PLOD3

PLOD3
Ідентифікатори
Символи	PLOD3, LH3, procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3
Зовнішні ІД	OMIM: 603066 MGI: 1347008 HomoloGene: 843 GeneCards: PLOD3
Пов'язані генетичні захворювання
connective tissue disorder due to lysyl hydroxylase-3 deficiency
Онтологія гена Молекулярна функція • iron ion binding • L-ascorbic acid binding • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0050602 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen • procollagen galactosyltransferase activity • oxidoreductase activity • procollagen-lysine 5-dioxygenase activity • procollagen glucosyltransferase activity • каталітична активність • transferase activity • glycosyltransferase activity Клітинна компонента • rough endoplasmic reticulum membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • екзосома • ендоплазматичний ретикулум • комплекс Ґольджі • trans-Golgi network • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • міжклітинний простір • endoplasmic reticulum lumen • rough endoplasmic reticulum • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • GO:0034613 protein localization • lung morphogenesis • collagen fibril organization • epidermis morphogenesis • endothelial cell morphogenesis • вазодилатація • in utero embryonic development • basement membrane assembly • cellular response to hormone stimulus • neural tube development • protein O-linked glycosylation • hydroxylysine biosynthetic process • peptidyl-lysine hydroxylation • collagen metabolic process • обмін речовин Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8985	26433
Ensembl	ENSG00000106397	ENSMUSG00000004846
UniProt	O60568	Q9R0E1
RefSeq (мРНК)	NM_001084	NM_011962
RefSeq (білок)	NP_001075	NP_036092
Локус (UCSC)	Хр. 7: 101.21 – 101.22 Mb	Хр. 5: 137.02 – 137.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PLOD3 (англ. Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 738 амінокислот, а молекулярна маса — 84 785.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSSGPGPRF		LLLLPLLLPP		AASASDRPRG		RDPVNPEKLL		VITVATAETE
GYLRFLRSAE		FFNYTVRTLG		LGEEWRGGDV		ARTVGGGQKV		RWLKKEMEKY
ADREDMIIMF		VDSYDVILAG		SPTELLKKFV		QSGSRLLFSA		ESFCWPEWGL
AEQYPEVGTG		KRFLNSGGFI		GFATTIHQIV		RQWKYKDDDD		DQLFYTRLYL
DPGLREKLSL		NLDHKSRIFQ		NLNGALDEVV		LKFDRNRVRI		RNVAYDTLPI
VVHGNGPTKL		QLNYLGNYVP		NGWTPEGGCG		FCNQDRRTLP		GGQPPPRVFL
AVFVEQPTPF		LPRFLQRLLL		LDYPPDRVTL		FLHNNEVFHE		PHIADSWPQL
QDHFSAVKLV		GPEEALSPGE		ARDMAMDLCR		QDPECEFYFS		LDADAVLTNL
QTLRILIEEN		RKVIAPMLSR		HGKLWSNFWG		ALSPDEYYAR		SEDYVELVQR
KRVGVWNVPY		ISQAYVIRGD		TLRMELPQRD		VFSGSDTDPD		MAFCKSFRDK
GIFLHLSNQH		EFGRLLATSR		YDTEHLHPDL		WQIFDNPVDW		KEQYIHENYS
RALEGEGIVE		QPCPDVYWFP		LLSEQMCDEL		VAEMEHYGQW		SGGRHEDSRL
AGGYENVPTV		DIHMKQVGYE		DQWLQLLRTY		VGPMTESLFP		GYHTKARAVM
NFVVRYRPDE		QPSLRPHHDS		STFTLNVALN		HKGLDYEGGG		CRFLRYDCVI
SSPRKGWALL		HPGRLTHYHE		GLPTTWGTRY		IMVSFVDP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• Valtavaara M., Szpirer C., Szpirer J., Myllylae R. (1998). Primary structure, tissue distribution, and chromosomal localization of a novel isoform of lysyl hydroxylase (lysyl hydroxylase 3). J. Biol. Chem. 273: 12881—12886. PMID 9582318 DOI:10.1074/jbc.273.21.12881
• Passoja K., Rautavuoma K., Ala-Kokko L., Kosonen T., Kivirikko K.I. (1998). Cloning and characterization of a third human lysyl hydroxylase isoform. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 10482—10486. PMID 9724729 DOI:10.1073/pnas.95.18.10482
• Rautavuoma K., Passoja K., Helaakoski T., Kivirikko K.I. (2000). Complete exon-intron organization of the gene for human lysyl hydroxylase 3 (LH3). Matrix Biol. 19: 73—79. PMID 10686427 DOI:10.1016/S0945-053X(99)00058-X
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7