PRMT5

PRMT5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4GQB, 4X60, 4X61, 4X63, 5EML, 5FA5, 5EMJ, 5EMK, 5EMM, 5C9Z
Ідентифікатори
Символи	PRMT5, HRMT1L5, IBP72, JBP1, SKB1, SKB1Hs, Protein arginine methyltransferase 5, HSL7
Зовнішні ІД	OMIM: 604045 MGI: 1351645 HomoloGene: 4454 GeneCards: PRMT5
шифр КФ	2.1.1.321
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • histone methyltransferase activity (H4-R3 specific) • GO:0001106 transcription corepressor activity • methyl-CpG binding • core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • ribonucleoprotein complex binding • histone-arginine N-methyltransferase activity • protein-arginine N-methyltransferase activity • protein-arginine omega-N symmetric methyltransferase activity • identical protein binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • E-box binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • нуклеоплазма • methylosome • клітинне ядро • histone methyltransferase complex • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • regulation of mitotic nuclear division • positive regulation of oligodendrocyte differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone H4-R3 methylation • ритмічний процес • DNA-templated transcription, termination • negative regulation of cell differentiation • peptidyl-arginine N-methylation • endothelial cell activation • circadian regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • spliceosomal snRNP assembly • liver regeneration • Метилювання • peptidyl-arginine methylation • regulation of ERK1 and ERK2 cascade • regulation of DNA methylation • проліферація • Golgi ribbon formation • Метилювання білків • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • positive regulation of adenylate cyclase-inhibiting dopamine receptor signaling pathway • regulation of signal transduction by p53 class mediator • peptidyl-arginine methylation, to symmetrical-dimethyl arginine • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • histone arginine methylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10419	27374
Ensembl	ENSG00000100462	ENSMUSG00000023110
UniProt	O14744	Q8CIG8
RefSeq (мРНК)	NM_001039619 NM_001282953 NM_001282954 NM_001282955 NM_001282956 NM_006109	NM_013768 NM_001313906 NM_001313907
RefSeq (білок)	NP_001034708 NP_001269882 NP_001269883 NP_001269884 NP_001269885 NP_006100	NP_001300835 NP_001300836 NP_038796
Локус (UCSC)	Хр. 14: 22.92 – 22.93 Mb	Хр. 14: 54.74 – 54.75 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRMT5 (англ. Protein arginine methyltransferase 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 637 амінокислот, а молекулярна маса — 72 684.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAMAVGGAG		GSRVSSGRDL		NCVPEIADTL		GAVAKQGFDF		LCMPVFHPRF
KREFIQEPAK		NRPGPQTRSD		LLLSGRDWNT		LIVGKLSPWI		RPDSKVEKIR
RNSEAAMLQE		LNFGAYLGLP		AFLLPLNQED		NTNLARVLTN		HIHTGHHSSM
FWMRVPLVAP		EDLRDDIIEN		APTTHTEEYS		GEEKTWMWWH		NFRTLCDYSK
RIAVALEIGA		DLPSNHVIDR		WLGEPIKAAI		LPTSIFLTNK		KGFPVLSKMH
QRLIFRLLKL		EVQFIITGTN		HHSEKEFCSY		LQYLEYLSQN		RPPPNAYELF
AKGYEDYLQS		PLQPLMDNLE		SQTYEVFEKD		PIKYSQYQQA		IYKCLLDRVP
EEEKDTNVQV		LMVLGAGRGP		LVNASLRAAK		QADRRIKLYA		VEKNPNAVVT
LENWQFEEWG		SQVTVVSSDM		REWVAPEKAD		IIVSELLGSF		ADNELSPECL
DGAQHFLKDD		GVSIPGEYTS		FLAPISSSKL		YNEVRACREK		DRDPEAQFEM
PYVVRLHNFH		QLSAPQPCFT		FSHPNRDPMI		DNNRYCTLEF		PVEVNTVLHG
FAGYFETVLY		QDITLSIRPE		THSPGMFSWF		PILFPIKQPI		TVREGQTICV
RFWRCSNSKK		VWYEWAVTAP		VCSAIHNPTG		RSYTIGL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, регуляторів хроматину, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з s-аденозил-l-метіоніном. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, апараті гольджі.

Література

• Krapivinsky G., Pu W., Wickman K., Krapivinsky L., Clapham D.E. (1998). pICln binds to a mammalian homolog of a yeast protein involved in regulation of cell morphology. J. Biol. Chem. 273: 10811—10814. PMID 9556550 DOI:10.1074/jbc.273.18.10811
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Meister G., Fischer U. (2002). Assisted RNP assembly: SMN and PRMT5 complexes cooperate in the formation of spliceosomal UsnRNPs. EMBO J. 21: 5853—5863. PMID 12411503 DOI:10.1093/emboj/cdf585
• Jiang W., Roemer M.E., Newsham I.F. (2005). The tumor suppressor DAL-1/4.1B modulates protein arginine N-methyltransferase 5 activity in a substrate-specific manner. Biochem. Biophys. Res. Commun. 329: 522—530. PMID 15737618 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.01.153
• Schwaerzler A., Kreienkamp H.-J., Richter D. (2000). Interaction of the somatostatin receptor subtype 1 with the human homolog of the Shk1 kinase-binding protein from yeast. J. Biol. Chem. 275: 9557—9562. PMID 10734105 DOI:10.1074/jbc.275.13.9557
• Pal S., Vishwanath S.N., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Sif S. (2004). Human SWI/SNF-associated PRMT5 methylates histone H3 arginine 8 and negatively regulates expression of ST7 and NM23 tumor suppressor genes. Mol. Cell. Biol. 24: 9630—9645. PMID 15485929 DOI:10.1128/MCB.24.21.9630-9645.2004

Див. також

• Хромосома 14