PRDM15

PRDM15
Ідентифікатори
Символи	PRDM15, C21orf83, PFM15, ZNF298, PR domain 15, PR/SET domain 15
Зовнішні ІД	OMIM: 617692 MGI: 1930121 HomoloGene: 56941 GeneCards: PRDM15
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Паркінсона
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • promoter-specific chromatin binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • Метилювання • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of MAPK cascade • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • regulation of stem cell division • multicellular organism development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	63977	114604
Ensembl	ENSG00000141956	ENSMUSG00000014039
UniProt	P57071	E9Q8T2
RefSeq (мРНК)	NM_001040424 NM_001282934 NM_022115	NM_144789 NM_001359077 NM_001359078
RefSeq (білок)	NP_001035514 NP_001269863 NP_071398	NP_001346006 NP_001346007 NP_659038 NP_001390355 NP_001390356 NP_001390357 NP_001390358 NP_001390359 NP_001390360 NP_001390361 NP_001390366 NP_001390367
Локус (UCSC)	Хр. 21: 41.8 – 41.88 Mb	Хр. 16: 97.59 – 97.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRDM15 (англ. PR/SET domain 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 507 амінокислот, а молекулярна маса — 169 269.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPRRRPPASG		AAQFPERIAT		RSPDPIPLCT		FQRQPRAAPV		QPPCRLFFVT
FAGCGHRWRS		ESKPGWISRS		RSGIALRAAR		PPGSSPPRPA		APRPPPPGGV
VAEAPGDVVI		PRPRVQPMRV		ARGGPWTPNP		AFREAESWSQ		IGNQRVSEQL
LETSLGNEVS		DTEPLSPASA		GLRRNPALPP		GPFAQNFSWG		NQENLPPALG
KIANGGGTGA		GKAECGYETE		SHLLEPHEIP		LNVNTHKFSD		CEFPYEFCTV
CFSPFKLLGM		SGVEGVWNQH		SRSASMHTFL		NHSATGIREA		GCRKDMPVSE
MAEDGSEEIM		FIWCEDCSQY		HDSECPELGP		VVMVKDSFVL		SRARSWPASG
HVHTQAGQGM		RGYEDRDRAD		PQQLPEAVPA		GLVRRLSGQQ		LPCRSTLTWG
RLCHLVAQGR		SSLPPNLEIR		RLEDGAEGVF		AITQLVKRTQ		FGPFESRRVA
KWEKESAFPL		KVFQKDGHPV		CFDTSNEDDC		NWMMLVRPAA		EAEHQNLTAY
QHGSDVYFTT		SRDIPPGTEL		RVWYAAFYAK		KMDKPMLKQA		GSGVHAAGTP
ENSAPVESEP		SQWACKVCSA		TFLELQLLNE		HLLGHLEQAK		SLPPGSQSEA
AAPEKEQDTP		RGEPPAVPES		ENVATKEQKK		KPRRGRKPKV		SKAEQPLVIV
EDKEPTEQVA		EIITEVPPDE		PVSATPDERI		MELVLGKLAT		TTTDTSSVPK
FTHHQNNTIT		LKRSLILSSR		HGIRRKLIKQ		LGEHKRVYQC		NICSKIFQNS
SNLSRHVRSH		GDKLFKCEEC		AKLFSRKESL		KQHVSYKHSR		NEVDGEYRYR
CGTCEKTFRI		ESALEFHNCR		TDDKTFQCEM		CFRFFSTNSN		LSKHKKKHGD
KKFACEVCSK		MFYRKDVMLD		HQRRHLEGVR		RVKREDLEAG		GENLVRYKKE
PSGCPVCGKV		FSCRSNMNKH		LLTHGDKKYT		CEICGRKFFR		VDVLRDHIHV
HFKDIALMDD		HQREEFIGKI		GISSEENDDN		SDESADSEPH		KYSCKRCQLT
FGRGKEYLKH		IMEVHKEKGY		GCSICNRRFA		LKATYHAHMV		IHRENLPDPN
VQKYIHPCEI		CGRIFNSIGN		LERHKLIHTG		VKSHACEQCG		KSFARKDMLK
EHMRVHDNVR		EYLCAECGKG		MKTKHALRHH		MKLHKGIKEY		ECKECHRRFA
QKVNMLKHCK		RHTGIKDFMC		ELCGKTFSER		NTMETHKLIH		TVGKQWTCSV
CDKKYVTEYM		LQKHVQLTHD		KVEAQSCQLC		GTKVSTRASM		SRHMRRKHPE
VLAVRIDDLD		HLPETTTIDA		SSIGIVQPEL		TLEQEDLAEG		KHGKAAKRSH
KRKQKPEEEA		GAPVPEDATF		SEYSEKETEF		TGSVGDETNS		AVQSIQQVVV
TLGDPNVTTP		SSSVGLTNIT		VTPITTAAAT		QFTNLQPVAV		GHLTTPERQL
QLDNSILTVT		FDTVSGSAML		HNRQNDVQIH		PQPEASNPQS		VAHFINLTTL
VNSITPLGSQ		LSDQHPLTWR		AVPQTDVLPP		SQPQAPPQQA		AQPQVQAEQQ
QQQMYSY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

• Gardiner K., Slavov D., Bechtel L., Davisson M. (2002). Annotation of human chromosome 21 for relevance to Down syndrome: gene structure and expression analysis. Genomics. 79: 833—843. PMID 12036298 DOI:10.1006/geno.2002.6782
• Shibuya K., Kudoh J., Okui M., Shimizu N. (2005). Identification of a novel zinc finger protein gene (ZNF298) in the GAP2 of human chromosome 21q. Biochem. Biophys. Res. Commun. 332: 557—568. PMID 15904895 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.04.159

Див. також

• Хромосома 21