PF4V1

PF4V1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4HSV
Ідентифікатори
Символи	PF4V1, CXCL4L1, CXCL4V1, PF4-ALT, PF4A, SCYB4V1, platelet factor 4 variant 1
Зовнішні ІД	OMIM: 173461 MGI: 1888711 HomoloGene: 88665 GeneCards: PF4V1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• CXCR chemokine receptor binding; • chemokine activity; • cytokine activity; • heparin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• extracellular region; • міжклітинний простір;
Біологічний процес	• platelet activation; • inflammatory response; • regulation of cell population proliferation; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • response to lipopolysaccharide; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • chemokine-mediated signaling pathway; • leukocyte chemotaxis; • хемотаксис; • defense response; • positive regulation of neutrophil chemotaxis; • regulation of signaling receptor activity; • neutrophil chemotaxis; • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; • cellular response to lipopolysaccharide;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5197
	56744
	ENSG00000109272
	ENSMUSG00000029373
	P10720
	Q9Z126
	NM_002620
	NM_019932
	NP_002611
	NP_064316
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PF4V1 (англ. Platelet factor 4 variant 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 104 амінокислот, а молекулярна маса — 11 553^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSAARSRLT	RATRQEMLFL	ALLLLPVVVA	FARAEAEEDG	DLQCLCVKTT
SQVRPRHITS	LEVIKAGPHC	PTAQLIATLK	NGRKICLDLQ	ALLYKKIIKE
HLES

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Білок має сайт для зв'язування з молекулою гепарину. Секретований назовні.

Література

Green C.J., St Charles R., Edwards B.F.P., Johnson P.H. (1989). Identification and characterization of PF4var1, a human gene variant of platelet factor 4. Mol. Cell. Biol. 9: 1445—1451. PMID 2725510 DOI:10.1128/MCB.9.4.1445
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Struyf S., Burdick M.D., Proost P., Van Damme J., Strieter R.M. (2004). Platelets release CXCL4L1, a nonallelic variant of the chemokine platelet factor-4/CXCL4 and potent inhibitor of angiogenesis. Circ. Res. 95: 855—857. PMID 15459074 DOI:10.1161/01.RES.0000146674.38319.07
Eisman R., Surrey S., Ramachandran B., Schwartz E., Poncz M. (1990). Structural and functional comparison of the genes for human platelet factor 4 and PF4alt. Blood. 76: 336—344. PMID 1695112