PRDM7

PRDM7
Ідентифікатори
Символи	PRDM7, PFM4, ZNF910, PR domain 7, PR/SET domain 7
Зовнішні ІД	OMIM: 609759 HomoloGene: 135795 GeneCards: PRDM7
Онтологія гена Молекулярна функція • histone-lysine N-methyltransferase activity • nucleic acid binding • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin DNA binding • histone methyltransferase activity (H3-K4 specific) • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • клітинне ядро • внутрішньоклітинний • хромосома Біологічний процес • Метилювання • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone lysine methylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of reciprocal meiotic recombination • histone H3-K4 methylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11105	174425
Ensembl	ENSG00000126856	WBGene00011887
UniProt	Q9NQW5	A0A163UT06
RefSeq (мРНК)	NM_001098173 NM_052996	NM_001330955 NM_001381544
RefSeq (білок)	NP_001091643	NP_001317778 NP_001368599
Локус (UCSC)	Хр. 16: 90.06 – 90.09 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRDM7 (англ. PR/SET domain 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 492 амінокислот, а молекулярна маса — 55 777.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSPERSQEES		PEGDTERTER		KPMVKDAFKD		ISIYFTKEEW		AEMGDWEKTR
YRNVKMNYNA		LITVGLRATR		PAFMCHRRQA		IKLQVDDTED		SDEEWTPRQQ
VKPPWMAFRG		EQSKHQKGMP		KASFNNESSL		RELSGTPNLL		NTSDSEQAQK
PVSPPGEAST		SGQHSRLKLE		LRRKETEGKM		YSLRERKGHA		YKEISEPQDD
DYLYCEMCQN		FFIDSCAAHG		PPTFVKDSAV		DKGHPNRSAL		SLPPGLRIGP
SGIPQAGLGV		WNEASDLPLG		LHFGPYEGRI		TEDEEAANSG		YSWLITKGRN
CYEYVDGKDK		SSANWMRYVN		CARDDEEQNL		VAFQYHRQIF		YRTCRVIRPG
CELLVWSGDE		YGQELGIRSS		IEPAESLGQA		VNCWSGMGMS		MARNWASSGA
ASGRKSSWQG		ENQSQRSIHV		PHAVWPFQVK		NFSVNMWNAI		TPLRTSQDHL
QENFSNQRIP		AQGIRIRSGN		ILIHAAVMTK		PKVKRSKKGP		NS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, регуляторів хроматину, метилтрансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 doi:10.1186/gb-2004-5-2-r8
• Jiang G.L., Huang S. (2000). The yin-yang of PR-domain family genes in tumorigenesis. Histol. Histopathol. 15: 109—117. PMID 10668202

Див. також

• Хромосома 16