PRDM8

PRDM8
Ідентифікатори
Символи	PRDM8, PFM5, EPM10, PR domain 8, PR/SET domain 8, KMT8D
Зовнішні ІД	OMIM: 616639 MGI: 1924880 HomoloGene: 129760 GeneCards: PRDM8
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • oligodendrocyte development • Метилювання • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56978	77630
Ensembl	ENSG00000152784	ENSMUSG00000035456
UniProt	Q9NQV8	Q8BZ97
RefSeq (мРНК)	NM_001099403 NM_020226	NM_029947
RefSeq (білок)	NP_001092873 NP_064611	NP_084223 NP_001394923 NP_001394924 NP_001394925
Локус (UCSC)	Хр. 4: 80.18 – 80.2 Mb	Хр. 5: 98.32 – 98.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRDM8 (англ. PR/SET domain 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 689 амінокислот, а молекулярна маса — 71 663.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEDTGIQRGI		WDGDAKAVQQ		CLTDIFTSVY		TTCDIPENAI		FGPCVLSHTS
LYDSIAFIAL		KSTDKRTVPY		IFRVDTSAAN		GSSEGLMWLR		LVQSARDKEE
QNLEAYIKNG		QLFYRSLRRI		AKDEELLVWY		GKELTELLLL		CPSRSHNKMN
GSSPYTCLEC		SQRFQFEFPY		VAHLRFRCPK		RLHSADISPQ		DEQGGGVGTK
DHGGGGGGGK		DQQQQQQEAP		LGPGPKFCKA		GPLHHYPSPS		PESSNPSAAA
GGSSAKPSTD		FHNLARELEN		SRGGSSCSPA		QSLSSGSGSG		GGGGHQEAEL
SPDGIATGGG		KGKRKFPEEA		AEGGGGAGLV		GGRGRFVERP		LPASKEDLVC
TPQQYRASGS		YFGLEENGRL		FAPPSPETGE		AKRSAFVEVK		KAARAASLQE
EGTADGAGVA		SEDQDAGGGG		GSSTPAAASP		VGAEKLLAPR		PGGPLPSRLE
GGSPARGSAF		TSVPQLGSAG		STSGGGGTGA		GAAGGAGGGQ		GAASDERKSA
FSQPARSFSQ		LSPLVLGQKL		GALEPCHPAD		GVGPTRLYPA		AADPLAVKLQ
GAADLNGGCG		SLPSGGGGLP		KQSPFLYATA		FWPKSSAAAA		AAAAAAAAGP
LQLQLPSALT		LLPPSFTSLC		LPAQNWCAKC		NASFRMTSDL		VYHMRSHHKK
EYAMEPLVKR		RREEKLKCPI		CNESFRERHH		LSRHMTSHN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4