POLR2D

POLR2D
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2C35, 5IYD, 5IY8, 5IYC, 5IY6, 5IY7, 5IYA, 5IY9, 5IYB
Ідентифікатори
Символи	POLR2D, HSRBP4, HSRPB4, RBP4, RPB16, RNA polymerase II subunit B4, polymerase (RNA) II subunit D, RNA polymerase II subunit D, RPB4
Зовнішні ІД	OMIM: 606017 MGI: 1916491 HomoloGene: 37968 GeneCards: POLR2D
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • single-stranded DNA binding • каталітична активність • single-stranded RNA binding • translation initiation factor binding Клітинна компонента • P-body • РНК-полімераза II • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • nuclear DNA-directed RNA polymerase complex • RNA polymerase complex Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • recruitment of 3'-end processing factors to RNA polymerase II holoenzyme complex • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • 7-methylguanosine mRNA capping • transcription by RNA polymerase II • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • cell metabolism • transcription-coupled nucleotide-excision repair • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • positive regulation of translational initiation • mRNA export from nucleus in response to heat stress • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • snRNA transcription by RNA polymerase II • RNA metabolic process • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • DNA-templated transcription, initiation • transcription, DNA-templated • somatic stem cell population maintenance • positive regulation of viral transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5433	69241
Ensembl	ENSG00000144231	ENSMUSG00000024258
UniProt	O15514	Q9D7M8
RefSeq (мРНК)	NM_004805	NM_027002 NM_001357480
RefSeq (білок)	NP_004796	NP_081278 NP_001344409
Локус (UCSC)	Хр. 2: 127.84 – 127.86 Mb	Хр. 18: 31.92 – 31.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

POLR2D (англ. RNA polymerase II subunit D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 142 амінокислот, а молекулярна маса — 16 311.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAGGSDPRA		GDVEEDASQL		IFPKEFETAE		TLLNSEVHML		LEHRKQQNES
AEDEQELSEV		FMKTLNYTAR		FSRFKNRETI		ASVRSLLLQK		KLHKFELACL
ANLCPETAEE		SKALIPSLEG		RFEDEELQQI		LDDIQTKRSF		QY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як транскрипція. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes. J. Biol. Chem. 273: 34444—34453. PMID 9852112 DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
• Meka H., Werner F., Cordell S.C., Onesti S., Brick P. (2005). Crystal structure and RNA binding of the Rpb4/Rpb7 subunits of human RNA polymerase II. Nucleic Acids Res. 33: 6435—6444. PMID 16282592 DOI:10.1093/nar/gki945

Див. також

• Хромосома 2