP		QSRLRYTPHP
AYATFCRPKE		NWWQYTQGRR		YASTPQKFYL		TPPQVNSILK		ANEYSFKVPE
FDGKNVSSIL		GFDSNQLPAN		APIEDRRSAA		TCLQTRGMLL		GVFDGHAGCA
CSQAVSERLF		YYIAVSLLPH		ETLLEIENAV		ESGRALLPIL		QWHKHPNDYF
SKEASKLYFN		SLRTYWQELI		DLNTGESTDI		DVKEALINAF		KRLDNDISLE
AQVGDPNSFL		NYLVLRVAFS		GATACVAHVD		GVDLHVANTG		DSRAMLGVQE
EDGSWSAVTL		SNDHNAQNER		ELERLKLEHP		KSEAKSVVKQ		DRLLGLLMPF
RAFGDVKFKW		SIDLQKRVIE		SGPDQLNDNE		YTKFIPPNYH		TPPYLTAEPE
VTYHRLRPQD		KFLVLATDGL		WETMHRQDVV		RIVGEYLTGM		HHQQPIAVGG
YKVTLGQMHG		LLTERRTKMS		SVFEDQNAAT		HLIRHAVGNN		EFGTVDHERL
SKMLSLPEEL		ARMYRDDITI		IVVQFNSHVV		GAYQNQE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 8