PRDM4

PRDM4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2L9Z, 3DB5
Ідентифікатори
Символи	PRDM4, PFM1, PR domain 4, PR/SET domain 4
Зовнішні ІД	OMIM: 605780 MGI: 1920093 HomoloGene: 8235 GeneCards: PRDM4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • DNA binding • histone methyltransferase binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма • histone methyltransferase complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone H4-R3 methylation • transcription, DNA-templated • Метилювання • проліферація • GO:0072468 сигнальна трансдукція • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11108	72843
Ensembl	ENSG00000110851	ENSMUSG00000035529
UniProt	Q9UKN5	Q80V63
RefSeq (мРНК)	NM_012406	NM_181650 NM_001302886 NM_001302887
RefSeq (білок)	NP_036538	NP_001289815 NP_001289816 NP_857633
Локус (UCSC)	Хр. 12: 107.73 – 107.76 Mb	Хр. 10: 85.73 – 85.75 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRDM4 (англ. PR/SET domain 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 801 амінокислот, а молекулярна маса — 87 920.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHHRMNEMNL		SPVGMEQLTS		SSVSNALPVS		GSHLGLAASP		THSAIPAPGL
PVAIPNLGPS		LSSLPSALSL		MLPMGIGDRG		VMCGLPERNY		TLPPPPYPHL
ESSYFRTILP		GILSYLADRP		PPQYIHPNSI		NVDGNTALSI		TNNPSALDPY
QSNGNVGLEP		GIVSIDSRSV		NTHGAQSLHP		SDGHEVALDT		AITMENVSRV
TSPISTDGMA		EELTMDGVAG		EHSQIPNGSR		SHEPLSVDSV		SNNLAADAVG
HGGVIPMHGN		GLELPVVMET		DHIASRVNGM		SDSALSDSIH		TVAMSTNSVS
VALSTSHNLA		SLESVSLHEV		GLSLEPVAVS		SITQEVAMGT		GHVDVSSDSL
SFVSPSLQME		DSNSNKENMA		TLFTIWCTLC		DRAYPSDCPE		HGPVTFVPDT
PIESRARLSL		PKQLVLRQSI		VGAEVGVWTG		ETIPVRTCFG		PLIGQQSHSM
EVAEWTDKAV		NHIWKIYHNG		VLEFCIITTD		ENECNWMMFV		RKARNREEQN
LVAYPHDGKI		FFCTSQDIPP		ENELLFYYSR		DYAQQIGVPE		HPDVHLCNCG
KECNSYTEFK		AHLTSHIHNH		LPTQGHSGSH		GPSHSKERKW		KCSMCPQAFI
SPSKLHVHFM		GHMGMKPHKC		DFCSKAFSDP		SNLRTHLKIH		TGQKNYRCTL
CDKSFTQKAH		LESHMVIHTG		EKNLKCDYCD		KLFMRRQDLK		QHVLIHTQER
QIKCPKCDKL		FLRTNHLKKH		LNSHEGKRDY		VCEKCTKAYL		TKYHLTRHLK
TCKGPTSSSS		APEEEEEDDS		EEEDLADSVG		TEDCRINSAV		YSADESLSAH
K

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

• Yang X.-H., Huang S. (1999). PFM1 (PRDM4), a new member of the PR-domain family, maps to a tumor suppressor locus on human chromosome 12q23-q24.1. Genomics. 61: 319—325. PMID 10552934 DOI:10.1006/geno.1999.5967
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 12