PER1

PER1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1UL6
Ідентифікатори
Символи	PER1, PER, RIGUI, hPER, period circadian clock 1, period circadian regulator 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602260 MGI: 1098283 HomoloGene: 1966 GeneCards: PER1
Онтологія гена Молекулярна функція • transcription factor binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • E-box binding • kinase binding • chromatin DNA binding • ubiquitin protein ligase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription corepressor binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • histone H3 deacetylation • negative regulation of glucocorticoid receptor signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • response to light stimulus • regulation of cytokine production involved in inflammatory response • regulation of sodium ion transport • ритмічний процес • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • circadian regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • entrainment of circadian clock • negative regulation of JNK cascade • circadian regulation of translation • regulation of circadian rhythm • циркадний ритм • histone H3 acetylation • regulation of hair cycle • histone H4 acetylation • posttranscriptional regulation of gene expression • response to cAMP • regulation of p38MAPK cascade • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • entrainment of circadian clock by photoperiod • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5187	18626
Ensembl	ENSG00000179094	ENSMUSG00000020893
UniProt	O15534	O35973
RefSeq (мРНК)	NM_002616	NM_001159367 NM_011065
RefSeq (білок)	NP_002607	NP_001152839 NP_035195
Локус (UCSC)	Хр. 17: 8.14 – 8.16 Mb	Хр. 11: 68.99 – 69 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PER1 (англ. Period circadian clock 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 290 амінокислот, а молекулярна маса — 136 212.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGPLEGADG		GGDPRPGESF		CPGGVPSPGP		PQHRPCPGPS		LADDTDANSN
GSSGNESNGH		ESRGASQRSS		HSSSSGNGKD		SALLETTESS		KSTNSQSPSP
PSSSIAYSLL		SASSEQDNPS		TSGCSSEQSA		RARTQKELMT		ALRELKLRLP
PERRGKGRSG		TLATLQYALA		CVKQVQANQE		YYQQWSLEEG		EPCSMDMSTY
TLEELEHITS		EYTLQNQDTF		SVAVSFLTGR		IVYISEQAAV		LLRCKRDVFR
GTRFSELLAP		QDVGVFYGST		APSRLPTWGT		GASAGSGLRD		FTQEKSVFCR
IRGGPDRDPG		PRYQPFRLTP		YVTKIRVSDG		APAQPCCLLI		AERIHSGYEA
PRIPPDKRIF		TTRHTPSCLF		QDVDERAAPL		LGYLPQDLLG		APVLLFLHPE
DRPLMLAIHK		KILQLAGQPF		DHSPIRFCAR		NGEYVTMDTS		WAGFVHPWSR
KVAFVLGRHK		VRTAPLNEDV		FTPPAPSPAP		SLDTDIQELS		EQIHRLLLQP
VHSPSPTGLC		GVGAVTSPGP		LHSPGSSSDS		NGGDAEGPGP		PAPVTFQQIC
KDVHLVKHQG		QQLFIESRAR		PQSRPRLPAT		GTFKAKALPC		QSPDPELEAG
SAPVQAPLAL		VPEEAERKEA		SSCSYQQINC		LDSILRYLES		CNLPSTTKRK
CASSSSYTTS		SASDDDRQRT		GPVSVGTKKD		PPSAALSGEG		ATPRKEPVVG
GTLSPLALAN		KAESVVSVTS		QCSFSSTIVH		VGDKKPPESD		IIMMEDLPGL
APGPAPSPAP		SPTVAPDPAP		DAYRPVGLTK		AVLSLHTQKE		EQAFLSRFRD
LGRLRGLDSS		STAPSALGER		GCHHGPAPPS		RRHHCRSKAK		RSRHHQNPRA
EAPCYVSHPS		PVPPSTPWPT		PPATTPFPAV		VQPYPLPVFS		PRGGPQPLPP
APTSVPPAAF		PAPLVTPMVA		LVLPNYLFPT		PSSYPYGALQ		TPAEGPPTPA
SHSPSPSLPA		LAPSPPHRPD		SPLFNSRCSS		PLQLNLLQLE		ELPRAEGAAV
AGGPGSSAGP		PPPSAEAAEP		EARLAEVTES		SNQDALSGSS		DLLELLLQED
SRSGTGSAAS		GSLGSGLGSG		SGSGSHEGGS		TSASITRSSQ		SSHTSKYFGS
IDSSEAEAGA		ARGGAEPGDQ		VIKYVLQDPI		WLLMANADQR		VMMTYQVPSR
DMTSVLKQDR		ERLRAMQKQQ		PRFSEDQRRE		LGAVHSWVRK		GQLPRALDVM
ACVDCGSSTQ		DPGHPDDPLF		SELDGLGLEP		MEEGGGEQGS		SGGGSGEGEG
CEEAQGGAKA		SSSQDLAMEE		EEEGRSSSSP		ALPTAGNCTS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Shearman L.P., Zylka M.J., Weaver D.R., Kolakowski L.F. Jr., Reppert S.M. (1997). Two period homologs: circadian expression and photic regulation in the suprachiasmatic nuclei. Neuron. 19: 1261—1269. PMID 9427249 DOI:10.1016/S0896-6273(00)80417-1
• Shirogane T., Jin J., Ang X.L., Harper J.W. (2005). SCFbeta-TRCP controls clock-dependent transcription via casein kinase 1-dependent degradation of the mammalian period-1 (Per1) protein. J. Biol. Chem. 280: 26863—26872. PMID 15917222 DOI:10.1074/jbc.M502862200
• Eckel-Mahan K., Sassone-Corsi P. (2013). Metabolism and the circadian clock converge. Physiol. Rev. 93: 107—135. PMID 23303907 DOI:10.1152/physrev.00016.2012
• Partch C.L., Green C.B., Takahashi J.S. (2014). Molecular architecture of the mammalian circadian clock. Trends Cell Biol. 24: 90—99. PMID 23916625 DOI:10.1016/j.tcb.2013.07.002

Див. також

• Хромосома 17