PRDM6

PRDM6
Ідентифікатори
Символи	PRDM6, PRISM, PR domain 6, PR/SET domain 6, PDA3, KMT8C
Зовнішні ІД	OMIM: 616982 MGI: 2684938 HomoloGene: 79756 GeneCards: PRDM6
Пов'язані генетичні захворювання
patent ductus arteriosus 3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • protein homodimerization activity • histone-lysine N-methyltransferase activity • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • histone lysine methylation • Нейрогенез • Метилювання • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of smooth muscle cell differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	93166	225518
Ensembl	ENSG00000061455	ENSMUSG00000069378
UniProt	Q9NQX0	Q3UZD5
RefSeq (мРНК)	NM_001136239	NM_001033281
RefSeq (білок)	NP_001129711	NP_001028453
Локус (UCSC)	Хр. 5: 123.09 – 123.19 Mb	Хр. 18: 53.6 – 53.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRDM6 (англ. PR/SET domain 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 595 амінокислот, а молекулярна маса — 64 452.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLKPGDPGGS		AFLKVDPAYL		QHWQQLFPHG		GAGPLKGSGA		AGLLSAPQPL
QPPPPPPPPE		RAEPPPDSLR		PRPASLSSAS		STPASSSTSA		SSASSCAAAA
AAAALAGLSA		LPVSQLPVFA		PLAAAAVAAE		PLPPKELCLG		ATSGPGPVKC
GGGGGGGGEG		RGAPRFRCSA		EELDYYLYGQ		QRMEIIPLNQ		HTSDPNNRCD
MCADNRNGEC		PMHGPLHSLR		RLVGTSSAAA		AAPPPELPEW		LRDLPREVCL
CTSTVPGLAY		GICAAQRIQQ		GTWIGPFQGV		LLPPEKVQAG		AVRNTQHLWE
IYDQDGTLQH		FIDGGEPSKS		SWMRYIRCAR		HCGEQNLTVV		QYRSNIFYRA
CIDIPRGTEL		LVWYNDSYTS		FFGIPLQCIA		QDENLNVPST		VMEAMCRQDA
LQPFNKSSKL		APTTQQRSVV		FPQTPCSRNF		SLLDKSGPIE		SGFNQINVKN
QRVLASPTST		SQLHSEFSDW		HLWKCGQCFK		TFTQRILLQM		HVCTQNPDRP
YQCGHCSQSF		SQPSELRNHV		VTHSSDRPFK		CGYCGRAFAG		ATTLNNHIRT
HTGEKPFKCE		RCERSFTQAT		QLSRHQRMPN		ECKPITESPE		SIEVD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, регуляторів хроматину, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

• Jiang G.L., Huang S. (2000). The yin-yang of PR-domain family genes in tumorigenesis. Histol. Histopathol. 15: 109—117. PMID 10668202

Див. також

• Хромосома 5