PPEF1

PPEF1
Ідентифікатори
Символи	PPEF1, PP7, PPEF, PPP7C, PPP7CA, protein phosphatase with EF-hand domain 1
Зовнішні ІД	OMIM: 300109 MGI: 1097157 HomoloGene: 55960 GeneCards: PPEF1
Онтологія гена Молекулярна функція • iron ion binding • calcium ion binding • protein serine/threonine phosphatase activity • phosphoprotein phosphatase activity • manganese ion binding • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • гіалоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0016576 protein dephosphorylation • detection of stimulus involved in sensory perception • regulation of rhodopsin mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5475	237178
Ensembl	ENSG00000086717	ENSMUSG00000062168
UniProt	O14829	O35655
RefSeq (мРНК)	NM_006240 NM_152223 NM_152224 NM_152225 NM_152226 NM_001377986 NM_001377993 NM_001377994 NM_001377995 NM_001377996 NM_001378381 NM_001378382 NM_001389620 NM_001389621 NM_001389623 NM_001389624	NM_011147
RefSeq (білок)	NP_006231 NP_689410 NP_689412 NP_001364915 NP_001364922 NP_001364923 NP_001364924 NP_001364925 NP_001365310 NP_001365311	NP_035277
Локус (UCSC)	Хр. X: 18.68 – 18.83 Mb	Хр. X: 159.41 – 159.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PPEF1 (англ. Protein phosphatase with EF-hand domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 653 амінокислот, а молекулярна маса — 75 792.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGCSSSSTKT		RRSDTSLRAA		LIIQNWYRGY		KARLKARQHY		ALTIFQSIEY
ADEQGQMQLS		TFFSFMLENY		THIHKEELEL		RNQSLESEQD		MRDRWDYVDS
IDVPDSYNGP		RLQFPLTCTD		IDLLLEAFKE		QQILHAHYVL		EVLFETKKVL
KQMPNFTHIQ		TSPSKEVTIC		GDLHGKLDDL		FLIFYKNGLP		SERNPYVFNG
DFVDRGKNSI		EILMILCVSF		LVYPNDLHLN		RGNHEDFMMN		LRYGFTKEIL
HKYKLHGKRI		LQILEEFYAW		LPIGTIVDNE		ILVIHGGISE		TTDLNLLHRV
ERNKMKSVLI		PPTETNRDHD		TDSKHNKVGV		TFNAHGRIKT		NGSPTEHLTE
HEWEQIIDIL		WSDPRGKNGC		FPNTCRGGGC		YFGPDVTSKI		LNKYQLKMLI
RSHECKPEGY		EICHDGKVVT		IFSASNYYEE		GSNRGAYIKL		CSGTTPRFFQ
YQVTKATCFQ		PLRQRVDTME		NSAIKILRER		VISRKSDLTR		AFQLQDHRKS
GKLSVSQWAF		CMENILGLNL		PWRSLSSNLV		NIDQNGNVEY		MSSFQNIRIE
KPVQEAHSTL		VETLYRYRSD		LEIIFNAIDT		DHSGLISVEE		FRAMWKLFSS
HYNVHIDDSQ		VNKLANIMDL		NKDGSIDFNE		FLKAFYVVHR		YEDLMKPDVT
NLG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію, іоном марганцю.

Література

• Huang X., Honkanen R.E. (1998). Molecular cloning, expression, and characterization of a novel human serine/threonine protein phosphatase, PP7, that is homologous to Drosophila retinal degeneration C gene product (rdgC). J. Biol. Chem. 273: 1462—1468. PMID 9430683 DOI:10.1074/jbc.273.3.1462
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Див. також

• Хромосома X