PTPN13

PTPN13
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1D5G, 1Q7X, 1WCH, 2M0Z, 2M10, 3LNX, 3LNY, 3PDZ
Ідентифікатори
Символи	PTPN13, FAP-1, PNP1, PTP-BAS, PTP-BL, PTP1E, PTPL1, PTPLE, hPTP1E, protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, protein tyrosine phosphatase non-receptor type 13
Зовнішні ІД	OMIM: 600267 MGI: 103293 HomoloGene: 7909 GeneCards: PTPN13
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein tyrosine phosphatase activity; • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity; • phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • phosphoprotein phosphatase activity; • hydrolase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • cell body; • neuron projection; • cell projection; • екзосома; • цитоскелет; • клітинне ядро; • lamellipodium; • клітинна мембрана; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• GO:0016576 protein dephosphorylation; • peptidyl-tyrosine dephosphorylation; • regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling; • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання; • phosphatidylinositol biosynthetic process; • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation; • cellular response to cytokine stimulus; • bicellular tight junction assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5783
	19249
	ENSG00000163629
	ENSMUSG00000034573
	Q12923
	Q64512
	NM_006264; NM_080683; NM_080684; NM_080685
	NM_011204
	NP_006255; NP_542414; NP_542415; NP_542416
	NP_035334
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PTPN13 (англ. Protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 485 амінокислот, а молекулярна маса — 276 906^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MHVSLAEALE	VRGGPLQEEE	IWAVLNQSAE	SLQELFRKVS	LADPAALGFI
ISPWSLLLLP	SGSVSFTDEN	ISNQDLRAFT	APEVLQNQSL	TSLSDVEKIH
IYSLGMTLYW	GADYEVPQSQ	PIKLGDHLNS	ILLGMCEDVI	YARVSVRTVL
DACSAHIRNS	NCAPSFSYVK	HLVKLVLGNL	SGTDQLSCNS	EQKPDRSQAI
RDRLRGKGLP	TGRSSTSDVL	DIQKPPLSHQ	TFLNKGLSKS	MGFLSIKDTQ
DENYFKDILS	DNSGREDSEN	TFSPYQFKTS	GPEKKPIPGI	DVLSKKKIWA
SSMDLLCTAD	RDFSSGETAT	YRRCHPEAVT	VRTSTTPRKK	EARYSDGSIA
LDIFGPQKMD	PIYHTRELPT	SSAISSALDR	IRERQKKLQV	LREAMNVEEP
VRRYKTYHGD	VFSTSSESPS	IISSESDFRQ	VRRSEASKRF	ESSSGLPGVD
ETLSQGQSQR	PSRQYETPFE	GNLINQEIML	KRQEEELMQL	QAKMALRQSR
LSLYPGDTIK	ASMLDITRDP	LREIALETAM	TQRKLRNFFG	PEFVKMTIEP
FISLDLPRSI	LTKKGKNEDN	RRKVNIMLLN	GQRLELTCDT	KTICKDVFDM
VVAHIGLVEH	HLFALATLKD	NEYFFVDPDL	KLTKVAPEGW	KEEPKKKTKA
TVNFTLFFRI	KFFMDDVSLI	QHTLTCHQYY	LQLRKDILEE	RMHCDDETSL
LLASLALQAE	YGDYQPEVHG	VSYFRMEHYL	PARVMEKLDL	SYIKEELPKL
HNTYVGASEK	ETELEFLKVC	QRLTEYGVHF	HRVHPEKKSQ	TGILLGVCSK
GVLVFEVHNG	VRTLVLRFPW	RETKKISFSK	KKITLQNTSD	GIKHGFQTDN
SKICQYLLHL	CSYQHKFQLQ	MRARQSNQDA	QDIERASFRS	LNLQAESVRG
FNMGRAISTG	SLASSTLNKL	AVRPLSVQAE	ILKRLSCSEL	SLYQPLQNSS
KEKNDKASWE	EKPREMSKSY	HDLSQASLYP	HRKNVIVNME	PPPQTVAELV
GKPSHQMSRS	DAESLAGVTK	LNNSKSVASL	NRSPERRKHE	SDSSSIEDPG
QAYVLGMTMH	SSGNSSSQVP	LKENDVLHKR	WSIVSSPERE	ITLVNLKKDA
KYGLGFQIIG	GEKMGRLDLG	IFISSVAPGG	PADLDGCLKP	GDRLISVNSV
SLEGVSHHAA	IEILQNAPED	VTLVISQPKE	KISKVPSTPV	HLTNEMKNYM
KKSSYMQDSA	IDSSSKDHHW	SRGTLRHISE	NSFGPSGGLR	EGSLSSQDSR
TESASLSQSQ	VNGFFASHLG	DQTWQESQHG	SPSPSVISKA	TEKETFTDSN
QSKTKKPGIS	DVTDYSDRGD	SDMDEATYSS	SQDHQTPKQE	SSSSVNTSNK
MNFKTFSSSP	PKPGDIFEVE	LAKNDNSLGI	SVTGGVNTSV	RHGGIYVKAV
IPQGAAESDG	RIHKGDRVLA	VNGVSLEGAT	HKQAVETLRN	TGQVVHLLLE
KGQSPTSKEH	VPVTPQCTLS	DQNAQGQGPE	KVKKTTQVKD	YSFVTEENTF
EVKLFKNSSG	LGFSFSREDN	LIPEQINASI	VRVKKLFPGQ	PAAESGKIDV
GDVILKVNGA	SLKGLSQQEV	ISALRGTAPE	VFLLLCRPPP	GVLPEIDTAL
LTPLQSPAQV	LPNSSKDSSQ	PSCVEQSTSS	DENEMSDKSK	KQCKSPSRRD
SYSDSSGSGE	DDLVTAPANI	SNSTWSSALH	QTLSNMVSQA	QSHHEAPKSQ
EDTICTMFYY	PQKIPNKPEF	EDSNPSPLPP	DMAPGQSYQP	QSESASSSSM
DKYHIHHISE	PTRQENWTPL	KNDLENHLED	FELEVELLIT	LIKSEKGSLG
FTVTKGNQRI	GCYVHDVIQD	PAKSDGRLKP	GDRLIKVNDT	DVTNMTHTDA
VNLLRAASKT	VRLVIGRVLE	LPRIPMLPHL	LPDITLTCNK	EELGFSLCGG
HDSLYQVVYI	SDINPRSVAA	IEGNLQLLDV	IHYVNGVSTQ	GMTLEEVNRA
LDMSLPSLVL	KATRNDLPVV	PSSKRSAVSA	PKSTKGNGSY	SVGSCSQPAL
TPNDSFSTVA	GEEINEISYP	KGKCSTYQIK	GSPNLTLPKE	SYIQEDDIYD
DSQEAEVIQS	LLDVVDEEAQ	NLLNENNAAG	YSCGPGTLKM	NGKLSEERTE
DTDCDGSPLP	EYFTEATKMN	GCEEYCEEKV	KSESLIQKPQ	EKKTDDDEIT
WGNDELPIER	TNHEDSDKDH	SFLTNDELAV	LPVVKVLPSG	KYTGANLKSV
IRVLRGLLDQ	GIPSKELENL	QELKPLDQCL	IGQTKENRRK	NRYKNILPYD
ATRVPLGDEG	GYINASFIKI	PVGKEEFVYI	ACQGPLPTTV	GDFWQMIWEQ
KSTVIAMMTQ	EVEGEKIKCQ	RYWPNILGKT	TMVSNRLRLA	LVRMQQLKGF
VVRAMTLEDI	QTREVRHISH	LNFTAWPDHD	TPSQPDDLLT	FISYMRHIHR
SGPIITHCSA	GIGRSGTLIC	IDVVLGLISQ	DLDFDISDLV	RCMRLQRHGM
VQTEDQYIFC	YQVILYVLTR	LQAEEEQKQQ	PQLLK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних відростках.

Література

Maekawa K., Imagawa N., Nagamatsu M., Harada S. (1994). Molecular cloning of a novel protein-tyrosine phosphatase containing a membrane-binding domain and GLGF repeats. FEBS Lett. 337: 200—206. PMID 8287977 doi:10.1016/0014-5793(94)80273-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Sato T., Irie S., Kitada S., Reed J.C. (1995). FAP-1: a protein tyrosine phosphatase that associates with Fas. Science. 268: 411—415. PMID 7536343 doi:10.1126/science.7536343
Murthy K.K., Clark K., Fortin Y., Shen S.-H., Banville D. (1999). ZRP-1, a zyxin-related protein, interacts with the second PDZ domain of the cytosolic protein tyrosine phosphatase hPTP1E. J. Biol. Chem. 274: 20679—20687. PMID 10400701 doi:10.1074/jbc.274.29.20679
Gross C., Heumann R., Erdmann K.S. (2001). The protein kinase C-related kinase PRK2 interacts with the protein tyrosine phosphatase PTP-BL via a novel PDZ domain binding motif. FEBS Lett. 496: 101—104. PMID 11356191 doi:10.1016/S0014-5793(01)02401-2
Kimber W.A., Deak M., Prescott A.R., Alessi D.R. (2003). Interaction of the protein tyrosine phosphatase PTPL1 with the PtdIns(3,4)P2-binding adaptor protein TAPP1. Biochem. J. 376: 525—535. PMID 14516276 doi:10.1042/BJ20031154

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9646 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q12923 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9646 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q12923 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]