PTPRB

PTPRB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2AHS, 2H02, 2H03, 2H04, 2HC1, 2HC2, 2I3R, 2I3U, 2I4E, 2I4G, 2I4H, 2I5X
Ідентифікатори
Символи	PTPRB, HPTP-BETA, HPTPB, PTPB, R-PTP-BETA, VEPTP, protein tyrosine phosphatase, receptor type B, protein tyrosine phosphatase receptor type B
Зовнішні ІД	OMIM: 176882 MGI: 97809 HomoloGene: 2125 GeneCards: PTPRB
Онтологія гена Молекулярна функція • protein tyrosine phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphoprotein phosphatase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • receptor complex • integral component of plasma membrane • мембрана • клітинна мембрана • specific granule membrane • tertiary granule membrane Біологічний процес • phosphate-containing compound metabolic process • GO:0016576 protein dephosphorylation • Ангіогенез • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5787	19263
Ensembl	ENSG00000127329	ENSMUSG00000020154
UniProt	P23467	B2RU80
RefSeq (мРНК)	NM_001109754 NM_001206971 NM_001206972 NM_002837 NM_001330204	NM_029928
RefSeq (білок)	NP_001103224 NP_001193900 NP_001193901 NP_001317133 NP_002828	NP_084204
Локус (UCSC)	Хр. 12: 70.52 – 70.64 Mb	Хр. 10: 116.28 – 116.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTPRB (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 997 амінокислот, а молекулярна маса — 224 301.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLSHGAGLAL		WITLSLLQTG		LAEPERCNFT		LAESKASSHS		VSIQWRILGS
PCNFSLIYSS		DTLGAALCPT		FRIDNTTYGC		NLQDLQAGTI		YNFRIISLDE
ERTVVLQTDP		LPPARFGVSK		EKTTSTSLHV		WWTPSSGKVT		SYEVQLFDEN
NQKIQGVQIQ		ESTSWNEYTF		FNLTAGSKYN		IAITAVSGGK		RSFSVYTNGS
TVPSPVKDIG		ISTKANSLLI		SWSHGSGNVE		RYRLMLMDKG		ILVHGGVVDK
HATSYAFHGL		TPGYLYNLTV		MTEAAGLQNY		RWKLVRTAPM		EVSNLKVTND
GSLTSLKVKW		QRPPGNVDSY		NITLSHKGTI		KESRVLAPWI		TETHFKELVP
GRLYQVTVSC		VSGELSAQKM		AVGRTFPDKV		ANLEANNNGR		MRSLVVSWSP
PAGDWEQYRI		LLFNDSVVLL		NITVGKEETQ		YVMDDTGLVP		GRQYEVEVIV
ESGNLKNSER		CQGRTVPLAV		LQLRVKHANE		TSLSIMWQTP		VAEWEKYIIS
LADRDLLLIH		KSLSKDAKEF		TFTDLVPGRK		YMATVTSISG		DLKNSSSVKG
RTVPAQVTDL		HVANQGMTSS		LFTNWTQAQG		DVEFYQVLLI		HENVVIKNES
ISSETSRYSF		HSLKSGSLYS		VVVTTVSGGI		SSRQVVVEGR		TVPSSVSGVT
VNNSGRNDYL		SVSWLLAPGD		VDNYEVTLSH		DGKVVQSLVI		AKSVRECSFS
SLTPGRLYTV		TITTRSGKYE		NHSFSQERTV		PDKVQGVSVS		NSARSDYLRV
SWVHATGDFD		HYEVTIKNKN		NFIQTKSIPK		SENECVFVQL		VPGRLYSVTV
TTKSGQYEAN		EQGNGRTIPE		PVKDLTLRNR		STEDLHVTWS		GANGDVDQYE
IQLLFNDMKV		FPPFHLVNTA		TEYRFTSLTP		GRQYKILVLT		ISGDVQQSAF
IEGFTVPSAV		KNIHISPNGA		TDSLTVNWTP		GGGDVDSYTV		SAFRHSQKVD
SQTIPKHVFE		HTFHRLEAGE		QYQIMIASVS		GSLKNQINVV		GRTVPASVQG
VIADNAYSSY		SLIVSWQKAA		GVAERYDILL		LTENGILLRN		TSEPATTKQH
KFEDLTPGKK		YKIQILTVSG		GLFSKEAQTE		GRTVPAAVTD		LRITENSTRH
LSFRWTASEG		ELSWYNIFLY		NPDGNLQERA		QVDPLVQSFS		FQNLLQGRMY
KMVIVTHSGE		LSNESFIFGR		TVPASVSHLR		GSNRNTTDSL		WFNWSPASGD
FDFYELILYN		PNGTKKENWK		DKDLTEWRFQ		GLVPGRKYVL		WVVTHSGDLS
NKVTAESRTA		PSPPSLMSFA		DIANTSLAIT		WKGPPDWTDY		NDFELQWLPR
DALTVFNPYN		NRKSEGRIVY		GLRPGRSYQF		NVKTVSGDSW		KTYSKPIFGS
VRTKPDKIQN		LHCRPQNSTA		IACSWIPPDS		DFDGYSIECR		KMDTQEVEFS
RKLEKEKSLL		NIMMLVPHKR		YLVSIKVQSA		GMTSEVVEDS		TITMIDRPPP
PPPHIRVNEK		DVLISKSSIN		FTVNCSWFSD		TNGAVKYFTV		VVREADGSDE
LKPEQQHPLP		SYLEYRHNAS		IRVYQTNYFA		SKCAENPNSN		SKSFNIKLGA
EMESLGGKCD		PTQQKFCDGP		LKPHTAYRIS		IRAFTQLFDE		DLKEFTKPLY
SDTFFSLPIT		TESEPLFGAI		EGVSAGLFLI		GMLVAVVALL		ICRQKVSHGR
ERPSARLSIR		RDRPLSVHLN		LGQKGNRKTS		CPIKINQFEG		HFMKLQADSN
YLLSKEYEEL		KDVGRNQSCD		IALLPENRGK		NRYNNILPYD		ATRVKLSNVD
DDPCSDYINA		SYIPGNNFRR		EYIVTQGPLP		GTKDDFWKMV		WEQNVHNIVM
VTQCVEKGRV		KCDHYWPADQ		DSLYYGDLIL		QMLSESVLPE		WTIREFKICG
EEQLDAHRLI		RHFHYTVWPD		HGVPETTQSL		IQFVRTVRDY		INRSPGAGPT
VVHCSAGVGR		TGTFIALDRI		LQQLDSKDSV		DIYGAVHDLR		LHRVHMVQTE
CQYVYLHQCV		RDVLRARKLR		SEQENPLFPI		YENVNPEYHR		DPVYSRH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ангіогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Krueger N.X., Streuli M., Saito H. (1990). Structural diversity and evolution of human receptor-like protein tyrosine phosphatases. EMBO J. 9: 3241—3252. PMID 2170109

Див. також

• Хромосома 12