PDPN

PDPN
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3WSR, 4YO0
Ідентифікатори
Символи	PDPN, AGGRUS, GP36, GP40, Gp38, HT1A-1, OTS8, PA2.26, T1A, T1A-2, T1A2, TI1A, podoplanin, D2-40
Зовнішні ІД	OMIM: 608863 MGI: 103098 HomoloGene: 4729 GeneCards: PDPN
Онтологія гена Молекулярна функція • folic acid transmembrane transporter activity • water channel activity • amino acid transmembrane transporter activity • water transmembrane transporter activity • signaling receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chaperone binding • chemokine binding Клітинна компонента • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • клітинна мембрана • мембрана • tetraspanin-enriched microdomain • lamellipodium membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • filopodium membrane • microvillus membrane • ruffle membrane • cell projection • leading edge of lamellipodium • цитоплазма • гіалоплазма • basolateral plasma membrane • apical plasma membrane • міжклітинні контакти • membrane raft • ruffle • lamellipodium • Філоподія Біологічний процес • folic acid transport • water transport • platelet activation • multicellular organism development • regulation of cell shape • amino acid transport • positive regulation of epithelial to mesenchymal transition • positive regulation of cell migration • Rho protein signal transduction • wound healing, spreading of cells • positive regulation of extracellular matrix disassembly • regulation of lamellipodium morphogenesis • GO:0000767 cell morphogenesis • lymphangiogenesis • negative regulation of cell population proliferation • lung development • negative regulation of apoptotic process • lymph node development • lymphatic endothelial cell fate commitment • actin-mediated cell contraction • regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • positive regulation of platelet aggregation • regulation of myofibroblast contraction • amino acid transmembrane transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10630	14726
Ensembl	ENSG00000162493	ENSMUSG00000028583
UniProt	Q86YL7	Q62011
RefSeq (мРНК)	NM_001006624 NM_001006625 NM_006474 NM_198389 NM_001385053 NM_013317	NM_001290822 NM_010329
RefSeq (білок)	NP_001006625 NP_001006626 NP_006465 NP_938203	NP_001277751 NP_034459
Локус (UCSC)	Хр. 1: 13.58 – 13.62 Mb	Хр. 4: 142.99 – 143.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDPN (англ. Podoplanin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 162 амінокислот, а молекулярна маса — 16 698.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWKVSALLFV		LGSASLWVLA		EGASTGQPED		DTETTGLEGG		VAMPGAEDDV
VTPGTSEDRY		KSGLTTLVAT		SVNSVTGIRI		EDLPTSESTV		HAQEQSPSAT
ASNVATSHST		EKVDGDTQTT		VEKDGLSTVT		LVGIIVGVLL		AIGFIGAIIV
VVMRKMSGRY		SP

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як пдтримання форми клітини, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з сіаловими кислотами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

• Ma T., Yang B., Matthay M.A., Verkman A.S. (1998). Evidence against a role of mouse, rat, and two cloned human T1alpha isoforms as a water channel or a regulator of aquaporin-type water channels. Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 19: 143—149. PMID 9651190 doi:10.1165/ajrcmb.19.1.2953
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1