PRDM14

PRDM14
Ідентифікатори
Символи	PRDM14, PFM11, PR domain 14, PR/SET domain 14
Зовнішні ІД	OMIM: 611781 MGI: 3588194 HomoloGene: 11556 GeneCards: PRDM14
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • transferase activity • RNA binding • chromatin DNA binding • DNA binding • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • homeostasis of number of cells within a tissue • transcription, DNA-templated • somatic stem cell population maintenance • negative regulation of fibroblast growth factor receptor signaling pathway • GO:0000767 cell morphogenesis • Метилювання • регуляція експресії генів • stem cell population maintenance • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of DNA methylation • inner cell mass cell fate commitment • inactivation of paternal X chromosome • запліднення • germ cell development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Епігенетичне успадкування • histone H3-R26 methylation • cell fate specification • germ-line stem cell population maintenance • embryo implantation • positive regulation of flagellated sperm motility • positive regulation of stem cell population maintenance Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	63978	383491
Ensembl	ENSG00000147596	ENSMUSG00000042414
UniProt	Q9GZV8	E9Q3T6
RefSeq (мРНК)	NM_024504	NM_001081209
RefSeq (білок)	NP_078780	NP_001074678
Локус (UCSC)	Хр. 8: 70.05 – 70.07 Mb	Хр. 1: 13.18 – 13.2 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRDM14 (англ. PR/SET domain 14) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 571 амінокислот, а молекулярна маса — 64 062.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALPRPSEAV		PQDKVCYPPE		SSPQNLAAYY		TPFPSYGHYR		NSLATVEEDF
QPFRQLEAAA		SAAPAMPPFP		FRMAPPLLSP		GLGLQREPLY		DLPWYSKLPP
WYPIPHVPRE		VPPFLSSSHE		YAGASSEDLG		HQIIGGDNES		GPCCGPDTLI
PPPPADASLL		PEGLRTSQLL		PCSPSKQSED		GPKPSNQEGK		SPARFQFTEE
DLHFVLYGVT		PSLEHPASLH		HAISGLLVPP		DSSGSDSLPQ		TLDKDSLQLP
EGLCLMQTVF		GEVPHFGVFC		SSFIAKGVRF		GPFQGKVVNA		SEVKTYGDNS
VMWEIFEDGH		LSHFIDGKGG		TGNWMSYVNC		ARFPKEQNLV		AVQCQGHIFY
ESCKEIHQNQ		ELLVWYGDCY		EKFLDIPVSL		QVTEPGKQPS		GPSEESAEGY
RCERCGKVFT		YKYYRDKHLK		YTPCVDKGDR		KFPCSLCKRS		FEKRDRLRIH
ILHVHEKHRP		HKCSTCGKCF		SQSSSLNKHM		RVHSGDRPYQ		CVYCTKRFTA
SSILRTHIRQ		HSGEKPFKCK		YCGKSFASHA		AHDSHVRRSH		KEDDGCSCSI
CGKIFSDQET		FYSHMKFHED		Y

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 8