Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
PSMC5
Ідентифікатори
Символи
PSMC5 , S8, SUG-1, SUG1, TBP10, TRIP1, p45, p45/SUG, proteasome 26S subunit, ATPase 5, RPT6
Зовнішні ІД
OMIM : 601681 MGI: 105047 HomoloGene: 2098 GeneCards: PSMC5
Онтологія гена
Молекулярна функція
• nucleotide binding • thyrotropin-releasing hormone receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • signaling receptor binding • hydrolase activity • ATPase activity • TBP-class protein binding • transcription factor binding • proteasome-activating activity
Клітинна компонента
• гіалоплазма • proteasome regulatory particle, base subcomplex • blood microparticle • мембрана • proteasome regulatory particle • нуклеоплазма • inclusion body • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • Протеасома • cytosolic proteasome complex • цитоплазма • proteasome accessory complex • клітинне ядро • nuclear proteasome complex • postsynapse
Біологічний процес
• positive regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly • regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • regulation of mRNA stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of inclusion body assembly • MAPK cascade • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • Fc-epsilon receptor signaling pathway • GO:0044257 protein catabolic process • NIK/NF-kappaB signaling • ubiquitin-dependent ERAD pathway • negative regulation of programmed cell death • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • positive regulation of proteasomal protein catabolic process • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • modulation of chemical synaptic transmission • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 17: 63.83 – 63.83 Mb
Хр. 11: 106.15 – 106.15 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
PSMC5 (англ. Proteasome 26S subunit, ATPase 5 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 406 амінокислот , а молекулярна маса — 45 626[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MALDGPEQME LEEGKAGSGL RQYYLSKIEE LQLIVNDKSQ NLRRLQAQRN
ELNAKVRLLR EELQLLQEQG SYVGEVVRAM DKKKVLVKVH PEGKFVVDVD
KNIDINDVTP NCRVALRNDS YTLHKILPNK VDPLVSLMMV EKVPDSTYEM
IGGLDKQIKE IKEVIELPVK HPELFEALGI AQPKGVLLYG PPGTGKTLLA
RAVAHHTDCT FIRVSGSELV QKFIGEGARM VRELFVMARE HAPSIIFMDE
IDSIGSSRLE GGSGGDSEVQ RTMLELLNQL DGFEATKNIK VIMATNRIDI
LDSALLRPGR IDRKIEFPPP NEEARLDILK IHSRKMNLTR GINLRKIAEL
MPGASGAEVK GVCTEAGMYA LRERRVHVTQ EDFEMAVAKV MQKDSEKNMS
IKKLWK
Білок має сайт для зв'язування з АТФ , нуклеотидами .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Lee J.W., Choi H.-S., Gyuris J., Brent R., Moore D.D. (1995). Two classes of proteins dependent on either the presence or absence of thyroid hormone for interaction with the thyroid hormone receptor. Mol. Endocrinol . 9 : 243—254. PMID 7776974 DOI :10.1210/mend.9.2.7776974
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Chen Y., Sharp Z.D., Lee W.-H. (1997). HEC binds to the seventh regulatory subunit of the 26 S proteasome and modulates the proteolysis of mitotic cyclins. J. Biol. Chem . 272 : 24081—24087. PMID 9295362 DOI :10.1074/jbc.272.38.24081
Zheng L., Chen Y., Lee W.-H. (1999). Hec1p, an evolutionarily conserved coiled-coil protein, modulates chromosome segregation through interaction with SMC proteins . Mol. Cell. Biol . 19 : 5417—5428. PMID 10409732 DOI :10.1128/MCB.19.8.5417
Huang X., Luan B., Wu J., Shi Y. (2016). An atomic structure of the human 26S proteasome. Nat. Struct. Mol. Biol . 23 : 778—785. PMID 27428775 DOI :10.1038/nsmb.3273