PPCDC

PPCDC
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1QZU
Ідентифікатори
Символи	PPCDC, PPC-DC, coaC, MDS018, phosphopantothenoylcysteine decarboxylase
Зовнішні ІД	OMIM: 609854 MGI: 1914062 HomoloGene: 11049 GeneCards: PPCDC
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphopantothenoylcysteine decarboxylase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • carboxy-lyase activity • lyase activity • identical protein binding Клітинна компонента • гіалоплазма Біологічний процес • coenzyme A biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	60490	66812
Ensembl	ENSG00000138621	ENSMUSG00000063849
UniProt	Q96CD2	Q8BZB2
RefSeq (мРНК)	NM_001301101 NM_001301102 NM_001301103 NM_001301104 NM_001301105 NM_021823	NM_176831 NM_001357912 NM_001357913 NM_001357914 NM_001357915 NM_001357916 NM_001357918
RefSeq (білок)	NP_001288030 NP_001288031 NP_001288032 NP_001288033 NP_001288034 NP_068595	NP_789801 NP_001344841 NP_001344842 NP_001344843 NP_001344844 NP_001344845 NP_001344847
Локус (UCSC)	Хр. 15: 75.02 – 75.12 Mb	Хр. 9: 57.29 – 57.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PPCDC (англ. Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 204 амінокислот, а молекулярна маса — 22 395.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPKASCPAA		APLMERKFHV		LVGVTGSVAA		LKLPLLVSKL		LDIPGLEVAV
VTTERAKHFY		SPQDIPVTLY		SDADEWEIWK		SRSDPVLHID		LRRWADLLLV
APLDANTLGK		VASGICDNLL		TCVMRAWDRS		KPLLFCPAMN		TAMWEHPITA
QQVDQLKAFG		YVEIPCVAKK		LVCGDEGLGA		MAEVGTIVDK		VKEVLFQHSG
FQQS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, декарбоксилаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з флавопротеїном.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Strauss E., Zhai H., Brand L.A., McLafferty F.W., Begley T.P. (2004). Mechanistic studies on phosphopantothenoylcysteine decarboxylase: trapping of an enethiolate intermediate with a mechanism-based inactivating agent. Biochemistry. 43: 15520—15533. PMID 15581364 DOI:10.1021/bi048340a
• Manoj N., Ealick S.E. (2003). Unusual space-group pseudosymmetry in crystals of human phosphopantothenoylcysteine decarboxylase. Acta Crystallogr. D. 59: 1762—1766. PMID 14501115 DOI:10.1107/S0907444903016214

Див. також

• Хромосома 15