POLR2A

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
POLR2A
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи POLR2A, POLR2, POLRA, RPB1, RPBh1, RPO2, RPOL2, RpIILS, hRPB220, hsRPB1, polymerase (RNA) II subunit A, RNA polymerase II subunit A, NEDHIB
Зовнішні ІД OMIM: 180660 MGI: 98086 HomoloGene: 721 GeneCards: POLR2A
шифр КФ 2.7.7.48
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_000937
NM_009089
NM_001291068
RefSeq (білок)
NP_000928
NP_001277997
Локус (UCSC) Хр. 17: 7.48 – 7.51 Mb Хр. 11: 69.62 – 69.65 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

POLR2A (англ. RNA polymerase II subunit A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 970 амінокислот, а молекулярна маса — 217 176[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MHGGGPPSGDSACPLRTIKRVQFGVLSPDELKRMSVTEGGIKYPETTEGG
RPKLGGLMDPRQGVIERTGRCQTCAGNMTECPGHFGHIELAKPVFHVGFL
VKTMKVLRCVCFFCSKLLVDSNNPKIKDILAKSKGQPKKRLTHVYDLCKG
KNICEGGEEMDNKFGVEQPEGDEDLTKEKGHGGCGRYQPRIRRSGLELYA
EWKHVNEDSQEKKILLSPERVHEIFKRISDEECFVLGMEPRYARPEWMIV
TVLPVPPLSVRPAVVMQGSARNQDDLTHKLADIVKINNQLRRNEQNGAAA
HVIAEDVKLLQFHVATMVDNELPGLPRAMQKSGRPLKSLKQRLKGKEGRV
RGNLMGKRVDFSARTVITPDPNLSIDQVGVPRSIAANMTFAEIVTPFNID
RLQELVRRGNSQYPGAKYIIRDNGDRIDLRFHPKPSDLHLQTGYKVERHM
CDGDIVIFNRQPTLHKMSMMGHRVRILPWSTFRLNLSVTTPYNADFDGDE
MNLHLPQSLETRAEIQELAMVPRMIVTPQSNRPVMGIVQDTLTAVRKFTK
RDVFLERGEVMNLLMFLSTWDGKVPQPAILKPRPLWTGKQIFSLIIPGHI
NCIRTHSTHPDDEDSGPYKHISPGDTKVVVENGELIMGILCKKSLGTSAG
SLVHISYLEMGHDITRLFYSNIQTVINNWLLIEGHTIGIGDSIADSKTYQ
DIQNTIKKAKQDVIEVIEKAHNNELEPTPGNTLRQTFENQVNRILNDARD
KTGSSAQKSLSEYNNFKSMVVSGAKGSKINISQVIAVVGQQNVEGKRIPF
GFKHRTLPHFIKDDYGPESRGFVENSYLAGLTPTEFFFHAMGGREGLIDT
AVKTAETGYIQRRLIKSMESVMVKYDATVRNSINQVVQLRYGEDGLAGES
VEFQNLATLKPSNKAFEKKFRFDYTNERALRRTLQEDLVKDVLSNAHIQN
ELEREFERMREDREVLRVIFPTGDSKVVLPCNLLRMIWNAQKIFHINPRL
PSDLHPIKVVEGVKELSKKLVIVNGDDPLSRQAQENATLLFNIHLRSTLC
SRRMAEEFRLSGEAFDWLLGEIESKFNQAIAHPGEMVGALAAQSLGEPAT
QMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPRLKELINISKKPKTPSLTVFLLGQSARD
AERAKDILCRLEHTTLRKVTANTAIYYDPNPQSTVVAEDQEWVNVYYEMP
DFDVARISPWLLRVELDRKHMTDRKLTMEQIAEKINAGFGDDLNCIFNDD
NAEKLVLRIRIMNSDENKMQEEEEVVDKMDDDVFLRCIESNMLTDMTLQG
IEQISKVYMHLPQTDNKKKIIITEDGEFKALQEWILETDGVSLMRVLSEK
DVDPVRTTSNDIVEIFTVLGIEAVRKALERELYHVISFDGSYVNYRHLAL
LCDTMTCRGHLMAITRHGVNRQDTGPLMKCSFEETVDVLMEAAAHGESDP
MKGVSENIMLGQLAPAGTGCFDLLLDAEKCKYGMEIPTNIPGLGAAGPTG
MFFGSAPSPMGGISPAMTPWNQGATPAYGAWSPSVGSGMTPGAAGFSPSA
ASDASGFSPGYSPAWSPTPGSPGSPGPSSPYIPSPGGAMSPSYSPTSPAY
EPRSPGGYTPQSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPSY
SPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYS
PTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSP
TSPNYTPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYTPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPT
SPSYSPSSPRYTPQSPTYTPSSPSYSPSSPSYSPASPKYTPTSPSYSPSS
PEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSP
VYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPT
SPTYSLTSPAISPDDSDEEN

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Wintzerith M., Acker J., Vicaire S., Vigneron M., Kedinger C. (1992). Complete sequence of the human RNA polymerase II largest subunit. Nucleic Acids Res. 20: 910—910. PMID 1542581 DOI:10.1093/nar/20.4.910
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes. J. Biol. Chem. 273: 34444—34453. PMID 9852112 DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
  • Parada C.A., Roeder R.G. (1999). A novel RNA polymerase II-containing complex potentiates Tat-enhanced HIV-1 transcription. EMBO J. 18: 3688—3701. PMID 10393184 DOI:10.1093/emboj/18.13.3688
  • Kim J.B., Yamaguchi Y., Wada T., Handa H., Sharp P.A. (1999). Tat-SF1 protein associates with RAP30 and human SPT5 proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 5960—5968. PMID 10454543 DOI:10.1128/MCB.19.9.5960
  • Allen M., Friedler A., Schon O., Bycroft M. (2002). The structure of an FF domain from human HYPA/FBP11. J. Mol. Biol. 323: 411—416. PMID 12381297 DOI:10.1016/S0022-2836(02)00968-3

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9187 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, P24928 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]