PRDM13

PRDM13
Ідентифікатори
Символи	PRDM13, MU-MB-20.220, PFM10, PR domain 13, PR/SET domain 13, CDIDHH
Зовнішні ІД	OMIM: 616741 MGI: 2448528 HomoloGene: 11000 GeneCards: PRDM13
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • DNA binding • histone methyltransferase activity • nucleic acid binding • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • chromatin binding • transferase activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • Метилювання • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • Нейрогенез • histone methylation • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	59336	230025
Ensembl	ENSG00000112238	ENSMUSG00000040478
UniProt	Q9H4Q3	E9PZZ1
RefSeq (мРНК)	NM_021620	NM_001080771
RefSeq (білок)	NP_067633	NP_001074240
Локус (UCSC)	Хр. 6: 99.61 – 99.62 Mb	Хр. 4: 21.68 – 21.69 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRDM13 (англ. PR/SET domain 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 707 амінокислот, а молекулярна маса — 73 981.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHGAARAPAT		SVSADCCIPA		GLRLGPVPGT		FKLGKYLSDR		REPGPKKKVR
MVRGELVDES		GGSPLEWIGL		IRAARNSQEQ		TLEAIADLPG		GQIFYRALRD
VQPGEELTVW		YSNSLAQWFD		IPTTATPTHD		EKGEERYICW		YCWRTFRYPN
SLKAHLRFHC		VFSGGGGGAF		LHHEHAARQG		AVPAADGLGL		SPKPPAPDFA
APSQAGTLRP		HPLGPPPVQA		CGAREGIKRE		ASSAPSATSP		TPGKWGQPKK
GKEQLDRALD		MSGAARGQGH		FLGIVGGSSA		GVGSLAFYPG		VRSAFKPAGL
ARAAAAAHGD		PYREESSSKQ		GAGLALGRLL		GGGRACGRPG		SGENSAAGGA
GHHHHHHAHH		HHHPKCLLAG		DPPPPPPPGL		PCSGALRGFP		LLSVPPEEAS
AFKHVERAPP		AAAALPGARY		AQLPPAPGLP		LERCALPPLD		PGGLKAYPGG
ECSHLPAVMP		AFTVYNGELL		YGSPATTAYY		PLKLHFGGLL		KYPESISYFS
GPAAAALSPA		ELGSLASIDR		EIAMHNQQLS		EMAAGKGRGR		LDSGTLPPAV
AAAGGTGGGG		SGGSGAGKPK		TGHLCLYCGK		LYSRKYGLKI		HMRTHTGYKP
LKCKVCLRPF		GDPSNLNKHI		RLHAEGNTPY		RCEFCGKVLV		RRRDLERHVK
SRHPGQSLLA		KAGDGPGAEP		GYPPEPGDPK		SDDSDVDVCF		TDDQSDPEVG
GGGERDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Див. також

• Хромосома 6